MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_008526	AAG	2	6	942606	942611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494466
14503	NC_008526	GGT	2	6	942685	942690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494467
14504	NC_008526	CGG	2	6	942784	942789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494467
14505	NC_008526	TCA	2	6	942791	942796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494467
14506	NC_008526	GCC	2	6	942826	942831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494467
14507	NC_008526	T	6	6	942922	942927	0 %	100 %	0 %	0 %	116494467
14508	NC_008526	ATT	2	6	942953	942958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494467
14509	NC_008526	GGC	2	6	942980	942985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494467
14510	NC_008526	ATG	2	6	943016	943021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494467
14511	NC_008526	AAG	2	6	943194	943199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494467
14512	NC_008526	TGT	3	9	943225	943233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494467
14513	NC_008526	TGA	2	6	943275	943280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494467
14514	NC_008526	GAA	2	6	943303	943308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494467
14515	NC_008526	TGAA	2	8	943398	943405	50 %	25 %	25 %	0 %	116494467
14516	NC_008526	ATC	2	6	943473	943478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494467
14517	NC_008526	ATG	2	6	943593	943598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494467
14518	NC_008526	A	6	6	943692	943697	100 %	0 %	0 %	0 %	116494468
14519	NC_008526	ATC	2	6	943864	943869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494468
14520	NC_008526	GTT	2	6	943884	943889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494468
14521	NC_008526	AAG	2	6	943908	943913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494468
14522	NC_008526	CAA	2	6	944002	944007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494468
14523	NC_008526	ATC	2	6	944110	944115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494468
14524	NC_008526	ATG	2	6	944163	944168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494468
14525	NC_008526	GAT	2	6	944516	944521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494468
14526	NC_008526	CAA	2	6	944595	944600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494468
14527	NC_008526	AGA	2	6	944603	944608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494468
14528	NC_008526	GAAC	2	8	945021	945028	50 %	0 %	25 %	25 %	116494469
14529	NC_008526	ACAAT	2	10	945060	945069	60 %	20 %	0 %	20 %	116494469
14530	NC_008526	AGTC	2	8	945396	945403	25 %	25 %	25 %	25 %	116494469
14531	NC_008526	TGA	2	6	945408	945413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494469
14532	NC_008526	TACC	2	8	945580	945587	25 %	25 %	0 %	50 %	116494470
14533	NC_008526	CTT	2	6	945716	945721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494470
14534	NC_008526	ATCT	2	8	945747	945754	25 %	50 %	0 %	25 %	116494470
14535	NC_008526	GGT	2	6	945771	945776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494470
14536	NC_008526	TCA	2	6	945817	945822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494470
14537	NC_008526	GCTG	2	8	945878	945885	0 %	25 %	50 %	25 %	116494470
14538	NC_008526	CAG	2	6	945963	945968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494470
14539	NC_008526	GCT	2	6	945984	945989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494470
14540	NC_008526	GAA	2	6	945990	945995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494470
14541	NC_008526	AAG	2	6	946065	946070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494470
14542	NC_008526	GAT	2	6	946128	946133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494470
14543	NC_008526	CAA	2	6	946142	946147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494470
14544	NC_008526	ATT	2	6	946485	946490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494471
14545	NC_008526	TCA	2	6	946520	946525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494471
14546	NC_008526	CATATC	2	12	946582	946593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494471
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14548	NC_008526	TGCC	2	8	946719	946726	0 %	25 %	25 %	50 %	116494471
14549	NC_008526	GTAG	2	8	946900	946907	25 %	25 %	50 %	0 %	116494471
14550	NC_008526	CTG	2	6	946947	946952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494471
14551	NC_008526	GTT	2	6	947047	947052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494471
14552	NC_008526	CAA	2	6	947079	947084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494471
14553	NC_008526	TGA	2	6	947085	947090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494471
14554	NC_008526	TTTCTT	2	12	947134	947145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116494471
14555	NC_008526	CTGAT	2	10	947847	947856	20 %	40 %	20 %	20 %	116494472
14556	NC_008526	TTA	2	6	947892	947897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494472
14557	NC_008526	TTG	2	6	947996	948001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494472
14558	NC_008526	ATC	2	6	948063	948068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494472
14559	NC_008526	GAT	2	6	948095	948100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494472
14560	NC_008526	TGC	2	6	948112	948117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494472
14561	NC_008526	TGA	2	6	948181	948186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494472
14562	NC_008526	GCC	2	6	948226	948231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494472
14563	NC_008526	TGC	3	9	948382	948390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494472
14564	NC_008526	TGTA	2	8	948426	948433	25 %	50 %	25 %	0 %	116494472
14565	NC_008526	TGAT	2	8	948504	948511	25 %	50 %	25 %	0 %	116494472
14566	NC_008526	TCG	2	6	948559	948564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494472
14567	NC_008526	GTAT	2	8	948712	948719	25 %	50 %	25 %	0 %	116494472
14568	NC_008526	TGC	2	6	948727	948732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494472
14569	NC_008526	AAGT	2	8	948739	948746	50 %	25 %	25 %	0 %	116494472
14570	NC_008526	AT	3	6	948763	948768	50 %	50 %	0 %	0 %	116494472
14571	NC_008526	CGT	2	6	948938	948943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494473
14572	NC_008526	GTT	2	6	948980	948985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494473
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14574	NC_008526	CTG	2	6	949203	949208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494473
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14578	NC_008526	ACC	2	6	949418	949423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494473
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14581	NC_008526	CACAG	2	10	949520	949529	40 %	0 %	20 %	40 %	116494473
14582	NC_008526	TGC	2	6	949531	949536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494473
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14587	NC_008526	CTG	2	6	949803	949808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494473
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14589	NC_008526	CT	3	6	949899	949904	0 %	50 %	0 %	50 %	116494473
14590	NC_008526	AATT	2	8	950104	950111	50 %	50 %	0 %	0 %	116494474
14591	NC_008526	A	6	6	950136	950141	100 %	0 %	0 %	0 %	116494474
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14599	NC_008526	AAGA	2	8	950472	950479	75 %	0 %	25 %	0 %	116494474
14600	NC_008526	CTG	2	6	950608	950613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494474
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14603	NC_008526	GTG	2	6	950695	950700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494474
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14978	NC_008526	ATC	2	6	975678	975683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494493
14979	NC_008526	AAG	2	6	975687	975692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494493
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14981	NC_008526	GAA	2	6	975839	975844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494494
14982	NC_008526	GCA	3	9	975861	975869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494494
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