MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008526	TCA	2	6	882241	882246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494414
13502	NC_008526	TTGCC	2	10	882276	882285	0 %	40 %	20 %	40 %	116494414
13503	NC_008526	AGAA	2	8	882339	882346	75 %	0 %	25 %	0 %	116494414
13504	NC_008526	GTG	2	6	882492	882497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494414
13505	NC_008526	ATG	2	6	882534	882539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494414
13506	NC_008526	GTT	2	6	882564	882569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494414
13507	NC_008526	GTG	2	6	882580	882585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494414
13508	NC_008526	CATC	2	8	882598	882605	25 %	25 %	0 %	50 %	116494414
13509	NC_008526	GTT	2	6	882608	882613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494414
13510	NC_008526	CAA	2	6	882625	882630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494414
13511	NC_008526	GTTGC	2	10	882678	882687	0 %	40 %	40 %	20 %	116494414
13512	NC_008526	GAT	2	6	882890	882895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494414
13513	NC_008526	ATA	2	6	882918	882923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494414
13514	NC_008526	CGG	2	6	883275	883280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494415
13515	NC_008526	CGG	2	6	883321	883326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494415
13516	NC_008526	TCGA	2	8	883358	883365	25 %	25 %	25 %	25 %	116494415
13517	NC_008526	AT	3	6	883392	883397	50 %	50 %	0 %	0 %	116494415
13518	NC_008526	GCT	2	6	883551	883556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494415
13519	NC_008526	CGAC	2	8	883638	883645	25 %	0 %	25 %	50 %	116494415
13520	NC_008526	GCT	2	6	883815	883820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494415
13521	NC_008526	TCT	2	6	883919	883924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494415
13522	NC_008526	CAA	2	6	883945	883950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494415
13523	NC_008526	AGACCT	2	12	884007	884018	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116494415
13524	NC_008526	AAC	2	6	884051	884056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494415
13525	NC_008526	AAT	2	6	884059	884064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494415
13526	NC_008526	TCA	2	6	884095	884100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494415
13527	NC_008526	ACTT	2	8	884239	884246	25 %	50 %	0 %	25 %	116494416
13528	NC_008526	ATAAAA	2	12	884252	884263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116494416
13529	NC_008526	TAC	2	6	884348	884353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494416
13530	NC_008526	TTG	2	6	884433	884438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494416
13531	NC_008526	TAT	2	6	884489	884494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494416
13532	NC_008526	GCA	3	9	884545	884553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494416
13533	NC_008526	CAT	2	6	884624	884629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494416
13534	NC_008526	GTT	2	6	884682	884687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494416
13535	NC_008526	GTT	2	6	884779	884784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494416
13536	NC_008526	CAG	2	6	884837	884842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494416
13537	NC_008526	CTTCA	2	10	884895	884904	20 %	40 %	0 %	40 %	116494416
13538	NC_008526	CCTG	2	8	885025	885032	0 %	25 %	25 %	50 %	116494416
13539	NC_008526	TTG	2	6	885040	885045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494416
13540	NC_008526	TCA	2	6	885130	885135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494416
13541	NC_008526	AATG	2	8	885171	885178	50 %	25 %	25 %	0 %	116494416
13542	NC_008526	CCG	2	6	885238	885243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494416
13543	NC_008526	GAT	2	6	885612	885617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494417
13544	NC_008526	GCAA	2	8	885633	885640	50 %	0 %	25 %	25 %	116494417
13545	NC_008526	CAG	2	6	885670	885675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494417
13546	NC_008526	GGCG	2	8	885714	885721	0 %	0 %	75 %	25 %	116494417
13547	NC_008526	GAT	2	6	885736	885741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494417
13548	NC_008526	TGT	2	6	885812	885817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494417
13549	NC_008526	CAG	2	6	885830	885835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494417
13550	NC_008526	ATTT	2	8	885856	885863	25 %	75 %	0 %	0 %	116494417
13551	NC_008526	GAC	2	6	885897	885902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494417
13552	NC_008526	T	7	7	886038	886044	0 %	100 %	0 %	0 %	116494418
13553	NC_008526	ATG	2	6	886048	886053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494418
13554	NC_008526	GC	3	6	886168	886173	0 %	0 %	50 %	50 %	116494418
13555	NC_008526	TCT	2	6	886276	886281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494418
13556	NC_008526	TCT	2	6	886546	886551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494419
13557	NC_008526	T	7	7	886601	886607	0 %	100 %	0 %	0 %	116494419
13558	NC_008526	TGG	2	6	886621	886626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494419
13559	NC_008526	TTC	2	6	886707	886712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494419
13560	NC_008526	TGG	2	6	886745	886750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494419
13561	NC_008526	ATT	2	6	886782	886787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494419
13562	NC_008526	GCC	2	6	886794	886799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494419
13563	NC_008526	ATG	2	6	886807	886812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494419
13564	NC_008526	GCT	2	6	886822	886827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494419
13565	NC_008526	CAG	2	6	886844	886849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494419
13566	NC_008526	GCC	2	6	886860	886865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494419
13567	NC_008526	AAT	2	6	887009	887014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494419
13568	NC_008526	ACC	2	6	887041	887046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494419
13569	NC_008526	AGC	2	6	887100	887105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494419
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13571	NC_008526	ATA	2	6	887224	887229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494419
13572	NC_008526	GAT	2	6	887274	887279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494419
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13574	NC_008526	AC	3	6	887368	887373	50 %	0 %	0 %	50 %	116494419
13575	NC_008526	GTT	2	6	887421	887426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494419
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13578	NC_008526	ACG	2	6	888874	888879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494420
13579	NC_008526	CAA	2	6	889010	889015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494420
13580	NC_008526	TCA	2	6	889037	889042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494420
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13585	NC_008526	CGGG	2	8	889223	889230	0 %	0 %	75 %	25 %	116494420
13586	NC_008526	AGC	2	6	889315	889320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494420
13587	NC_008526	CCG	2	6	889422	889427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494420
13588	NC_008526	TGCT	2	8	889443	889450	0 %	50 %	25 %	25 %	116494420
13589	NC_008526	CCG	2	6	889454	889459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494420
13590	NC_008526	GCA	2	6	889836	889841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494421
13591	NC_008526	TCA	2	6	889861	889866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494421
13592	NC_008526	GAT	2	6	889887	889892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494421
13593	NC_008526	CGT	2	6	889902	889907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494421
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13596	NC_008526	TACCTT	2	12	889992	890003	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116494421
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13598	NC_008526	TGAC	2	8	890149	890156	25 %	25 %	25 %	25 %	116494421
13599	NC_008526	GCA	2	6	890187	890192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494421
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13601	NC_008526	TACG	2	8	890249	890256	25 %	25 %	25 %	25 %	116494421
13602	NC_008526	A	6	6	890541	890546	100 %	0 %	0 %	0 %	116494422
13603	NC_008526	GAT	3	9	890561	890569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494422
13604	NC_008526	ATT	2	6	890644	890649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494422
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13606	NC_008526	CAAA	2	8	890802	890809	75 %	0 %	0 %	25 %	116494422
13607	NC_008526	ACA	3	9	891039	891047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494423
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13611	NC_008526	ATT	2	6	891332	891337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494423
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13617	NC_008526	A	6	6	891610	891615	100 %	0 %	0 %	0 %	116494423
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13974	NC_008526	ATC	3	9	911754	911762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494439
13975	NC_008526	GCG	2	6	911789	911794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494439
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13977	NC_008526	GGTT	2	8	912002	912009	0 %	50 %	50 %	0 %	116494440
13978	NC_008526	GCC	2	6	912073	912078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494440
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13980	NC_008526	GAC	2	6	912178	912183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494440
13981	NC_008526	GCT	2	6	912198	912203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494440
13982	NC_008526	TTGC	2	8	912204	912211	0 %	50 %	25 %	25 %	116494440
13983	NC_008526	TAG	2	6	912229	912234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494440
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