MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_008526	CCA	2	6	805505	805510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494354
12503	NC_008526	GTC	2	6	805550	805555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494354
12504	NC_008526	CCA	2	6	805571	805576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494354
12505	NC_008526	GCC	2	6	805597	805602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494354
12506	NC_008526	TTG	2	6	805648	805653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494354
12507	NC_008526	GTC	2	6	805700	805705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494354
12508	NC_008526	T	6	6	805747	805752	0 %	100 %	0 %	0 %	116494354
12509	NC_008526	TTTG	2	8	805800	805807	0 %	75 %	25 %	0 %	116494354
12510	NC_008526	GAA	2	6	805822	805827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494354
12511	NC_008526	GCC	2	6	805915	805920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494354
12512	NC_008526	CGG	2	6	805956	805961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494354
12513	NC_008526	GTTT	2	8	805970	805977	0 %	75 %	25 %	0 %	116494354
12514	NC_008526	CAT	2	6	806130	806135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494354
12515	NC_008526	AATC	2	8	806286	806293	50 %	25 %	0 %	25 %	116494354
12516	NC_008526	ATG	2	6	806315	806320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494354
12517	NC_008526	AGA	2	6	806337	806342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494354
12518	NC_008526	TTGG	2	8	806431	806438	0 %	50 %	50 %	0 %	116494354
12519	NC_008526	TA	3	6	806595	806600	50 %	50 %	0 %	0 %	116494354
12520	NC_008526	CTG	2	6	806607	806612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494354
12521	NC_008526	TGT	2	6	806616	806621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494354
12522	NC_008526	CCG	2	6	806672	806677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494354
12523	NC_008526	TTG	2	6	806696	806701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494354
12524	NC_008526	GAT	2	6	806743	806748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494354
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12526	NC_008526	CGGC	2	8	806760	806767	0 %	0 %	50 %	50 %	116494354
12527	NC_008526	GAC	2	6	806884	806889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494354
12528	NC_008526	GGTTTC	2	12	806917	806928	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116494354
12529	NC_008526	TG	3	6	806948	806953	0 %	50 %	50 %	0 %	116494354
12530	NC_008526	TGC	2	6	806976	806981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494354
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12532	NC_008526	A	6	6	807060	807065	100 %	0 %	0 %	0 %	116494354
12533	NC_008526	AGC	2	6	807070	807075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494354
12534	NC_008526	GTT	2	6	807091	807096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494354
12535	NC_008526	CGG	3	9	807120	807128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494354
12536	NC_008526	TGT	2	6	807189	807194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494354
12537	NC_008526	ATTG	2	8	807207	807214	25 %	50 %	25 %	0 %	116494354
12538	NC_008526	TCT	2	6	807218	807223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494354
12539	NC_008526	CTG	2	6	807331	807336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494354
12540	NC_008526	TAAA	2	8	807395	807402	75 %	25 %	0 %	0 %	116494354
12541	NC_008526	GCT	2	6	807431	807436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494354
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12543	NC_008526	CAT	2	6	807649	807654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494354
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12545	NC_008526	CAT	2	6	807753	807758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494354
12546	NC_008526	TCTTCA	2	12	807770	807781	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116494354
12547	NC_008526	TTCA	2	8	807817	807824	25 %	50 %	0 %	25 %	116494354
12548	NC_008526	TCGG	2	8	807938	807945	0 %	25 %	50 %	25 %	116494354
12549	NC_008526	GCC	2	6	807979	807984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494354
12550	NC_008526	AGTA	2	8	808028	808035	50 %	25 %	25 %	0 %	116494354
12551	NC_008526	CCT	2	6	808089	808094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116494354
12552	NC_008526	TGT	2	6	808108	808113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494354
12553	NC_008526	CTT	2	6	808201	808206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494354
12554	NC_008526	GTAT	2	8	808509	808516	25 %	50 %	25 %	0 %	116494355
12555	NC_008526	TTTG	2	8	808525	808532	0 %	75 %	25 %	0 %	116494355
12556	NC_008526	TGA	2	6	808537	808542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494355
12557	NC_008526	CGC	2	6	808617	808622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494355
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12559	NC_008526	CAT	2	6	808733	808738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494355
12560	NC_008526	ATC	2	6	808776	808781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494355
12561	NC_008526	T	6	6	808783	808788	0 %	100 %	0 %	0 %	116494355
12562	NC_008526	TGC	2	6	808806	808811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494355
12563	NC_008526	TGAT	2	8	808914	808921	25 %	50 %	25 %	0 %	116494355
12564	NC_008526	T	6	6	808979	808984	0 %	100 %	0 %	0 %	116494355
12565	NC_008526	ATCAC	2	10	809127	809136	40 %	20 %	0 %	40 %	116494355
12566	NC_008526	TCAAC	2	10	809146	809155	40 %	20 %	0 %	40 %	116494355
12567	NC_008526	ACC	2	6	809238	809243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494356
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12569	NC_008526	TG	3	6	809319	809324	0 %	50 %	50 %	0 %	116494356
12570	NC_008526	GCG	2	6	809339	809344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494356
12571	NC_008526	GCT	2	6	809355	809360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494356
12572	NC_008526	ATG	2	6	809379	809384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494356
12573	NC_008526	GCA	2	6	809514	809519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494356
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12579	NC_008526	CTG	2	6	809884	809889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494356
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12587	NC_008526	GTT	2	6	810694	810699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494357
12588	NC_008526	TG	3	6	810757	810762	0 %	50 %	50 %	0 %	116494357
12589	NC_008526	TGA	2	6	810923	810928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494357
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12592	NC_008526	ATTG	2	8	811047	811054	25 %	50 %	25 %	0 %	116494357
12593	NC_008526	ATA	2	6	811086	811091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494357
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12596	NC_008526	CAAA	2	8	811214	811221	75 %	0 %	0 %	25 %	116494357
12597	NC_008526	A	6	6	811312	811317	100 %	0 %	0 %	0 %	116494357
12598	NC_008526	TTTG	2	8	811360	811367	0 %	75 %	25 %	0 %	116494357
12599	NC_008526	CTT	2	6	811445	811450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494357
12600	NC_008526	ACG	2	6	811621	811626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494358
12601	NC_008526	GTG	2	6	811640	811645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494358
12602	NC_008526	GCA	2	6	811693	811698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494358
12603	NC_008526	TGTGA	2	10	811827	811836	20 %	40 %	40 %	0 %	116494358
12604	NC_008526	TTG	2	6	811872	811877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494358
12605	NC_008526	T	7	7	811911	811917	0 %	100 %	0 %	0 %	116494358
12606	NC_008526	ACA	2	6	811924	811929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494358
12607	NC_008526	GCG	2	6	811967	811972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494358
12608	NC_008526	ATA	2	6	812019	812024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494358
12609	NC_008526	ATC	2	6	812056	812061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494358
12610	NC_008526	T	6	6	812307	812312	0 %	100 %	0 %	0 %	116494358
12611	NC_008526	CAA	2	6	812420	812425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494358
12612	NC_008526	TGGT	2	8	812602	812609	0 %	50 %	50 %	0 %	116494358
12613	NC_008526	TTG	2	6	812610	812615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494358
12614	NC_008526	ATGA	2	8	812619	812626	50 %	25 %	25 %	0 %	116494358
12615	NC_008526	CAC	2	6	812754	812759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494358
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