MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_008526	GAT	2	6	681348	681353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494227
10503	NC_008526	CTT	2	6	681354	681359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494227
10504	NC_008526	CAC	2	6	681437	681442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494227
10505	NC_008526	TCA	2	6	681499	681504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494227
10506	NC_008526	CA	3	6	681503	681508	50 %	0 %	0 %	50 %	116494227
10507	NC_008526	CGT	2	6	681524	681529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494227
10508	NC_008526	GCG	2	6	681538	681543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494227
10509	NC_008526	TCA	2	6	681667	681672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494227
10510	NC_008526	AAT	2	6	681753	681758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494227
10511	NC_008526	T	6	6	681814	681819	0 %	100 %	0 %	0 %	116494228
10512	NC_008526	TCT	2	6	681975	681980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494228
10513	NC_008526	ATG	2	6	682053	682058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494228
10514	NC_008526	CGC	2	6	682072	682077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494228
10515	NC_008526	CAA	2	6	682111	682116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494228
10516	NC_008526	CAG	2	6	682123	682128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494228
10517	NC_008526	TGA	2	6	682158	682163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494228
10518	NC_008526	AAT	2	6	682220	682225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494228
10519	NC_008526	TGA	2	6	682265	682270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494229
10520	NC_008526	TG	3	6	682273	682278	0 %	50 %	50 %	0 %	116494229
10521	NC_008526	ATC	2	6	682299	682304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494229
10522	NC_008526	TCTG	2	8	682336	682343	0 %	50 %	25 %	25 %	116494229
10523	NC_008526	CTT	2	6	682448	682453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494229
10524	NC_008526	GTG	3	9	682513	682521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494229
10525	NC_008526	CG	3	6	682614	682619	0 %	0 %	50 %	50 %	116494229
10526	NC_008526	TGA	2	6	682655	682660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494229
10527	NC_008526	T	6	6	682674	682679	0 %	100 %	0 %	0 %	116494229
10528	NC_008526	TCGT	2	8	682699	682706	0 %	50 %	25 %	25 %	116494229
10529	NC_008526	TTG	2	6	682757	682762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494229
10530	NC_008526	TTCA	2	8	682779	682786	25 %	50 %	0 %	25 %	116494229
10531	NC_008526	ATCG	2	8	682792	682799	25 %	25 %	25 %	25 %	116494229
10532	NC_008526	TCAG	2	8	682819	682826	25 %	25 %	25 %	25 %	116494229
10533	NC_008526	GCC	2	6	682851	682856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494229
10534	NC_008526	TGT	2	6	683498	683503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494230
10535	NC_008526	GGC	2	6	683537	683542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494230
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10537	NC_008526	TTG	2	6	683684	683689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494230
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10539	NC_008526	GTCTT	2	10	683768	683777	0 %	60 %	20 %	20 %	116494230
10540	NC_008526	GTTT	2	8	683804	683811	0 %	75 %	25 %	0 %	116494230
10541	NC_008526	TGC	2	6	683828	683833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494230
10542	NC_008526	TCT	2	6	683876	683881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494230
10543	NC_008526	GGC	2	6	684000	684005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494230
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10545	NC_008526	AGC	2	6	684050	684055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494230
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10547	NC_008526	A	6	6	684184	684189	100 %	0 %	0 %	0 %	116494231
10548	NC_008526	TGATTT	2	12	684195	684206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116494231
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10551	NC_008526	GCT	2	6	684319	684324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494231
10552	NC_008526	CGG	2	6	684407	684412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494231
10553	NC_008526	CTA	2	6	684446	684451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494231
10554	NC_008526	TGTT	2	8	684455	684462	0 %	75 %	25 %	0 %	116494231
10555	NC_008526	TGC	2	6	684521	684526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494231
10556	NC_008526	TTTA	2	8	684624	684631	25 %	75 %	0 %	0 %	116494231
10557	NC_008526	T	6	6	684663	684668	0 %	100 %	0 %	0 %	116494231
10558	NC_008526	GCT	2	6	684670	684675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494231
10559	NC_008526	TGG	2	6	684714	684719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494231
10560	NC_008526	GAT	2	6	684739	684744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494231
10561	NC_008526	GCA	2	6	684748	684753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494231
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10568	NC_008526	GAT	2	6	685198	685203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494231
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10572	NC_008526	ATGCAG	2	12	685309	685320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116494232
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10577	NC_008526	GCTA	2	8	685610	685617	25 %	25 %	25 %	25 %	116494232
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10587	NC_008526	ACG	2	6	686289	686294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494232
10588	NC_008526	CAAG	2	8	686318	686325	50 %	0 %	25 %	25 %	116494232
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10599	NC_008526	CATCCG	2	12	686835	686846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116494232
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10601	NC_008526	AGGCA	2	10	686998	687007	40 %	0 %	40 %	20 %	116494232
10602	NC_008526	ACA	2	6	687077	687082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494232
10603	NC_008526	GGC	2	6	687104	687109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494232
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10606	NC_008526	GTCG	2	8	687320	687327	0 %	25 %	50 %	25 %	116494232
10607	NC_008526	AGG	2	6	687382	687387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494232
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10611	NC_008526	GAAC	2	8	687593	687600	50 %	0 %	25 %	25 %	116494232
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10619	NC_008526	CTG	2	6	687781	687786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494232
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