MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008526	CGG	2	6	649901	649906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494199
10002	NC_008526	GGT	2	6	649907	649912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494199
10003	NC_008526	GAGC	2	8	649913	649920	25 %	0 %	50 %	25 %	116494199
10004	NC_008526	TCA	2	6	650229	650234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494199
10005	NC_008526	CAA	2	6	650620	650625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494200
10006	NC_008526	CAT	2	6	650666	650671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494200
10007	NC_008526	CCA	2	6	650685	650690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494200
10008	NC_008526	TCG	2	6	650703	650708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494200
10009	NC_008526	GCA	2	6	650743	650748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494200
10010	NC_008526	CCG	2	6	650772	650777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494200
10011	NC_008526	TTC	2	6	650784	650789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494200
10012	NC_008526	T	6	6	650817	650822	0 %	100 %	0 %	0 %	116494200
10013	NC_008526	TGT	2	6	650828	650833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494200
10014	NC_008526	T	6	6	650864	650869	0 %	100 %	0 %	0 %	116494200
10015	NC_008526	GGT	2	6	650885	650890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494200
10016	NC_008526	TGG	2	6	651116	651121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494201
10017	NC_008526	GCC	2	6	651232	651237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494201
10018	NC_008526	ATGA	2	8	651250	651257	50 %	25 %	25 %	0 %	116494201
10019	NC_008526	GAG	2	6	651274	651279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494201
10020	NC_008526	TGA	2	6	651287	651292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494201
10021	NC_008526	CAT	3	9	651333	651341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494201
10022	NC_008526	CAC	2	6	651342	651347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494201
10023	NC_008526	GGC	2	6	651361	651366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494201
10024	NC_008526	ACG	2	6	651374	651379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494201
10025	NC_008526	CGG	2	6	651381	651386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494201
10026	NC_008526	GGC	2	6	651468	651473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494201
10027	NC_008526	GGC	2	6	651475	651480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494201
10028	NC_008526	AC	3	6	651669	651674	50 %	0 %	0 %	50 %	116494201
10029	NC_008526	TGG	2	6	651714	651719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494201
10030	NC_008526	GC	3	6	651721	651726	0 %	0 %	50 %	50 %	116494201
10031	NC_008526	ACG	2	6	651728	651733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494201
10032	NC_008526	CAT	2	6	651792	651797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494201
10033	NC_008526	ATT	2	6	651850	651855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494201
10034	NC_008526	ATCA	2	8	651925	651932	50 %	25 %	0 %	25 %	116494201
10035	NC_008526	TCA	2	6	652265	652270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494202
10036	NC_008526	TGAC	2	8	652277	652284	25 %	25 %	25 %	25 %	116494202
10037	NC_008526	TCA	2	6	652319	652324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494202
10038	NC_008526	T	6	6	652359	652364	0 %	100 %	0 %	0 %	116494202
10039	NC_008526	CAG	3	9	652365	652373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494202
10040	NC_008526	AGC	2	6	652478	652483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494202
10041	NC_008526	AAGCC	2	10	652500	652509	40 %	0 %	20 %	40 %	116494202
10042	NC_008526	AC	3	6	652548	652553	50 %	0 %	0 %	50 %	116494202
10043	NC_008526	ATC	2	6	652612	652617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494202
10044	NC_008526	ATGC	2	8	652682	652689	25 %	25 %	25 %	25 %	116494202
10045	NC_008526	CA	3	6	652740	652745	50 %	0 %	0 %	50 %	116494202
10046	NC_008526	CGG	2	6	652824	652829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494202
10047	NC_008526	TGC	2	6	652849	652854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494202
10048	NC_008526	CGC	2	6	652861	652866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494202
10049	NC_008526	GCG	2	6	652978	652983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494202
10050	NC_008526	GCC	2	6	653041	653046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494202
10051	NC_008526	TAA	2	6	653114	653119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494202
10052	NC_008526	ACAA	2	8	653189	653196	75 %	0 %	0 %	25 %	116494202
10053	NC_008526	TGA	2	6	653205	653210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494202
10054	NC_008526	CAT	2	6	653218	653223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494202
10055	NC_008526	AC	3	6	653238	653243	50 %	0 %	0 %	50 %	116494202
10056	NC_008526	ATG	2	6	653299	653304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494202
10057	NC_008526	CCA	2	6	653441	653446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494202
10058	NC_008526	A	6	6	653450	653455	100 %	0 %	0 %	0 %	116494202
10059	NC_008526	AAT	2	6	653494	653499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494202
10060	NC_008526	GAA	2	6	653978	653983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494203
10061	NC_008526	CGTTTT	2	12	654100	654111	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116494203
10062	NC_008526	GCC	2	6	654161	654166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494203
10063	NC_008526	CTT	2	6	654206	654211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494203
10064	NC_008526	CTT	2	6	654239	654244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494203
10065	NC_008526	GTC	2	6	654273	654278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494203
10066	NC_008526	ATG	2	6	654489	654494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494203
10067	NC_008526	GCGA	2	8	654538	654545	25 %	0 %	50 %	25 %	116494203
10068	NC_008526	GAA	2	6	654551	654556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494203
10069	NC_008526	TCC	2	6	654612	654617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116494203
10070	NC_008526	TGC	2	6	654635	654640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494203
10071	NC_008526	CGG	2	6	654772	654777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494203
10072	NC_008526	AAT	2	6	654812	654817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494203
10073	NC_008526	TGG	3	9	655044	655052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494204
10074	NC_008526	CA	3	6	655117	655122	50 %	0 %	0 %	50 %	116494204
10075	NC_008526	T	7	7	655174	655180	0 %	100 %	0 %	0 %	116494204
10076	NC_008526	GCC	2	6	655310	655315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494204
10077	NC_008526	GAC	2	6	655324	655329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494204
10078	NC_008526	CAT	2	6	655418	655423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494204
10079	NC_008526	GCTG	2	8	655431	655438	0 %	25 %	50 %	25 %	116494204
10080	NC_008526	CGA	2	6	655564	655569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494204
10081	NC_008526	GCG	2	6	655615	655620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494204
10082	NC_008526	CTG	2	6	655622	655627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494204
10083	NC_008526	ATT	2	6	655652	655657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494204
10084	NC_008526	TCA	2	6	655813	655818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494205
10085	NC_008526	AAT	2	6	655874	655879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494205
10086	NC_008526	ATC	2	6	655887	655892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494205
10087	NC_008526	TCA	2	6	655937	655942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494205
10088	NC_008526	T	6	6	655945	655950	0 %	100 %	0 %	0 %	116494205
10089	NC_008526	ATT	3	9	655953	655961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494205
10090	NC_008526	TTG	2	6	656026	656031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494205
10091	NC_008526	ATG	2	6	656080	656085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494205
10092	NC_008526	TGT	2	6	656145	656150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494205
10093	NC_008526	TTG	2	6	656203	656208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494205
10094	NC_008526	GTT	2	6	656226	656231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494205
10095	NC_008526	GCG	2	6	656315	656320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494205
10096	NC_008526	CAG	2	6	656328	656333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494205
10097	NC_008526	GT	3	6	656338	656343	0 %	50 %	50 %	0 %	116494205
10098	NC_008526	TGC	2	6	656344	656349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494205
10099	NC_008526	CCG	2	6	656362	656367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494205
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10101	NC_008526	GTC	2	6	656392	656397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494205
10102	NC_008526	CCG	2	6	656403	656408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494205
10103	NC_008526	CGCC	2	8	656412	656419	0 %	0 %	25 %	75 %	116494205
10104	NC_008526	GCA	2	6	656441	656446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494205
10105	NC_008526	AGC	2	6	656452	656457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494205
10106	NC_008526	TGA	2	6	656483	656488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494205
10107	NC_008526	ATT	2	6	656897	656902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494206
10108	NC_008526	ATC	2	6	656939	656944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494206
10109	NC_008526	TGA	2	6	657045	657050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
10110	NC_008526	TGA	2	6	657087	657092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
10111	NC_008526	TTGC	2	8	657296	657303	0 %	50 %	25 %	25 %	116494206
10112	NC_008526	GTT	2	6	657310	657315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494206
10113	NC_008526	CTG	2	6	657332	657337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494206
10114	NC_008526	CGA	2	6	657340	657345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494206
10115	NC_008526	ACCA	2	8	657346	657353	50 %	0 %	0 %	50 %	116494206
10116	NC_008526	AC	3	6	657409	657414	50 %	0 %	0 %	50 %	116494206
10117	NC_008526	TC	3	6	657426	657431	0 %	50 %	0 %	50 %	116494206
10118	NC_008526	ATG	2	6	657464	657469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494206
10119	NC_008526	TG	3	6	657468	657473	0 %	50 %	50 %	0 %	116494206
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10353	NC_008526	GAATAC	2	12	672514	672525	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116494216
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10475	NC_008526	CAG	2	6	679983	679988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494225
10476	NC_008526	ATGG	2	8	680057	680064	25 %	25 %	50 %	0 %	116494225
10477	NC_008526	GTCC	2	8	680221	680228	0 %	25 %	25 %	50 %	116494226
10478	NC_008526	CGAT	2	8	680264	680271	25 %	25 %	25 %	25 %	116494226
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10493	NC_008526	TCA	2	6	681062	681067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494226
10494	NC_008526	GCT	2	6	681083	681088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494226
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