MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_008526	AGCA	2	8	549727	549734	50 %	0 %	25 %	25 %	116494114
8502	NC_008526	ATC	3	9	549779	549787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494114
8503	NC_008526	GAA	2	6	549790	549795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494114
8504	NC_008526	ATA	2	6	549802	549807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494114
8505	NC_008526	GTA	2	6	549862	549867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494114
8506	NC_008526	TG	3	6	549917	549922	0 %	50 %	50 %	0 %	116494114
8507	NC_008526	ACAG	2	8	550064	550071	50 %	0 %	25 %	25 %	116494114
8508	NC_008526	TTGA	2	8	550099	550106	25 %	50 %	25 %	0 %	116494114
8509	NC_008526	AGA	2	6	550118	550123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494114
8510	NC_008526	GTT	2	6	550190	550195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494114
8511	NC_008526	CTTG	2	8	550235	550242	0 %	50 %	25 %	25 %	116494114
8512	NC_008526	TGT	2	6	550250	550255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494114
8513	NC_008526	TTGAT	2	10	550439	550448	20 %	60 %	20 %	0 %	116494114
8514	NC_008526	TGT	2	6	550454	550459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494114
8515	NC_008526	CGC	2	6	550471	550476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494114
8516	NC_008526	GCT	2	6	550559	550564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494114
8517	NC_008526	GTT	2	6	550577	550582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494114
8518	NC_008526	TGGT	2	8	550619	550626	0 %	50 %	50 %	0 %	116494114
8519	NC_008526	TGA	2	6	550651	550656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494114
8520	NC_008526	CGG	2	6	550698	550703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494114
8521	NC_008526	CGT	2	6	550714	550719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494114
8522	NC_008526	CTT	2	6	550741	550746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494114
8523	NC_008526	GAT	2	6	550761	550766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494114
8524	NC_008526	CAAT	2	8	550781	550788	50 %	25 %	0 %	25 %	116494114
8525	NC_008526	ACG	2	6	550822	550827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494114
8526	NC_008526	TGA	2	6	550887	550892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494114
8527	NC_008526	GTC	2	6	550978	550983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494114
8528	NC_008526	ATAA	2	8	551067	551074	75 %	25 %	0 %	0 %	116494114
8529	NC_008526	CGC	2	6	551085	551090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494114
8530	NC_008526	CTT	2	6	551483	551488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494115
8531	NC_008526	GTCA	2	8	551489	551496	25 %	25 %	25 %	25 %	116494115
8532	NC_008526	GAT	2	6	551546	551551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494115
8533	NC_008526	GGTT	2	8	551572	551579	0 %	50 %	50 %	0 %	116494115
8534	NC_008526	AGC	2	6	551593	551598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494115
8535	NC_008526	TGT	2	6	551659	551664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494115
8536	NC_008526	CGG	2	6	551680	551685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494115
8537	NC_008526	GAC	2	6	551869	551874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494115
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8539	NC_008526	TGACGA	2	12	551890	551901	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116494115
8540	NC_008526	TGA	2	6	551944	551949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494116
8541	NC_008526	GATG	2	8	551998	552005	25 %	25 %	50 %	0 %	116494116
8542	NC_008526	ATT	2	6	552008	552013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494116
8543	NC_008526	GAAG	2	8	552049	552056	50 %	0 %	50 %	0 %	116494116
8544	NC_008526	AAG	2	6	552077	552082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494116
8545	NC_008526	TCA	2	6	552156	552161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494116
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8548	NC_008526	GCTT	2	8	552501	552508	0 %	50 %	25 %	25 %	116494117
8549	NC_008526	TTGG	2	8	552567	552574	0 %	50 %	50 %	0 %	116494117
8550	NC_008526	ATT	2	6	552591	552596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494117
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8553	NC_008526	TGC	2	6	552770	552775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494117
8554	NC_008526	TAC	2	6	552828	552833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494117
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8557	NC_008526	TGGC	2	8	552923	552930	0 %	25 %	50 %	25 %	116494117
8558	NC_008526	CAA	2	6	552964	552969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494117
8559	NC_008526	TAC	2	6	552981	552986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494117
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8607	NC_008526	CAGA	2	8	555031	555038	50 %	0 %	25 %	25 %	116494120
8608	NC_008526	TGA	2	6	555039	555044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494120
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8618	NC_008526	GGGA	2	8	555526	555533	25 %	0 %	75 %	0 %	116494120
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