MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_008526	GCT	2	6	487829	487834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494029
7502	NC_008526	AAC	2	6	488455	488460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494030
7503	NC_008526	CAA	2	6	488522	488527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494030
7504	NC_008526	CGT	2	6	488549	488554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494030
7505	NC_008526	TTG	2	6	488605	488610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494030
7506	NC_008526	TAT	2	6	488691	488696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494030
7507	NC_008526	GCT	2	6	488697	488702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494030
7508	NC_008526	GTT	2	6	488715	488720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494030
7509	NC_008526	GTT	2	6	488774	488779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494030
7510	NC_008526	CTT	2	6	488846	488851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494030
7511	NC_008526	GTC	2	6	488867	488872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494030
7512	NC_008526	CAC	2	6	489053	489058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494030
7513	NC_008526	A	6	6	489094	489099	100 %	0 %	0 %	0 %	116494030
7514	NC_008526	GGCATG	2	12	489204	489215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116494030
7515	NC_008526	TTA	2	6	489290	489295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494030
7516	NC_008526	TGC	2	6	489391	489396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494030
7517	NC_008526	AAG	2	6	489426	489431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494030
7518	NC_008526	A	6	6	489447	489452	100 %	0 %	0 %	0 %	116494030
7519	NC_008526	GTT	2	6	489554	489559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494030
7520	NC_008526	TAT	2	6	489612	489617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494030
7521	NC_008526	TAA	2	6	489623	489628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494030
7522	NC_008526	TGTT	2	8	489658	489665	0 %	75 %	25 %	0 %	116494030
7523	NC_008526	AAAC	2	8	489668	489675	75 %	0 %	0 %	25 %	116494030
7524	NC_008526	ATT	2	6	489687	489692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494030
7525	NC_008526	TTG	2	6	489729	489734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494030
7526	NC_008526	TGG	2	6	489777	489782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494030
7527	NC_008526	CAT	2	6	489800	489805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494030
7528	NC_008526	T	6	6	490004	490009	0 %	100 %	0 %	0 %	116494031
7529	NC_008526	GCA	2	6	490013	490018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494031
7530	NC_008526	TGA	2	6	490025	490030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494031
7531	NC_008526	GGCA	2	8	490107	490114	25 %	0 %	50 %	25 %	116494031
7532	NC_008526	TGA	2	6	490242	490247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494031
7533	NC_008526	GAG	2	6	490263	490268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494031
7534	NC_008526	ATAAGT	2	12	490296	490307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116494031
7535	NC_008526	TGC	2	6	490320	490325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494031
7536	NC_008526	TGC	2	6	490339	490344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494031
7537	NC_008526	GCG	2	6	490355	490360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494031
7538	NC_008526	CGG	2	6	490389	490394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494031
7539	NC_008526	TTTG	2	8	490480	490487	0 %	75 %	25 %	0 %	116494031
7540	NC_008526	ATG	2	6	490693	490698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494032
7541	NC_008526	GGC	2	6	490726	490731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494032
7542	NC_008526	A	6	6	490767	490772	100 %	0 %	0 %	0 %	116494032
7543	NC_008526	AAG	2	6	490825	490830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494032
7544	NC_008526	AC	3	6	490908	490913	50 %	0 %	0 %	50 %	116494032
7545	NC_008526	TG	3	6	490914	490919	0 %	50 %	50 %	0 %	116494032
7546	NC_008526	GCC	2	6	490924	490929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494032
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7549	NC_008526	GAT	2	6	491043	491048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494032
7550	NC_008526	ACG	2	6	491063	491068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494032
7551	NC_008526	TCT	2	6	491102	491107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494032
7552	NC_008526	AGCAAA	2	12	491124	491135	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116494032
7553	NC_008526	AAT	2	6	491164	491169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494032
7554	NC_008526	TCGT	2	8	491189	491196	0 %	50 %	25 %	25 %	116494032
7555	NC_008526	TTG	2	6	491215	491220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494032
7556	NC_008526	GGC	2	6	491281	491286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494032
7557	NC_008526	GTT	2	6	491308	491313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494032
7558	NC_008526	AAC	2	6	491401	491406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494032
7559	NC_008526	AACA	2	8	491422	491429	75 %	0 %	0 %	25 %	116494032
7560	NC_008526	GGCTG	2	10	491475	491484	0 %	20 %	60 %	20 %	116494032
7561	NC_008526	GCA	2	6	491504	491509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494032
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7563	NC_008526	TATCA	2	10	491906	491915	40 %	40 %	0 %	20 %	116494033
7564	NC_008526	GAA	2	6	491951	491956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494033
7565	NC_008526	AAG	2	6	492074	492079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494033
7566	NC_008526	TCA	2	6	492120	492125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494033
7567	NC_008526	GAA	2	6	492166	492171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494033
7568	NC_008526	TGA	2	6	492210	492215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494033
7569	NC_008526	TGT	2	6	492216	492221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494033
7570	NC_008526	TGA	2	6	492307	492312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494033
7571	NC_008526	GAT	2	6	492418	492423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494033
7572	NC_008526	GGC	2	6	492544	492549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494033
7573	NC_008526	AC	3	6	492581	492586	50 %	0 %	0 %	50 %	116494033
7574	NC_008526	GTTGTC	2	12	492636	492647	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116494034
7575	NC_008526	AAGA	2	8	492729	492736	75 %	0 %	25 %	0 %	116494034
7576	NC_008526	CAG	2	6	492748	492753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494034
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7581	NC_008526	TGA	2	6	493331	493336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494034
7582	NC_008526	CAT	2	6	493361	493366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494034
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7590	NC_008526	TGG	2	6	493937	493942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494035
7591	NC_008526	CGC	2	6	493943	493948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494035
7592	NC_008526	GCG	2	6	493968	493973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494035
7593	NC_008526	GCA	2	6	494061	494066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494035
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7599	NC_008526	TTGA	2	8	494262	494269	25 %	50 %	25 %	0 %	116494035
7600	NC_008526	GAA	2	6	494391	494396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494035
7601	NC_008526	T	6	6	494480	494485	0 %	100 %	0 %	0 %	116494036
7602	NC_008526	GCACTG	2	12	494493	494504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116494036
7603	NC_008526	CAA	2	6	494586	494591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494036
7604	NC_008526	GCG	2	6	494637	494642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494036
7605	NC_008526	GCCGG	2	10	494676	494685	0 %	0 %	60 %	40 %	116494036
7606	NC_008526	TCT	2	6	494743	494748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494036
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7608	NC_008526	GGC	2	6	494780	494785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494036
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7612	NC_008526	GCG	2	6	494952	494957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494036
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7614	NC_008526	GCG	2	6	494992	494997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494036
7615	NC_008526	GCTG	2	8	495002	495009	0 %	25 %	50 %	25 %	116494036
7616	NC_008526	TGCCAT	2	12	495014	495025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116494036
7617	NC_008526	A	6	6	495085	495090	100 %	0 %	0 %	0 %	116494036
7618	NC_008526	GGC	2	6	495113	495118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494036
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7620	NC_008526	TGGTT	2	10	495154	495163	0 %	60 %	40 %	0 %	116494036
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7986	NC_008526	ATA	2	6	516766	516771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494073
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