MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008526	TGG	2	6	455258	455263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494013
7002	NC_008526	TGA	2	6	455296	455301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494013
7003	NC_008526	AACCA	2	10	455319	455328	60 %	0 %	0 %	40 %	116494013
7004	NC_008526	CGAA	2	8	455336	455343	50 %	0 %	25 %	25 %	116494013
7005	NC_008526	AGA	3	9	455402	455410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494013
7006	NC_008526	TAAAA	2	10	455424	455433	80 %	20 %	0 %	0 %	116494013
7007	NC_008526	CCAA	2	8	455519	455526	50 %	0 %	0 %	50 %	116494014
7008	NC_008526	ATT	2	6	455542	455547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494014
7009	NC_008526	AAC	2	6	456062	456067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494015
7010	NC_008526	GTT	2	6	456141	456146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494015
7011	NC_008526	CAA	2	6	456267	456272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494015
7012	NC_008526	CAT	2	6	456319	456324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494015
7013	NC_008526	CAAA	2	8	456325	456332	75 %	0 %	0 %	25 %	116494015
7014	NC_008526	GGA	2	6	456370	456375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494015
7015	NC_008526	A	6	6	456403	456408	100 %	0 %	0 %	0 %	116494015
7016	NC_008526	ATCA	2	8	456422	456429	50 %	25 %	0 %	25 %	116494015
7017	NC_008526	ATA	2	6	456468	456473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494015
7018	NC_008526	GGA	2	6	456532	456537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494015
7019	NC_008526	TCA	2	6	456544	456549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494015
7020	NC_008526	GATC	2	8	456557	456564	25 %	25 %	25 %	25 %	116494015
7021	NC_008526	CA	3	6	456571	456576	50 %	0 %	0 %	50 %	116494015
7022	NC_008526	AGA	2	6	456622	456627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494015
7023	NC_008526	ATT	2	6	456654	456659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494015
7024	NC_008526	ATG	2	6	456677	456682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494015
7025	NC_008526	ACG	2	6	456714	456719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494015
7026	NC_008526	ATG	2	6	456765	456770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494015
7027	NC_008526	ATT	2	6	456788	456793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494015
7028	NC_008526	TAAA	2	8	456825	456832	75 %	25 %	0 %	0 %	116494015
7029	NC_008526	TGT	2	6	456855	456860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494015
7030	NC_008526	ACA	2	6	456924	456929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494015
7031	NC_008526	GCGA	2	8	456934	456941	25 %	0 %	50 %	25 %	116494015
7032	NC_008526	ATT	2	6	456949	456954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494015
7033	NC_008526	ATT	2	6	456996	457001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494015
7034	NC_008526	CAA	2	6	457027	457032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494015
7035	NC_008526	ATT	2	6	457033	457038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494015
7036	NC_008526	TTG	2	6	457151	457156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494015
7037	NC_008526	AT	3	6	457186	457191	50 %	50 %	0 %	0 %	116494015
7038	NC_008526	A	6	6	457239	457244	100 %	0 %	0 %	0 %	116494015
7039	NC_008526	T	6	6	457257	457262	0 %	100 %	0 %	0 %	116494015
7040	NC_008526	TGT	2	6	457333	457338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494015
7041	NC_008526	GCT	2	6	457384	457389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494015
7042	NC_008526	CAT	2	6	457474	457479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494015
7043	NC_008526	TCG	2	6	457498	457503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494015
7044	NC_008526	T	6	6	457519	457524	0 %	100 %	0 %	0 %	116494015
7045	NC_008526	TTC	2	6	457559	457564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494015
7046	NC_008526	TG	3	6	457611	457616	0 %	50 %	50 %	0 %	116494015
7047	NC_008526	GAA	2	6	457676	457681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494015
7048	NC_008526	GTC	2	6	457943	457948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494015
7049	NC_008526	AAAC	2	8	457950	457957	75 %	0 %	0 %	25 %	116494015
7050	NC_008526	TTG	2	6	458179	458184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494016
7051	NC_008526	TTG	2	6	458227	458232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494016
7052	NC_008526	T	6	6	458290	458295	0 %	100 %	0 %	0 %	116494016
7053	NC_008526	CTT	2	6	458298	458303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494016
7054	NC_008526	TAA	2	6	458313	458318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494016
7055	NC_008526	CGGT	2	8	458373	458380	0 %	25 %	50 %	25 %	116494016
7056	NC_008526	ATG	2	6	458422	458427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494016
7057	NC_008526	ATA	2	6	458526	458531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494016
7058	NC_008526	TTC	2	6	458611	458616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494016
7059	NC_008526	TCA	2	6	458670	458675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494016
7060	NC_008526	TGA	2	6	458993	458998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494017
7061	NC_008526	CAGTT	2	10	459027	459036	20 %	40 %	20 %	20 %	116494017
7062	NC_008526	ACA	2	6	459120	459125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494017
7063	NC_008526	AATC	2	8	459132	459139	50 %	25 %	0 %	25 %	116494017
7064	NC_008526	ACAAT	2	10	459173	459182	60 %	20 %	0 %	20 %	116494017
7065	NC_008526	AAT	2	6	459238	459243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494017
7066	NC_008526	ACG	2	6	459296	459301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494017
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7069	NC_008526	GGC	2	6	459400	459405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494017
7070	NC_008526	GGC	2	6	459529	459534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494017
7071	NC_008526	CAA	2	6	459598	459603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494017
7072	NC_008526	TGG	2	6	459636	459641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494017
7073	NC_008526	GAT	3	9	459711	459719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494017
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7079	NC_008526	CGA	2	6	459969	459974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494017
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7082	NC_008526	GCAA	2	8	460214	460221	50 %	0 %	25 %	25 %	116494017
7083	NC_008526	CGA	2	6	460250	460255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494017
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7086	NC_008526	TTG	2	6	460393	460398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494017
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7088	NC_008526	CAAT	2	8	460497	460504	50 %	25 %	0 %	25 %	116494017
7089	NC_008526	A	6	6	460591	460596	100 %	0 %	0 %	0 %	116494017
7090	NC_008526	AGCT	2	8	460611	460618	25 %	25 %	25 %	25 %	116494017
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7093	NC_008526	CAG	2	6	460811	460816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494017
7094	NC_008526	TTAAC	2	10	460838	460847	40 %	40 %	0 %	20 %	116494017
7095	NC_008526	CAG	2	6	460870	460875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494017
7096	NC_008526	GCA	2	6	460951	460956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494017
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7098	NC_008526	TTA	2	6	461060	461065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494017
7099	NC_008526	CAG	2	6	461071	461076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494017
7100	NC_008526	GAT	2	6	461104	461109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494017
7101	NC_008526	CTGACG	2	12	461140	461151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116494017
7102	NC_008526	ATG	2	6	461156	461161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494017
7103	NC_008526	CCAT	2	8	461170	461177	25 %	25 %	0 %	50 %	116494017
7104	NC_008526	TCA	2	6	461189	461194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494017
7105	NC_008526	CAT	2	6	461273	461278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494017
7106	NC_008526	AATT	2	8	461312	461319	50 %	50 %	0 %	0 %	116494017
7107	NC_008526	AGC	2	6	461491	461496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494017
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7109	NC_008526	CAGCG	2	10	461595	461604	20 %	0 %	40 %	40 %	116494017
7110	NC_008526	TTA	2	6	461611	461616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494017
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7120	NC_008526	TGG	2	6	463905	463910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494018
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7122	NC_008526	A	7	7	463986	463992	100 %	0 %	0 %	0 %	116494018
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