MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008526	CAT	2	6	423956	423961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493980
6502	NC_008526	GAT	2	6	424019	424024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493980
6503	NC_008526	TGT	2	6	424068	424073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493980
6504	NC_008526	TCT	2	6	424092	424097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493980
6505	NC_008526	GAT	2	6	424222	424227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493980
6506	NC_008526	CAT	2	6	424270	424275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493980
6507	NC_008526	CCT	2	6	424413	424418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116493981
6508	NC_008526	GCGTCA	2	12	424442	424453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116493981
6509	NC_008526	TTTG	2	8	424471	424478	0 %	75 %	25 %	0 %	116493981
6510	NC_008526	GCC	2	6	424495	424500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493981
6511	NC_008526	TTC	2	6	424538	424543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493981
6512	NC_008526	TTCCG	2	10	424720	424729	0 %	40 %	20 %	40 %	116493982
6513	NC_008526	CAG	2	6	424755	424760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493982
6514	NC_008526	CGA	2	6	424769	424774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493982
6515	NC_008526	CTGA	2	8	424868	424875	25 %	25 %	25 %	25 %	116493982
6516	NC_008526	TTC	2	6	424884	424889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493982
6517	NC_008526	TGAA	2	8	424908	424915	50 %	25 %	25 %	0 %	116493982
6518	NC_008526	TCA	2	6	425059	425064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493982
6519	NC_008526	TAA	2	6	425071	425076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493982
6520	NC_008526	TGC	2	6	425143	425148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493982
6521	NC_008526	ACTT	2	8	425287	425294	25 %	50 %	0 %	25 %	116493983
6522	NC_008526	TGC	2	6	425355	425360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493983
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6524	NC_008526	CAT	2	6	425390	425395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493983
6525	NC_008526	CTT	2	6	425420	425425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493983
6526	NC_008526	CAA	2	6	425734	425739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493984
6527	NC_008526	GCG	2	6	425753	425758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493984
6528	NC_008526	CAAC	2	8	425838	425845	50 %	0 %	0 %	50 %	116493984
6529	NC_008526	GGC	2	6	425854	425859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493984
6530	NC_008526	GCT	2	6	425891	425896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493984
6531	NC_008526	TTGGC	2	10	425933	425942	0 %	40 %	40 %	20 %	116493984
6532	NC_008526	GCA	2	6	425966	425971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493984
6533	NC_008526	CGA	2	6	425973	425978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493984
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6536	NC_008526	TGT	2	6	426168	426173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493984
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6538	NC_008526	AGGT	2	8	426327	426334	25 %	25 %	50 %	0 %	116493985
6539	NC_008526	GCCA	2	8	426377	426384	25 %	0 %	25 %	50 %	116493985
6540	NC_008526	TTCA	2	8	426449	426456	25 %	50 %	0 %	25 %	116493985
6541	NC_008526	CCG	2	6	426553	426558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493985
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6544	NC_008526	CTT	2	6	426761	426766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493985
6545	NC_008526	CAG	2	6	426793	426798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493985
6546	NC_008526	T	6	6	426811	426816	0 %	100 %	0 %	0 %	116493985
6547	NC_008526	TCA	2	6	426885	426890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493985
6548	NC_008526	TCA	2	6	426952	426957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493985
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6551	NC_008526	AGC	2	6	427019	427024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493985
6552	NC_008526	GCA	2	6	427071	427076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493985
6553	NC_008526	CCA	2	6	427131	427136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493985
6554	NC_008526	CTT	2	6	427151	427156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493985
6555	NC_008526	TGT	2	6	427158	427163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493985
6556	NC_008526	CAT	2	6	427174	427179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493985
6557	NC_008526	GAC	2	6	427184	427189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493985
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6560	NC_008526	GGTG	2	8	427413	427420	0 %	25 %	75 %	0 %	116493986
6561	NC_008526	TGC	2	6	427455	427460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493986
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6563	NC_008526	GAT	2	6	427987	427992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493987
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6982	NC_008526	TCA	2	6	454265	454270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494012
6983	NC_008526	TCT	2	6	454330	454335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494013
6984	NC_008526	GGA	2	6	454337	454342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494013
6985	NC_008526	GTAC	2	8	454403	454410	25 %	25 %	25 %	25 %	116494013
6986	NC_008526	GAT	2	6	454413	454418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494013
6987	NC_008526	ATA	2	6	454438	454443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494013
6988	NC_008526	GCC	2	6	454506	454511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494013
6989	NC_008526	AATTG	2	10	454545	454554	40 %	40 %	20 %	0 %	116494013
6990	NC_008526	ATC	2	6	454567	454572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494013
6991	NC_008526	CTT	2	6	454675	454680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494013
6992	NC_008526	CCCA	2	8	454722	454729	25 %	0 %	0 %	75 %	116494013
6993	NC_008526	ATG	2	6	454732	454737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494013
6994	NC_008526	CCA	2	6	454786	454791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494013
6995	NC_008526	GAT	2	6	455037	455042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494013
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6997	NC_008526	T	6	6	455083	455088	0 %	100 %	0 %	0 %	116494013
6998	NC_008526	CCTA	2	8	455175	455182	25 %	25 %	0 %	50 %	116494013
6999	NC_008526	TCA	3	9	455222	455230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494013
7000	NC_008526	CTG	2	6	455252	455257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494013

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