MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008526	ATG	2	6	290199	290204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493856
4502	NC_008526	GATTG	2	10	290228	290237	20 %	40 %	40 %	0 %	116493856
4503	NC_008526	GGC	2	6	290624	290629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493857
4504	NC_008526	TGT	2	6	290654	290659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493857
4505	NC_008526	TCA	2	6	290774	290779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493857
4506	NC_008526	AAG	2	6	290800	290805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493857
4507	NC_008526	GAA	2	6	290931	290936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493857
4508	NC_008526	GTT	2	6	290940	290945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493857
4509	NC_008526	TAC	2	6	291052	291057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493857
4510	NC_008526	GTT	2	6	291087	291092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493857
4511	NC_008526	AAG	2	6	291100	291105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493857
4512	NC_008526	ATG	2	6	291215	291220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493857
4513	NC_008526	CTG	2	6	291356	291361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493857
4514	NC_008526	TTC	2	6	291420	291425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493857
4515	NC_008526	CTG	2	6	291479	291484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493857
4516	NC_008526	GCA	2	6	291509	291514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493857
4517	NC_008526	TGTTT	2	10	291537	291546	0 %	80 %	20 %	0 %	116493857
4518	NC_008526	CAA	2	6	291565	291570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493857
4519	NC_008526	TGA	2	6	291791	291796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493857
4520	NC_008526	GCG	2	6	291830	291835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493857
4521	NC_008526	ATAA	2	8	291887	291894	75 %	25 %	0 %	0 %	116493857
4522	NC_008526	ATC	2	6	292082	292087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493858
4523	NC_008526	AGC	2	6	292169	292174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493858
4524	NC_008526	CAT	2	6	292218	292223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493858
4525	NC_008526	CAT	2	6	292239	292244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493858
4526	NC_008526	GTG	2	6	292324	292329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493858
4527	NC_008526	AAG	2	6	292460	292465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493858
4528	NC_008526	TAA	2	6	292506	292511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493858
4529	NC_008526	A	6	6	292514	292519	100 %	0 %	0 %	0 %	116493858
4530	NC_008526	AAC	2	6	292560	292565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493858
4531	NC_008526	AAC	2	6	292575	292580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493858
4532	NC_008526	AAC	2	6	292587	292592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493858
4533	NC_008526	GCG	2	6	292597	292602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493858
4534	NC_008526	AAG	2	6	292633	292638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493858
4535	NC_008526	CAG	2	6	292640	292645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493858
4536	NC_008526	GAC	2	6	292662	292667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493858
4537	NC_008526	A	6	6	292669	292674	100 %	0 %	0 %	0 %	116493858
4538	NC_008526	GCG	2	6	292675	292680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493858
4539	NC_008526	AAC	2	6	292698	292703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493858
4540	NC_008526	GAA	2	6	292976	292981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493859
4541	NC_008526	TTG	2	6	293011	293016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493859
4542	NC_008526	CTG	2	6	293019	293024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493859
4543	NC_008526	TGAGTC	2	12	293035	293046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116493859
4544	NC_008526	GCC	2	6	293048	293053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493859
4545	NC_008526	GCT	3	9	293064	293072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493859
4546	NC_008526	T	6	6	293092	293097	0 %	100 %	0 %	0 %	116493859
4547	NC_008526	TGA	2	6	293222	293227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493859
4548	NC_008526	TAC	2	6	293304	293309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493859
4549	NC_008526	GAT	2	6	293310	293315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493859
4550	NC_008526	ATATCA	2	12	293380	293391	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116493859
4551	NC_008526	ATG	2	6	293605	293610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493859
4552	NC_008526	TGG	2	6	293618	293623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493859
4553	NC_008526	CAA	2	6	293637	293642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493859
4554	NC_008526	GCG	2	6	293685	293690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493859
4555	NC_008526	TAT	2	6	293739	293744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493859
4556	NC_008526	GCTG	2	8	293802	293809	0 %	25 %	50 %	25 %	116493859
4557	NC_008526	ATG	2	6	293818	293823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493859
4558	NC_008526	GCTA	2	8	293936	293943	25 %	25 %	25 %	25 %	116493859
4559	NC_008526	A	6	6	293955	293960	100 %	0 %	0 %	0 %	116493859
4560	NC_008526	GTGCC	2	10	293986	293995	0 %	20 %	40 %	40 %	116493859
4561	NC_008526	ATT	2	6	293997	294002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493859
4562	NC_008526	GAT	2	6	294027	294032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493859
4563	NC_008526	CTTA	2	8	294100	294107	25 %	50 %	0 %	25 %	116493859
4564	NC_008526	TGT	2	6	294218	294223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493859
4565	NC_008526	CGGC	2	8	294306	294313	0 %	0 %	50 %	50 %	116493859
4566	NC_008526	GCC	2	6	294333	294338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493859
4567	NC_008526	GCG	2	6	294396	294401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493859
4568	NC_008526	TGC	2	6	294404	294409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493859
4569	NC_008526	GCA	3	9	294524	294532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493859
4570	NC_008526	CAA	2	6	294538	294543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493859
4571	NC_008526	GGC	2	6	294658	294663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493859
4572	NC_008526	TCTGA	2	10	295073	295082	20 %	40 %	20 %	20 %	116493860
4573	NC_008526	A	6	6	295094	295099	100 %	0 %	0 %	0 %	116493860
4574	NC_008526	ATT	2	6	295123	295128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493860
4575	NC_008526	GGC	2	6	295160	295165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493860
4576	NC_008526	ATC	2	6	295226	295231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493860
4577	NC_008526	TGC	2	6	295417	295422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493860
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4579	NC_008526	CAA	2	6	295664	295669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493860
4580	NC_008526	GAT	2	6	295712	295717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493860
4581	NC_008526	GAC	2	6	295762	295767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493860
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4584	NC_008526	TTGATG	2	12	295878	295889	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116493860
4585	NC_008526	CAA	2	6	295907	295912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493860
4586	NC_008526	TGACGG	2	12	295939	295950	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116493860
4587	NC_008526	TTG	2	6	296233	296238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493861
4588	NC_008526	TAG	2	6	296285	296290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493861
4589	NC_008526	CCA	2	6	296448	296453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493861
4590	NC_008526	CAG	2	6	296550	296555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493861
4591	NC_008526	ACC	2	6	296569	296574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493861
4592	NC_008526	GTCTT	2	10	296680	296689	0 %	60 %	20 %	20 %	116493861
4593	NC_008526	TTGGC	2	10	296719	296728	0 %	40 %	40 %	20 %	116493861
4594	NC_008526	GT	3	6	296768	296773	0 %	50 %	50 %	0 %	116493861
4595	NC_008526	CGG	2	6	297536	297541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493862
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4599	NC_008526	GAC	2	6	297659	297664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493862
4600	NC_008526	A	7	7	297677	297683	100 %	0 %	0 %	0 %	116493862
4601	NC_008526	GCT	2	6	297711	297716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493862
4602	NC_008526	CAG	2	6	297751	297756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493862
4603	NC_008526	CGT	2	6	297830	297835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493862
4604	NC_008526	TGG	2	6	297940	297945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493862
4605	NC_008526	TTG	2	6	297951	297956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493862
4606	NC_008526	GGC	2	6	298013	298018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493862
4607	NC_008526	ATG	2	6	298243	298248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493863
4608	NC_008526	CGC	2	6	298256	298261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493863
4609	NC_008526	ATG	2	6	298290	298295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493863
4610	NC_008526	CAG	2	6	298311	298316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493863
4611	NC_008526	GCG	2	6	298391	298396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493863
4612	NC_008526	AGC	2	6	298474	298479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493863
4613	NC_008526	GC	3	6	298478	298483	0 %	0 %	50 %	50 %	116493863
4614	NC_008526	GATG	2	8	298505	298512	25 %	25 %	50 %	0 %	116493863
4615	NC_008526	CAC	2	6	298853	298858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493863
4616	NC_008526	CGAT	2	8	298899	298906	25 %	25 %	25 %	25 %	116493863
4617	NC_008526	CAA	2	6	298947	298952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493863
4618	NC_008526	GCTG	2	8	299033	299040	0 %	25 %	50 %	25 %	116493863
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4620	NC_008526	TGA	2	6	299179	299184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493863
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