MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 4440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008511	TTC	2	6	201147	201152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332601
3002	NC_008511	CT	3	6	201210	201215	0 %	50 %	0 %	50 %	116332601
3003	NC_008511	TAGA	2	8	201273	201280	50 %	25 %	25 %	0 %	116332601
3004	NC_008511	TCT	2	6	201346	201351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332601
3005	NC_008511	TTC	2	6	201371	201376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332601
3006	NC_008511	TTCA	2	8	201406	201413	25 %	50 %	0 %	25 %	116332602
3007	NC_008511	AAT	2	6	201414	201419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332602
3008	NC_008511	TCCT	2	8	201480	201487	0 %	50 %	0 %	50 %	116332602
3009	NC_008511	CAA	2	6	201513	201518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332602
3010	NC_008511	AGT	2	6	201520	201525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332602
3011	NC_008511	GCG	2	6	201548	201553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332602
3012	NC_008511	GAT	2	6	201567	201572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332602
3013	NC_008511	T	7	7	201576	201582	0 %	100 %	0 %	0 %	116332602
3014	NC_008511	TTCC	2	8	201585	201592	0 %	50 %	0 %	50 %	116332602
3015	NC_008511	TTC	2	6	201607	201612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332602
3016	NC_008511	AAT	2	6	201614	201619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332602
3017	NC_008511	ATC	2	6	201689	201694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332602
3018	NC_008511	TC	3	6	201747	201752	0 %	50 %	0 %	50 %	116332602
3019	NC_008511	AACT	2	8	201781	201788	50 %	25 %	0 %	25 %	116332602
3020	NC_008511	TG	3	6	201833	201838	0 %	50 %	50 %	0 %	116332602
3021	NC_008511	ACC	2	6	201850	201855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116332602
3022	NC_008511	TAA	2	6	201927	201932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332602
3023	NC_008511	TGT	2	6	201959	201964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332602
3024	NC_008511	CCG	2	6	201975	201980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332602
3025	NC_008511	AAAAC	2	10	202037	202046	80 %	0 %	0 %	20 %	116332602
3026	NC_008511	T	6	6	202082	202087	0 %	100 %	0 %	0 %	116332602
3027	NC_008511	TCA	2	6	202104	202109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332602
3028	NC_008511	TCGG	2	8	202115	202122	0 %	25 %	50 %	25 %	116332602
3029	NC_008511	CAT	2	6	202132	202137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332602
3030	NC_008511	CGA	2	6	202230	202235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332602
3031	NC_008511	T	7	7	202267	202273	0 %	100 %	0 %	0 %	116332602
3032	NC_008511	CCG	2	6	202308	202313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332602
3033	NC_008511	AGA	2	6	202322	202327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332602
3034	NC_008511	GAC	2	6	202458	202463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332602
3035	NC_008511	CT	3	6	202486	202491	0 %	50 %	0 %	50 %	116332602
3036	NC_008511	A	6	6	202516	202521	100 %	0 %	0 %	0 %	116332602
3037	NC_008511	GAAG	2	8	202535	202542	50 %	0 %	50 %	0 %	116332602
3038	NC_008511	TGA	2	6	202590	202595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332602
3039	NC_008511	TCCG	2	8	202600	202607	0 %	25 %	25 %	50 %	116332602
3040	NC_008511	GAT	2	6	202621	202626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332602
3041	NC_008511	ATC	2	6	202726	202731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332602
3042	NC_008511	GATTG	2	10	202741	202750	20 %	40 %	40 %	0 %	116332602
3043	NC_008511	CTT	2	6	202833	202838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332602
3044	NC_008511	T	6	6	202846	202851	0 %	100 %	0 %	0 %	116332602
3045	NC_008511	GTT	2	6	202950	202955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332602
3046	NC_008511	AG	3	6	202994	202999	50 %	0 %	50 %	0 %	116332602
3047	NC_008511	GA	3	6	203000	203005	50 %	0 %	50 %	0 %	116332602
3048	NC_008511	TGA	2	6	203016	203021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332602
3049	NC_008511	GA	3	6	203075	203080	50 %	0 %	50 %	0 %	116332602
3050	NC_008511	A	6	6	203125	203130	100 %	0 %	0 %	0 %	116332602
3051	NC_008511	GAAA	2	8	203144	203151	75 %	0 %	25 %	0 %	116332602
3052	NC_008511	A	6	6	203183	203188	100 %	0 %	0 %	0 %	116332602
3053	NC_008511	AAC	2	6	203204	203209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332602
3054	NC_008511	TTC	2	6	203232	203237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332602
3055	NC_008511	ACCG	2	8	203244	203251	25 %	0 %	25 %	50 %	116332602
3056	NC_008511	ATC	3	9	203412	203420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332603
3057	NC_008511	GCTTT	2	10	203457	203466	0 %	60 %	20 %	20 %	116332603
3058	NC_008511	TTA	2	6	203553	203558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332603
3059	NC_008511	TCC	2	6	203697	203702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332603
3060	NC_008511	TAT	2	6	203851	203856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332603
3061	NC_008511	TCG	2	6	206944	206949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332604
3062	NC_008511	CTC	2	6	206969	206974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332604
3063	NC_008511	TCG	2	6	206995	207000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332604
3064	NC_008511	GTT	2	6	207125	207130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332604
3065	NC_008511	AAAAG	2	10	207185	207194	80 %	0 %	20 %	0 %	116332604
3066	NC_008511	ATC	2	6	207202	207207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332604
3067	NC_008511	ATT	2	6	207254	207259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332604
3068	NC_008511	TTCG	2	8	207265	207272	0 %	50 %	25 %	25 %	116332604
3069	NC_008511	AAAG	2	8	207273	207280	75 %	0 %	25 %	0 %	116332604
3070	NC_008511	AGA	2	6	207293	207298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332604
3071	NC_008511	ATCCAA	2	12	207299	207310	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116332604
3072	NC_008511	GTG	2	6	207324	207329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116332604
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3074	NC_008511	T	6	6	207384	207389	0 %	100 %	0 %	0 %	116332604
3075	NC_008511	GAG	2	6	207390	207395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332604
3076	NC_008511	TTCTT	2	10	207401	207410	0 %	80 %	0 %	20 %	116332604
3077	NC_008511	CT	3	6	207445	207450	0 %	50 %	0 %	50 %	116332604
3078	NC_008511	GACCG	2	10	207484	207493	20 %	0 %	40 %	40 %	116332604
3079	NC_008511	T	6	6	207512	207517	0 %	100 %	0 %	0 %	116332604
3080	NC_008511	A	6	6	207538	207543	100 %	0 %	0 %	0 %	116332604
3081	NC_008511	TA	3	6	207549	207554	50 %	50 %	0 %	0 %	116332604
3082	NC_008511	A	6	6	207725	207730	100 %	0 %	0 %	0 %	116332604
3083	NC_008511	TCT	2	6	207752	207757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332604
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3086	NC_008511	AAAC	2	8	207921	207928	75 %	0 %	0 %	25 %	116332604
3087	NC_008511	CGGA	2	8	207997	208004	25 %	0 %	50 %	25 %	116332604
3088	NC_008511	AAACGA	2	12	208022	208033	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116332604
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3090	NC_008511	CGAT	2	8	208067	208074	25 %	25 %	25 %	25 %	116332604
3091	NC_008511	TCG	2	6	208087	208092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332604
3092	NC_008511	ACA	2	6	208093	208098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332604
3093	NC_008511	ATG	2	6	208161	208166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332605
3094	NC_008511	AAC	2	6	208193	208198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332605
3095	NC_008511	CTT	2	6	208303	208308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332605
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3097	NC_008511	A	6	6	208341	208346	100 %	0 %	0 %	0 %	116332605
3098	NC_008511	CTA	2	6	208377	208382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332605
3099	NC_008511	TTCT	2	8	208423	208430	0 %	75 %	0 %	25 %	116332605
3100	NC_008511	GAA	2	6	208455	208460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332605
3101	NC_008511	ACGG	2	8	208547	208554	25 %	0 %	50 %	25 %	116332606
3102	NC_008511	T	6	6	208597	208602	0 %	100 %	0 %	0 %	116332606
3103	NC_008511	AGG	2	6	208603	208608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332606
3104	NC_008511	TCG	2	6	208682	208687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332606
3105	NC_008511	CAG	2	6	208694	208699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332606
3106	NC_008511	A	6	6	208832	208837	100 %	0 %	0 %	0 %	116332606
3107	NC_008511	GAA	2	6	208839	208844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332606
3108	NC_008511	CTC	2	6	208847	208852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332606
3109	NC_008511	TTC	2	6	208890	208895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332606
3110	NC_008511	TTC	2	6	208897	208902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332606
3111	NC_008511	ACG	2	6	208928	208933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332606
3112	NC_008511	CCGTTC	2	12	208965	208976	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116332606
3113	NC_008511	T	6	6	209011	209016	0 %	100 %	0 %	0 %	116332606
3114	NC_008511	ATCA	2	8	209039	209046	50 %	25 %	0 %	25 %	116332606
3115	NC_008511	AGA	2	6	209059	209064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332606
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3118	NC_008511	TTC	2	6	209210	209215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332606
3119	NC_008511	GCT	3	9	209316	209324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332607
3120	NC_008511	TCT	2	6	209342	209347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332607
3121	NC_008511	AAC	2	6	209378	209383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332607
3122	NC_008511	GACA	2	8	209394	209401	50 %	0 %	25 %	25 %	116332607
3123	NC_008511	CGT	2	6	209456	209461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332607
3124	NC_008511	GAT	2	6	209475	209480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332607
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3126	NC_008511	AG	3	6	209531	209536	50 %	0 %	50 %	0 %	116332607
3127	NC_008511	A	6	6	209633	209638	100 %	0 %	0 %	0 %	116332607
3128	NC_008511	GAT	2	6	209648	209653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332607
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3132	NC_008511	GGA	2	6	209763	209768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332607
3133	NC_008511	CAT	2	6	209774	209779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332607
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3239	NC_008511	T	7	7	215546	215552	0 %	100 %	0 %	0 %	116332612
3240	NC_008511	CTGG	2	8	215580	215587	0 %	25 %	50 %	25 %	116332612
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3248	NC_008511	GGAA	2	8	216070	216077	50 %	0 %	50 %	0 %	116332613
3249	NC_008511	AAAG	2	8	216095	216102	75 %	0 %	25 %	0 %	116332613
3250	NC_008511	T	7	7	216141	216147	0 %	100 %	0 %	0 %	116332613
3251	NC_008511	TAC	2	6	216191	216196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332613
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3253	NC_008511	ATT	2	6	216317	216322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332613
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3265	NC_008511	TGA	2	6	216863	216868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332614
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3353	NC_008511	TAT	2	6	221418	221423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332618
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3366	NC_008511	TCA	2	6	222027	222032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332618
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3368	NC_008511	GAA	2	6	222119	222124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332618
3369	NC_008511	ACAT	2	8	222133	222140	50 %	25 %	0 %	25 %	116332618
3370	NC_008511	ATCCGA	2	12	222190	222201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116332618
3371	NC_008511	ACC	2	6	222210	222215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116332618
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3373	NC_008511	TTC	2	6	222443	222448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332619
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3376	NC_008511	CTTTT	2	10	222508	222517	0 %	80 %	0 %	20 %	116332619
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3481	NC_008511	T	6	6	233668	233673	0 %	100 %	0 %	0 %	116332624
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