MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 4244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008014	GT	3	6	179041	179046	0 %	50 %	50 %	0 %	94972493
4002	NC_008014	CAT	2	6	179062	179067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972493
4003	NC_008014	AT	3	6	179076	179081	50 %	50 %	0 %	0 %	94972493
4004	NC_008014	AGAA	2	8	179096	179103	75 %	0 %	25 %	0 %	94972493
4005	NC_008014	TGT	2	6	179117	179122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972493
4006	NC_008014	ATA	2	6	179147	179152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972493
4007	NC_008014	ATA	2	6	179192	179197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972493
4008	NC_008014	TGTT	2	8	179200	179207	0 %	75 %	25 %	0 %	94972493
4009	NC_008014	AGC	2	6	179234	179239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972493
4010	NC_008014	GCT	2	6	179421	179426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972493
4011	NC_008014	TGT	2	6	179478	179483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972493
4012	NC_008014	ATT	2	6	179531	179536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972493
4013	NC_008014	CAC	2	6	179548	179553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972493
4014	NC_008014	GAA	2	6	179585	179590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972493
4015	NC_008014	TTGA	2	8	179626	179633	25 %	50 %	25 %	0 %	94972493
4016	NC_008014	AATAG	2	10	179672	179681	60 %	20 %	20 %	0 %	94972493
4017	NC_008014	GT	3	6	179713	179718	0 %	50 %	50 %	0 %	94972493
4018	NC_008014	GTG	2	6	179761	179766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972493
4019	NC_008014	TA	3	6	179802	179807	50 %	50 %	0 %	0 %	94972493
4020	NC_008014	T	7	7	179840	179846	0 %	100 %	0 %	0 %	94972493
4021	NC_008014	CTG	2	6	179926	179931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972493
4022	NC_008014	A	6	6	179936	179941	100 %	0 %	0 %	0 %	94972493
4023	NC_008014	TAAG	2	8	180001	180008	50 %	25 %	25 %	0 %	94972493
4024	NC_008014	AGC	2	6	180056	180061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972493
4025	NC_008014	TTG	2	6	180161	180166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972493
4026	NC_008014	TAG	2	6	180206	180211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972494
4027	NC_008014	TAGT	2	8	180265	180272	25 %	50 %	25 %	0 %	94972494
4028	NC_008014	T	10	10	180283	180292	0 %	100 %	0 %	0 %	94972494
4029	NC_008014	A	6	6	180296	180301	100 %	0 %	0 %	0 %	94972494
4030	NC_008014	CAA	2	6	180308	180313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972494
4031	NC_008014	GATA	2	8	180363	180370	50 %	25 %	25 %	0 %	94972494
4032	NC_008014	TTG	2	6	180371	180376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972494
4033	NC_008014	ATAG	2	8	180377	180384	50 %	25 %	25 %	0 %	94972494
4034	NC_008014	TTTTG	2	10	180443	180452	0 %	80 %	20 %	0 %	94972494
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4037	NC_008014	TGC	2	6	180767	180772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972495
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4039	NC_008014	TTTG	2	8	180891	180898	0 %	75 %	25 %	0 %	94972495
4040	NC_008014	GTC	2	6	180920	180925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972495
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4042	NC_008014	CTTC	2	8	181020	181027	0 %	50 %	0 %	50 %	94972495
4043	NC_008014	TCT	2	6	181110	181115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972495
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4051	NC_008014	TTA	2	6	181620	181625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972495
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4054	NC_008014	TGA	2	6	181677	181682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972495
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4057	NC_008014	TCA	2	6	181765	181770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972495
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4059	NC_008014	ATT	2	6	182109	182114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972496
4060	NC_008014	TAT	2	6	182186	182191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972496
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4062	NC_008014	TTC	2	6	182286	182291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972496
4063	NC_008014	TGT	2	6	182433	182438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972496
4064	NC_008014	TATT	2	8	182443	182450	25 %	75 %	0 %	0 %	94972496
4065	NC_008014	T	7	7	182453	182459	0 %	100 %	0 %	0 %	94972496
4066	NC_008014	TGTTTG	2	12	182481	182492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972496
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4069	NC_008014	GTTT	2	8	182637	182644	0 %	75 %	25 %	0 %	94972496
4070	NC_008014	AG	3	6	182725	182730	50 %	0 %	50 %	0 %	94972496
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4074	NC_008014	TAG	2	6	182852	182857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972496
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4080	NC_008014	CTA	2	6	183055	183060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972496
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4082	NC_008014	TGT	2	6	183156	183161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972496
4083	NC_008014	AT	3	6	183170	183175	50 %	50 %	0 %	0 %	94972496
4084	NC_008014	CATTT	2	10	183177	183186	20 %	60 %	0 %	20 %	94972496
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4092	NC_008014	AGT	2	6	184424	184429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972497
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4094	NC_008014	ACT	2	6	184508	184513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972497
4095	NC_008014	TAGG	2	8	184537	184544	25 %	25 %	50 %	0 %	94972497
4096	NC_008014	TGT	2	6	184561	184566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972497
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4098	NC_008014	ATA	2	6	184603	184608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972497
4099	NC_008014	T	6	6	184612	184617	0 %	100 %	0 %	0 %	94972497
4100	NC_008014	AAG	2	6	184624	184629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972497
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4103	NC_008014	ACAAA	2	10	184820	184829	80 %	0 %	0 %	20 %	94972497
4104	NC_008014	TG	3	6	184840	184845	0 %	50 %	50 %	0 %	94972497
4105	NC_008014	TATC	2	8	184890	184897	25 %	50 %	0 %	25 %	94972497
4106	NC_008014	AAT	3	9	185071	185079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972497
4107	NC_008014	ATTAAG	2	12	185089	185100	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94972497
4108	NC_008014	T	7	7	185196	185202	0 %	100 %	0 %	0 %	94972497
4109	NC_008014	TAT	2	6	185220	185225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972497
4110	NC_008014	AGAA	2	8	185248	185255	75 %	0 %	25 %	0 %	94972497
4111	NC_008014	CTC	2	6	185259	185264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972497
4112	NC_008014	AGA	2	6	185281	185286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972497
4113	NC_008014	GTG	2	6	185295	185300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972497
4114	NC_008014	TGA	2	6	185320	185325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972497
4115	NC_008014	T	6	6	185343	185348	0 %	100 %	0 %	0 %	94972497
4116	NC_008014	T	7	7	185363	185369	0 %	100 %	0 %	0 %	94972497
4117	NC_008014	AGA	2	6	185395	185400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972497
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4120	NC_008014	GTA	2	6	186214	186219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972498
4121	NC_008014	TAT	2	6	186225	186230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972498
4122	NC_008014	ATT	2	6	186247	186252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972498
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4124	NC_008014	CT	3	6	186277	186282	0 %	50 %	0 %	50 %	94972498
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