MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 4244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008014	GAT	2	6	163422	163427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3502	NC_008014	CTT	2	6	163435	163440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972489
3503	NC_008014	AGT	8	24	163449	163472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3504	NC_008014	TGA	2	6	163475	163480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3505	NC_008014	GAA	2	6	163560	163565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3506	NC_008014	AAAG	2	8	163574	163581	75 %	0 %	25 %	0 %	94972489
3507	NC_008014	TGA	2	6	163592	163597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3508	NC_008014	TGG	2	6	163604	163609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972489
3509	NC_008014	A	7	7	163613	163619	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3510	NC_008014	GAA	2	6	163620	163625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3511	NC_008014	AGA	2	6	163645	163650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3512	NC_008014	A	8	8	163650	163657	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3513	NC_008014	A	6	6	163668	163673	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3514	NC_008014	AG	3	6	163685	163690	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
3515	NC_008014	A	7	7	163706	163712	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3516	NC_008014	AGCA	2	8	163714	163721	50 %	0 %	25 %	25 %	94972489
3517	NC_008014	AAG	2	6	163727	163732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3518	NC_008014	AGA	2	6	163763	163768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3519	NC_008014	A	6	6	163812	163817	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3520	NC_008014	AGAAA	2	10	163835	163844	80 %	0 %	20 %	0 %	94972489
3521	NC_008014	TG	3	6	163876	163881	0 %	50 %	50 %	0 %	94972489
3522	NC_008014	AAG	3	9	163912	163920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
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3527	NC_008014	AAGAAA	2	12	164011	164022	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	94972489
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3529	NC_008014	CAA	2	6	164037	164042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
3530	NC_008014	AG	3	6	164055	164060	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
3531	NC_008014	AAAGA	2	10	164088	164097	80 %	0 %	20 %	0 %	94972489
3532	NC_008014	GAA	2	6	164115	164120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3533	NC_008014	TAG	2	6	164128	164133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
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3542	NC_008014	ACC	2	6	164564	164569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972489
3543	NC_008014	CTG	2	6	164578	164583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972489
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3545	NC_008014	GTA	2	6	164671	164676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
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3552	NC_008014	TCA	2	6	164873	164878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972489
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3554	NC_008014	TGA	3	9	164885	164893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3555	NC_008014	ATA	2	6	164917	164922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972489
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3559	NC_008014	AGG	2	6	164975	164980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972489
3560	NC_008014	AGG	2	6	164984	164989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972489
3561	NC_008014	GAT	3	9	164994	165002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
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3563	NC_008014	GAT	2	6	165015	165020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
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3570	NC_008014	A	7	7	165207	165213	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
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3581	NC_008014	A	6	6	165543	165548	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
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3589	NC_008014	AGAA	2	8	165691	165698	75 %	0 %	25 %	0 %	94972489
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3605	NC_008014	GAA	2	6	165987	165992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
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3609	NC_008014	GA	4	8	166089	166096	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
3610	NC_008014	AG	3	6	166119	166124	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
3611	NC_008014	AGA	2	6	166163	166168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
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3623	NC_008014	A	6	6	166572	166577	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
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4000	NC_008014	TCA	2	6	178990	178995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972492

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