MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 4244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008014	GAA	2	6	147714	147719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972488
3002	NC_008014	T	6	6	148436	148441	0 %	100 %	0 %	0 %	94972489
3003	NC_008014	AAGT	2	8	148442	148449	50 %	25 %	25 %	0 %	94972489
3004	NC_008014	TAG	2	6	148459	148464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3005	NC_008014	TATGTA	2	12	148474	148485	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94972489
3006	NC_008014	CTG	2	6	148516	148521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972489
3007	NC_008014	A	7	7	148534	148540	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3008	NC_008014	TTC	2	6	148547	148552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972489
3009	NC_008014	GCA	2	6	148566	148571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972489
3010	NC_008014	ACA	2	6	148631	148636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
3011	NC_008014	TACC	2	8	148645	148652	25 %	25 %	0 %	50 %	94972489
3012	NC_008014	GTT	2	6	148689	148694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972489
3013	NC_008014	T	6	6	148702	148707	0 %	100 %	0 %	0 %	94972489
3014	NC_008014	CTC	7	21	148708	148728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972489
3015	NC_008014	CTT	2	6	148729	148734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972489
3016	NC_008014	TC	3	6	148744	148749	0 %	50 %	0 %	50 %	94972489
3017	NC_008014	TCC	2	6	148784	148789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972489
3018	NC_008014	TATTCC	2	12	148802	148813	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	94972489
3019	NC_008014	AGA	2	6	148827	148832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3020	NC_008014	GAAA	2	8	148866	148873	75 %	0 %	25 %	0 %	94972489
3021	NC_008014	TA	3	6	148928	148933	50 %	50 %	0 %	0 %	94972489
3022	NC_008014	GAA	2	6	149004	149009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3023	NC_008014	AGAAAA	2	12	149026	149037	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	94972489
3024	NC_008014	A	7	7	149034	149040	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3025	NC_008014	A	6	6	149043	149048	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3026	NC_008014	AAC	2	6	149071	149076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
3027	NC_008014	AGA	2	6	149079	149084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3028	NC_008014	CAA	2	6	149097	149102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
3029	NC_008014	GAA	2	6	149133	149138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3030	NC_008014	CAA	2	6	149160	149165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
3031	NC_008014	CAA	2	6	149223	149228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
3032	NC_008014	GAAAAA	2	12	149256	149267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	94972489
3033	NC_008014	A	8	8	149263	149270	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3034	NC_008014	AGA	2	6	149273	149278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3035	NC_008014	T	8	8	149311	149318	0 %	100 %	0 %	0 %	94972489
3036	NC_008014	AAG	2	6	149365	149370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3037	NC_008014	GAC	2	6	149395	149400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972489
3038	NC_008014	AGA	2	6	149444	149449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3039	NC_008014	AT	3	6	149500	149505	50 %	50 %	0 %	0 %	94972489
3040	NC_008014	TA	3	6	149542	149547	50 %	50 %	0 %	0 %	94972489
3041	NC_008014	AGT	2	6	149565	149570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3042	NC_008014	TAA	2	6	149584	149589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972489
3043	NC_008014	GAA	2	6	149598	149603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3044	NC_008014	CAT	2	6	149677	149682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972489
3045	NC_008014	ATGA	2	8	149706	149713	50 %	25 %	25 %	0 %	94972489
3046	NC_008014	GAT	2	6	149748	149753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3047	NC_008014	A	6	6	149790	149795	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3048	NC_008014	TCTT	2	8	149849	149856	0 %	75 %	0 %	25 %	94972489
3049	NC_008014	AG	3	6	149919	149924	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
3050	NC_008014	AT	3	6	149931	149936	50 %	50 %	0 %	0 %	94972489
3051	NC_008014	CTT	2	6	149943	149948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972489
3052	NC_008014	TAT	2	6	149970	149975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972489
3053	NC_008014	AAG	2	6	149980	149985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3054	NC_008014	GAT	2	6	149997	150002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3055	NC_008014	A	6	6	150036	150041	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3056	NC_008014	AGG	2	6	150047	150052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972489
3057	NC_008014	TAC	2	6	150055	150060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972489
3058	NC_008014	GAA	2	6	150123	150128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3059	NC_008014	AT	3	6	150171	150176	50 %	50 %	0 %	0 %	94972489
3060	NC_008014	TAT	2	6	150218	150223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972489
3061	NC_008014	GA	3	6	150224	150229	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
3062	NC_008014	AGT	2	6	150285	150290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3063	NC_008014	TTC	2	6	150305	150310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972489
3064	NC_008014	T	6	6	150335	150340	0 %	100 %	0 %	0 %	94972489
3065	NC_008014	TCC	2	6	150356	150361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972489
3066	NC_008014	A	6	6	150384	150389	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3067	NC_008014	TGT	2	6	150452	150457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972489
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3069	NC_008014	TA	3	6	150510	150515	50 %	50 %	0 %	0 %	94972489
3070	NC_008014	ACTG	2	8	150516	150523	25 %	25 %	25 %	25 %	94972489
3071	NC_008014	TCT	2	6	150524	150529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972489
3072	NC_008014	A	8	8	150569	150576	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3073	NC_008014	AAGC	2	8	150606	150613	50 %	0 %	25 %	25 %	94972489
3074	NC_008014	AG	3	6	150623	150628	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
3075	NC_008014	AG	3	6	150713	150718	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
3076	NC_008014	AGT	2	6	150759	150764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3077	NC_008014	TAAA	2	8	150808	150815	75 %	25 %	0 %	0 %	94972489
3078	NC_008014	A	6	6	150822	150827	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3079	NC_008014	GAA	2	6	150876	150881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
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3082	NC_008014	ACT	2	6	150930	150935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972489
3083	NC_008014	A	6	6	150936	150941	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3084	NC_008014	GAG	2	6	150975	150980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972489
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3087	NC_008014	A	8	8	151033	151040	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3088	NC_008014	AGC	2	6	151070	151075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972489
3089	NC_008014	TGGA	2	8	151103	151110	25 %	25 %	50 %	0 %	94972489
3090	NC_008014	A	6	6	151110	151115	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3091	NC_008014	GTT	2	6	151197	151202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972489
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3093	NC_008014	AGAA	2	8	151292	151299	75 %	0 %	25 %	0 %	94972489
3094	NC_008014	AAG	2	6	151311	151316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
3095	NC_008014	TAG	2	6	151331	151336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
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3098	NC_008014	GAT	3	9	151407	151415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3099	NC_008014	A	6	6	151476	151481	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3100	NC_008014	GTG	2	6	151564	151569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972489
3101	NC_008014	AGG	2	6	151574	151579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972489
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3103	NC_008014	A	8	8	151665	151672	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
3104	NC_008014	TGT	2	6	151743	151748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972489
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3107	NC_008014	TAG	2	6	151916	151921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3108	NC_008014	AGT	2	6	151926	151931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
3109	NC_008014	TCA	2	6	151944	151949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972489
3110	NC_008014	AG	3	6	152011	152016	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
3111	NC_008014	CAA	2	6	152052	152057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
3112	NC_008014	GAAA	2	8	152061	152068	75 %	0 %	25 %	0 %	94972489
3113	NC_008014	ATT	2	6	152072	152077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972489
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3116	NC_008014	GCA	2	6	152180	152185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972489
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3118	NC_008014	CAA	2	6	152214	152219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
3119	NC_008014	ATGA	2	8	152259	152266	50 %	25 %	25 %	0 %	94972489
3120	NC_008014	GTT	2	6	152320	152325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972489
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3122	NC_008014	ATG	2	6	152392	152397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
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3124	NC_008014	AGA	2	6	152480	152485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
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3500	NC_008014	CTT	2	6	163411	163416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972489

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