MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008011	CAAT	2	8	195928	195935	50 %	25 %	0 %	25 %	94986601
4002	NC_008011	CAA	2	6	196007	196012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986601
4003	NC_008011	AGT	2	6	196068	196073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986601
4004	NC_008011	CTT	2	6	196175	196180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986601
4005	NC_008011	TGTA	2	8	196293	196300	25 %	50 %	25 %	0 %	94986602
4006	NC_008011	CAT	2	6	196316	196321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986602
4007	NC_008011	ATAA	2	8	196388	196395	75 %	25 %	0 %	0 %	94986602
4008	NC_008011	TCA	2	6	196405	196410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986602
4009	NC_008011	AGAT	2	8	196521	196528	50 %	25 %	25 %	0 %	94986602
4010	NC_008011	T	6	6	196540	196545	0 %	100 %	0 %	0 %	94986602
4011	NC_008011	T	6	6	196566	196571	0 %	100 %	0 %	0 %	94986602
4012	NC_008011	GTT	2	6	196579	196584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986602
4013	NC_008011	TGT	2	6	196588	196593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986602
4014	NC_008011	AAT	2	6	196620	196625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986602
4015	NC_008011	CTA	2	6	196639	196644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986602
4016	NC_008011	AGAT	2	8	196651	196658	50 %	25 %	25 %	0 %	94986602
4017	NC_008011	TTG	2	6	196662	196667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986602
4018	NC_008011	TAA	2	6	196685	196690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986602
4019	NC_008011	GTT	2	6	196703	196708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986602
4020	NC_008011	TTA	7	21	196714	196734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986602
4021	NC_008011	AGTT	2	8	196740	196747	25 %	50 %	25 %	0 %	94986602
4022	NC_008011	CCT	2	6	196792	196797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986602
4023	NC_008011	TC	3	6	196811	196816	0 %	50 %	0 %	50 %	94986602
4024	NC_008011	TAG	2	6	196877	196882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986602
4025	NC_008011	AT	4	8	196919	196926	50 %	50 %	0 %	0 %	94986602
4026	NC_008011	ATGT	2	8	197024	197031	25 %	50 %	25 %	0 %	94986602
4027	NC_008011	ACC	2	6	197034	197039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986602
4028	NC_008011	AGT	2	6	197049	197054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986602
4029	NC_008011	TAT	2	6	197070	197075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986602
4030	NC_008011	ATG	2	6	197098	197103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986602
4031	NC_008011	AGG	2	6	197115	197120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986602
4032	NC_008011	TAA	2	6	197156	197161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986602
4033	NC_008011	T	6	6	197191	197196	0 %	100 %	0 %	0 %	94986602
4034	NC_008011	CAT	2	6	197198	197203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986602
4035	NC_008011	TCC	2	6	197229	197234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986602
4036	NC_008011	CAA	2	6	197258	197263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986602
4037	NC_008011	ACA	2	6	197293	197298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986602
4038	NC_008011	GAT	2	6	197369	197374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986602
4039	NC_008011	CTT	2	6	197967	197972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986603
4040	NC_008011	TATT	2	8	197973	197980	25 %	75 %	0 %	0 %	94986603
4041	NC_008011	ATT	2	6	198007	198012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986603
4042	NC_008011	GTT	2	6	198071	198076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
4043	NC_008011	TTTA	2	8	198145	198152	25 %	75 %	0 %	0 %	94986603
4044	NC_008011	T	7	7	198201	198207	0 %	100 %	0 %	0 %	94986603
4045	NC_008011	AGA	2	6	198227	198232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986603
4046	NC_008011	TCC	2	6	198244	198249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986603
4047	NC_008011	GTT	2	6	198279	198284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
4048	NC_008011	AGCT	2	8	198333	198340	25 %	25 %	25 %	25 %	94986603
4049	NC_008011	TGC	2	6	198370	198375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986603
4050	NC_008011	TCT	2	6	198443	198448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986603
4051	NC_008011	AGAA	2	8	198451	198458	75 %	0 %	25 %	0 %	94986603
4052	NC_008011	ACC	2	6	198463	198468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986603
4053	NC_008011	GTA	2	6	198494	198499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986603
4054	NC_008011	GTT	3	9	198500	198508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
4055	NC_008011	AAG	2	6	198580	198585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986603
4056	NC_008011	AAT	2	6	198631	198636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986603
4057	NC_008011	CTT	2	6	198702	198707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986603
4058	NC_008011	TTG	2	6	198731	198736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
4059	NC_008011	TCC	2	6	198802	198807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986603
4060	NC_008011	ACC	2	6	198976	198981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986603
4061	NC_008011	ATA	2	6	198982	198987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986603
4062	NC_008011	ATTT	2	8	199014	199021	25 %	75 %	0 %	0 %	94986603
4063	NC_008011	TTG	2	6	199029	199034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
4064	NC_008011	TAT	2	6	199150	199155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986603
4065	NC_008011	T	7	7	199245	199251	0 %	100 %	0 %	0 %	94986604
4066	NC_008011	ACC	2	6	199272	199277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986604
4067	NC_008011	GTA	2	6	199366	199371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986604
4068	NC_008011	TA	3	6	199400	199405	50 %	50 %	0 %	0 %	94986604
4069	NC_008011	ACC	2	6	199434	199439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986604
4070	NC_008011	AGC	2	6	199440	199445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986604
4071	NC_008011	TAC	2	6	199475	199480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986604
4072	NC_008011	TGT	2	6	199490	199495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986604
4073	NC_008011	T	7	7	199514	199520	0 %	100 %	0 %	0 %	94986604
4074	NC_008011	CATA	2	8	199535	199542	50 %	25 %	0 %	25 %	94986604
4075	NC_008011	T	6	6	199586	199591	0 %	100 %	0 %	0 %	94986604
4076	NC_008011	T	6	6	199609	199614	0 %	100 %	0 %	0 %	94986604
4077	NC_008011	TCT	2	6	199651	199656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986604
4078	NC_008011	CAT	2	6	199679	199684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986604
4079	NC_008011	TTC	2	6	199749	199754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986604
4080	NC_008011	CAA	2	6	199784	199789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986604
4081	NC_008011	GA	3	6	199852	199857	50 %	0 %	50 %	0 %	94986604
4082	NC_008011	TTG	2	6	199898	199903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986604
4083	NC_008011	ACC	2	6	199911	199916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986604
4084	NC_008011	GCAA	2	8	199923	199930	50 %	0 %	25 %	25 %	94986604
4085	NC_008011	AAGCAC	2	12	199985	199996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	94986604
4086	NC_008011	ACA	2	6	200002	200007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986604
4087	NC_008011	CTT	2	6	200108	200113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986604
4088	NC_008011	ACC	2	6	200148	200153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986604
4089	NC_008011	AAT	2	6	200169	200174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986604
4090	NC_008011	CACTAG	2	12	200231	200242	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94986604
4091	NC_008011	CTTT	2	8	200413	200420	0 %	75 %	0 %	25 %	94986604
4092	NC_008011	ATT	2	6	200424	200429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986604
4093	NC_008011	TAC	2	6	200460	200465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986604
4094	NC_008011	CAA	2	6	200904	200909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986605
4095	NC_008011	ACC	2	6	200915	200920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986605
4096	NC_008011	A	7	7	200970	200976	100 %	0 %	0 %	0 %	94986605
4097	NC_008011	CAT	2	6	201049	201054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986605
4098	NC_008011	AGC	2	6	201137	201142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986605
4099	NC_008011	AGCC	2	8	201163	201170	25 %	0 %	25 %	50 %	94986605
4100	NC_008011	TGC	3	9	201173	201181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986605
4101	NC_008011	ACCTG	2	10	201189	201198	20 %	20 %	20 %	40 %	94986605
4102	NC_008011	GTT	2	6	201250	201255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986605
4103	NC_008011	ATT	2	6	201261	201266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986605
4104	NC_008011	GCT	2	6	201270	201275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986605
4105	NC_008011	CATA	2	8	201281	201288	50 %	25 %	0 %	25 %	94986605
4106	NC_008011	TAA	2	6	201347	201352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986605
4107	NC_008011	TTA	2	6	201378	201383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986605
4108	NC_008011	A	6	6	201425	201430	100 %	0 %	0 %	0 %	94986605
4109	NC_008011	ATC	2	6	201440	201445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986605
4110	NC_008011	CTT	2	6	201520	201525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986605
4111	NC_008011	TAA	2	6	201544	201549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986605
4112	NC_008011	TAA	2	6	201756	201761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986606
4113	NC_008011	CCA	2	6	201795	201800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986606
4114	NC_008011	CTGA	2	8	201826	201833	25 %	25 %	25 %	25 %	94986606
4115	NC_008011	GCA	2	6	201879	201884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986606
4116	NC_008011	T	6	6	201919	201924	0 %	100 %	0 %	0 %	94986606
4117	NC_008011	AG	3	6	201935	201940	50 %	0 %	50 %	0 %	94986606
4118	NC_008011	GAA	2	6	202027	202032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986606
4119	NC_008011	TAG	2	6	202033	202038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986606
4120	NC_008011	CTT	2	6	202078	202083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986606
4121	NC_008011	TAA	2	6	202096	202101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986606
4122	NC_008011	A	6	6	202100	202105	100 %	0 %	0 %	0 %	94986606
4123	NC_008011	GTC	2	6	202109	202114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986606
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4125	NC_008011	TCC	3	9	202148	202156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986606
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4252	NC_008011	AAT	2	6	208420	208425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986612
4253	NC_008011	T	6	6	208528	208533	0 %	100 %	0 %	0 %	94986612
4254	NC_008011	TCA	2	6	208546	208551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986612
4255	NC_008011	AAT	2	6	208554	208559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986612
4256	NC_008011	TCT	2	6	208596	208601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986612
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4258	NC_008011	T	6	6	208644	208649	0 %	100 %	0 %	0 %	94986612
4259	NC_008011	CGT	2	6	208663	208668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986612
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4272	NC_008011	TG	3	6	209517	209522	0 %	50 %	50 %	0 %	94986612
4273	NC_008011	CTT	2	6	209633	209638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986612
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4370	NC_008011	ATT	2	6	214561	214566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986614
4371	NC_008011	TG	3	6	214676	214681	0 %	50 %	50 %	0 %	94986614
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