MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_008011	TGG	2	6	1411841	1411846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987593
30003	NC_008011	CTA	2	6	1411858	1411863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987593
30004	NC_008011	GTA	2	6	1411874	1411879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987593
30005	NC_008011	CTT	2	6	1411900	1411905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987593
30006	NC_008011	TAG	2	6	1411930	1411935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987593
30007	NC_008011	AAT	2	6	1411940	1411945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987593
30008	NC_008011	AATAGG	2	12	1411955	1411966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94987593
30009	NC_008011	CTT	2	6	1411990	1411995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987593
30010	NC_008011	TCA	2	6	1412052	1412057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987593
30011	NC_008011	AAT	2	6	1412061	1412066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987593
30012	NC_008011	CTT	2	6	1412080	1412085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987593
30013	NC_008011	GT	3	6	1412158	1412163	0 %	50 %	50 %	0 %	94987593
30014	NC_008011	CTT	2	6	1412242	1412247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987593
30015	NC_008011	TCA	2	6	1412331	1412336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987593
30016	NC_008011	AAT	2	6	1412345	1412350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987593
30017	NC_008011	T	6	6	1412350	1412355	0 %	100 %	0 %	0 %	94987593
30018	NC_008011	TG	3	6	1412391	1412396	0 %	50 %	50 %	0 %	94987593
30019	NC_008011	T	8	8	1412413	1412420	0 %	100 %	0 %	0 %	94987593
30020	NC_008011	TAA	2	6	1412458	1412463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987593
30021	NC_008011	TTG	2	6	1412471	1412476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987593
30022	NC_008011	T	6	6	1412481	1412486	0 %	100 %	0 %	0 %	94987593
30023	NC_008011	ACAT	2	8	1412702	1412709	50 %	25 %	0 %	25 %	94987594
30024	NC_008011	TGT	2	6	1412750	1412755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987594
30025	NC_008011	AGA	2	6	1412818	1412823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987594
30026	NC_008011	AAG	2	6	1412839	1412844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987594
30027	NC_008011	TCC	2	6	1412845	1412850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987594
30028	NC_008011	TAG	2	6	1412940	1412945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987594
30029	NC_008011	CCAATA	2	12	1413008	1413019	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94987594
30030	NC_008011	GTT	2	6	1413344	1413349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987595
30031	NC_008011	TAT	2	6	1413356	1413361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987595
30032	NC_008011	TCT	2	6	1413415	1413420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987595
30033	NC_008011	CTT	2	6	1413421	1413426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987595
30034	NC_008011	CAG	2	6	1413515	1413520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987595
30035	NC_008011	A	7	7	1413535	1413541	100 %	0 %	0 %	0 %	94987595
30036	NC_008011	CTT	2	6	1413545	1413550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987595
30037	NC_008011	CAA	2	6	1413578	1413583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987595
30038	NC_008011	AGGA	2	8	1413596	1413603	50 %	0 %	50 %	0 %	94987595
30039	NC_008011	T	6	6	1413619	1413624	0 %	100 %	0 %	0 %	94987595
30040	NC_008011	CAT	2	6	1413642	1413647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987595
30041	NC_008011	C	7	7	1413674	1413680	0 %	0 %	0 %	100 %	94987595
30042	NC_008011	GTA	2	6	1413715	1413720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987595
30043	NC_008011	GTT	2	6	1413743	1413748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987595
30044	NC_008011	T	6	6	1413752	1413757	0 %	100 %	0 %	0 %	94987595
30045	NC_008011	CCA	2	6	1413823	1413828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987595
30046	NC_008011	TAGA	2	8	1413833	1413840	50 %	25 %	25 %	0 %	94987595
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30049	NC_008011	AAG	2	6	1413888	1413893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987595
30050	NC_008011	TGT	3	9	1413933	1413941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987595
30051	NC_008011	TGC	2	6	1413960	1413965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987595
30052	NC_008011	TCA	2	6	1414024	1414029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987595
30053	NC_008011	TTA	2	6	1414147	1414152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987595
30054	NC_008011	T	6	6	1414169	1414174	0 %	100 %	0 %	0 %	94987595
30055	NC_008011	ATC	2	6	1414245	1414250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987595
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30057	NC_008011	GTT	2	6	1414363	1414368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987595
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30059	NC_008011	ATCA	2	8	1414386	1414393	50 %	25 %	0 %	25 %	94987595
30060	NC_008011	TG	3	6	1414414	1414419	0 %	50 %	50 %	0 %	94987595
30061	NC_008011	TAC	2	6	1414436	1414441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987595
30062	NC_008011	CAG	2	6	1414463	1414468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987595
30063	NC_008011	ATTTG	2	10	1414480	1414489	20 %	60 %	20 %	0 %	94987595
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30068	NC_008011	ATGA	2	8	1415443	1415450	50 %	25 %	25 %	0 %	94987596
30069	NC_008011	AAG	2	6	1415504	1415509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987596
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30079	NC_008011	TAATG	2	10	1416040	1416049	40 %	40 %	20 %	0 %	94987596
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30083	NC_008011	TGGTAG	2	12	1416788	1416799	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	94987597
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30085	NC_008011	ATTG	2	8	1416834	1416841	25 %	50 %	25 %	0 %	94987597
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30087	NC_008011	TGA	2	6	1416905	1416910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987597
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30089	NC_008011	A	6	6	1416973	1416978	100 %	0 %	0 %	0 %	94987597
30090	NC_008011	GTG	2	6	1418022	1418027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987598
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30092	NC_008011	ATGAT	2	10	1418193	1418202	40 %	40 %	20 %	0 %	94987598
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30100	NC_008011	A	6	6	1418509	1418514	100 %	0 %	0 %	0 %	94987598
30101	NC_008011	GCT	2	6	1419165	1419170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987599
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30103	NC_008011	CAT	2	6	1419263	1419268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987599
30104	NC_008011	GATG	2	8	1419287	1419294	25 %	25 %	50 %	0 %	94987599
30105	NC_008011	TA	3	6	1419298	1419303	50 %	50 %	0 %	0 %	94987599
30106	NC_008011	A	6	6	1419329	1419334	100 %	0 %	0 %	0 %	94987599
30107	NC_008011	T	6	6	1419563	1419568	0 %	100 %	0 %	0 %	94987599
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30110	NC_008011	TC	3	6	1419647	1419652	0 %	50 %	0 %	50 %	94987599
30111	NC_008011	GGA	2	6	1419654	1419659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987599
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30114	NC_008011	GAA	2	6	1419749	1419754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987600
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30118	NC_008011	AGC	3	9	1419826	1419834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987600
30119	NC_008011	TGG	2	6	1419853	1419858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987600
30120	NC_008011	GGT	2	6	1419923	1419928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987600
30121	NC_008011	GTG	2	6	1419942	1419947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987600
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30233	NC_008011	TGA	2	6	1425516	1425521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987603
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