MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_008011	ATG	2	6	1385986	1385991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987569
29503	NC_008011	A	6	6	1385999	1386004	100 %	0 %	0 %	0 %	94987569
29504	NC_008011	CAA	2	6	1386012	1386017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987569
29505	NC_008011	T	6	6	1386072	1386077	0 %	100 %	0 %	0 %	94987569
29506	NC_008011	TAT	2	6	1386140	1386145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987569
29507	NC_008011	GCTCAA	2	12	1386147	1386158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94987569
29508	NC_008011	TTA	3	9	1386162	1386170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987569
29509	NC_008011	GCA	2	6	1386183	1386188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987569
29510	NC_008011	GTG	2	6	1386193	1386198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987569
29511	NC_008011	AGTC	2	8	1386213	1386220	25 %	25 %	25 %	25 %	94987569
29512	NC_008011	A	6	6	1386231	1386236	100 %	0 %	0 %	0 %	94987569
29513	NC_008011	TA	3	6	1386255	1386260	50 %	50 %	0 %	0 %	94987569
29514	NC_008011	TTG	2	6	1386265	1386270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987569
29515	NC_008011	T	6	6	1386384	1386389	0 %	100 %	0 %	0 %	94987569
29516	NC_008011	CTG	2	6	1386439	1386444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987569
29517	NC_008011	TA	3	6	1386466	1386471	50 %	50 %	0 %	0 %	94987569
29518	NC_008011	TGG	2	6	1386540	1386545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987569
29519	NC_008011	ATTT	2	8	1386587	1386594	25 %	75 %	0 %	0 %	94987569
29520	NC_008011	CTTT	2	8	1386623	1386630	0 %	75 %	0 %	25 %	94987569
29521	NC_008011	AAG	2	6	1386684	1386689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987569
29522	NC_008011	TAC	2	6	1386703	1386708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987569
29523	NC_008011	CT	3	6	1386722	1386727	0 %	50 %	0 %	50 %	94987569
29524	NC_008011	AAG	2	6	1386925	1386930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987569
29525	NC_008011	GTT	2	6	1386951	1386956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987569
29526	NC_008011	T	6	6	1386980	1386985	0 %	100 %	0 %	0 %	94987569
29527	NC_008011	GA	3	6	1387007	1387012	50 %	0 %	50 %	0 %	94987569
29528	NC_008011	T	6	6	1387025	1387030	0 %	100 %	0 %	0 %	94987569
29529	NC_008011	TCT	2	6	1387032	1387037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987569
29530	NC_008011	TAGT	2	8	1387060	1387067	25 %	50 %	25 %	0 %	94987569
29531	NC_008011	TG	3	6	1387089	1387094	0 %	50 %	50 %	0 %	94987569
29532	NC_008011	AGG	2	6	1387124	1387129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987569
29533	NC_008011	GGTGCA	2	12	1387137	1387148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	94987569
29534	NC_008011	ATT	2	6	1387164	1387169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987569
29535	NC_008011	GTT	2	6	1387174	1387179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987569
29536	NC_008011	T	6	6	1387223	1387228	0 %	100 %	0 %	0 %	94987569
29537	NC_008011	CTT	2	6	1387260	1387265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987569
29538	NC_008011	TAC	2	6	1387306	1387311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987569
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29540	NC_008011	TTA	2	6	1387490	1387495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987570
29541	NC_008011	TCT	2	6	1387517	1387522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987570
29542	NC_008011	AC	3	6	1387527	1387532	50 %	0 %	0 %	50 %	94987570
29543	NC_008011	T	6	6	1387638	1387643	0 %	100 %	0 %	0 %	94987570
29544	NC_008011	ATGTT	2	10	1387730	1387739	20 %	60 %	20 %	0 %	94987570
29545	NC_008011	AGA	2	6	1387777	1387782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987570
29546	NC_008011	AT	3	6	1387801	1387806	50 %	50 %	0 %	0 %	94987570
29547	NC_008011	CAA	2	6	1387812	1387817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987570
29548	NC_008011	TAC	2	6	1387825	1387830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987570
29549	NC_008011	T	7	7	1387876	1387882	0 %	100 %	0 %	0 %	94987570
29550	NC_008011	GA	3	6	1387966	1387971	50 %	0 %	50 %	0 %	94987570
29551	NC_008011	GCT	2	6	1387994	1387999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987570
29552	NC_008011	ATT	2	6	1388038	1388043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987570
29553	NC_008011	TGT	3	9	1388125	1388133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987570
29554	NC_008011	TAA	2	6	1388182	1388187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987570
29555	NC_008011	GATTTT	2	12	1388213	1388224	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94987570
29556	NC_008011	A	7	7	1388260	1388266	100 %	0 %	0 %	0 %	94987570
29557	NC_008011	CATA	2	8	1388483	1388490	50 %	25 %	0 %	25 %	94987571
29558	NC_008011	GAT	2	6	1388495	1388500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987571
29559	NC_008011	ATGGT	2	10	1388522	1388531	20 %	40 %	40 %	0 %	94987571
29560	NC_008011	AATTT	2	10	1388749	1388758	40 %	60 %	0 %	0 %	94987571
29561	NC_008011	TGT	2	6	1388774	1388779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987571
29562	NC_008011	TTGC	2	8	1388853	1388860	0 %	50 %	25 %	25 %	94987571
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29569	NC_008011	CTT	2	6	1389197	1389202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987571
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29578	NC_008011	ATGG	2	8	1389347	1389354	25 %	25 %	50 %	0 %	94987572
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29589	NC_008011	T	6	6	1389715	1389720	0 %	100 %	0 %	0 %	94987572
29590	NC_008011	GGAACA	2	12	1389727	1389738	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	94987572
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