MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_008011	CTT	2	6	1129961	1129966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987347
24003	NC_008011	AGT	2	6	1130001	1130006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987347
24004	NC_008011	GATG	2	8	1130040	1130047	25 %	25 %	50 %	0 %	94987347
24005	NC_008011	AAG	2	6	1130081	1130086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987347
24006	NC_008011	TCA	2	6	1130104	1130109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987347
24007	NC_008011	TGT	2	6	1130178	1130183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987347
24008	NC_008011	TTC	2	6	1130237	1130242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987347
24009	NC_008011	AG	3	6	1130316	1130321	50 %	0 %	50 %	0 %	94987347
24010	NC_008011	ACG	2	6	1130322	1130327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987347
24011	NC_008011	GTTT	2	8	1130352	1130359	0 %	75 %	25 %	0 %	94987347
24012	NC_008011	GCT	2	6	1130410	1130415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987347
24013	NC_008011	TAA	2	6	1130429	1130434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987347
24014	NC_008011	CTA	2	6	1130540	1130545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987347
24015	NC_008011	ATC	2	6	1130577	1130582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987347
24016	NC_008011	GTAA	2	8	1130611	1130618	50 %	25 %	25 %	0 %	94987347
24017	NC_008011	GA	4	8	1130714	1130721	50 %	0 %	50 %	0 %	94987347
24018	NC_008011	ATA	2	6	1130724	1130729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987347
24019	NC_008011	TAT	2	6	1130732	1130737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987347
24020	NC_008011	AAAG	2	8	1130754	1130761	75 %	0 %	25 %	0 %	94987347
24021	NC_008011	AGC	2	6	1130763	1130768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987347
24022	NC_008011	AGG	2	6	1130781	1130786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987347
24023	NC_008011	CGA	2	6	1130803	1130808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987347
24024	NC_008011	TCT	2	6	1130815	1130820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987347
24025	NC_008011	TGT	2	6	1130832	1130837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987347
24026	NC_008011	TG	3	6	1130895	1130900	0 %	50 %	50 %	0 %	94987347
24027	NC_008011	GTA	2	6	1130914	1130919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987347
24028	NC_008011	CAG	2	6	1130966	1130971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987347
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24030	NC_008011	CTG	2	6	1131113	1131118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987347
24031	NC_008011	AGG	2	6	1131124	1131129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987347
24032	NC_008011	CAT	2	6	1131209	1131214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987347
24033	NC_008011	AT	3	6	1131223	1131228	50 %	50 %	0 %	0 %	94987347
24034	NC_008011	T	6	6	1131234	1131239	0 %	100 %	0 %	0 %	94987347
24035	NC_008011	A	7	7	1131242	1131248	100 %	0 %	0 %	0 %	94987347
24036	NC_008011	GGCA	2	8	1131297	1131304	25 %	0 %	50 %	25 %	94987347
24037	NC_008011	CGA	2	6	1131310	1131315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987347
24038	NC_008011	TCAAAG	2	12	1131349	1131360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94987347
24039	NC_008011	AAT	2	6	1131384	1131389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987347
24040	NC_008011	AAT	2	6	1131447	1131452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987347
24041	NC_008011	CT	4	8	1131485	1131492	0 %	50 %	0 %	50 %	94987347
24042	NC_008011	TAA	2	6	1131500	1131505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987347
24043	NC_008011	TA	3	6	1131607	1131612	50 %	50 %	0 %	0 %	94987347
24044	NC_008011	TAAG	2	8	1131646	1131653	50 %	25 %	25 %	0 %	94987347
24045	NC_008011	CTT	2	6	1131779	1131784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987347
24046	NC_008011	CTT	2	6	1131806	1131811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987347
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24048	NC_008011	AAG	2	6	1131846	1131851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987347
24049	NC_008011	ATTA	2	8	1132245	1132252	50 %	50 %	0 %	0 %	94987348
24050	NC_008011	ATT	2	6	1132271	1132276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987348
24051	NC_008011	T	7	7	1132275	1132281	0 %	100 %	0 %	0 %	94987348
24052	NC_008011	TTCTTT	2	12	1132306	1132317	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	94987348
24053	NC_008011	ATT	2	6	1132369	1132374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987348
24054	NC_008011	T	7	7	1132373	1132379	0 %	100 %	0 %	0 %	94987348
24055	NC_008011	TA	3	6	1132401	1132406	50 %	50 %	0 %	0 %	94987348
24056	NC_008011	GTT	2	6	1132418	1132423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987348
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24059	NC_008011	A	8	8	1132459	1132466	100 %	0 %	0 %	0 %	94987348
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24071	NC_008011	GATA	2	8	1133047	1133054	50 %	25 %	25 %	0 %	94987348
24072	NC_008011	GCTA	2	8	1133077	1133084	25 %	25 %	25 %	25 %	94987348
24073	NC_008011	A	6	6	1133084	1133089	100 %	0 %	0 %	0 %	94987348
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24475	NC_008011	AGA	2	6	1153264	1153269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987365
24476	NC_008011	ATA	2	6	1153318	1153323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987365
24477	NC_008011	TAA	2	6	1153419	1153424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987366
24478	NC_008011	ACCA	2	8	1153467	1153474	50 %	0 %	0 %	50 %	94987366
24479	NC_008011	ACC	2	6	1153501	1153506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987366
24480	NC_008011	AAGCTA	2	12	1153551	1153562	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94987366
24481	NC_008011	AG	4	8	1153586	1153593	50 %	0 %	50 %	0 %	94987366
24482	NC_008011	ATA	2	6	1153600	1153605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987366
24483	NC_008011	T	7	7	1153608	1153614	0 %	100 %	0 %	0 %	94987366
24484	NC_008011	ATTAG	2	10	1153637	1153646	40 %	40 %	20 %	0 %	94987366
24485	NC_008011	AAT	2	6	1153648	1153653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987366
24486	NC_008011	CTG	2	6	1153662	1153667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987366
24487	NC_008011	TTG	2	6	1153701	1153706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987366
24488	NC_008011	TGA	2	6	1153741	1153746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987367
24489	NC_008011	T	6	6	1153824	1153829	0 %	100 %	0 %	0 %	94987367
24490	NC_008011	TAA	2	6	1153857	1153862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987367
24491	NC_008011	AAGTCC	2	12	1153867	1153878	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94987367
24492	NC_008011	AGC	2	6	1153918	1153923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987367
24493	NC_008011	ATA	2	6	1153936	1153941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987367
24494	NC_008011	ATA	2	6	1154108	1154113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987367
24495	NC_008011	TTA	2	6	1154161	1154166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987368
24496	NC_008011	TAT	3	9	1154174	1154182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987368
24497	NC_008011	AT	3	6	1154188	1154193	50 %	50 %	0 %	0 %	94987368
24498	NC_008011	AAG	2	6	1154206	1154211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987368
24499	NC_008011	AGC	2	6	1154217	1154222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987368
24500	NC_008011	TCT	2	6	1154308	1154313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987368

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