MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_008011	AT	3	6	988937	988942	50 %	50 %	0 %	0 %	94987236
21003	NC_008011	AT	3	6	988980	988985	50 %	50 %	0 %	0 %	94987236
21004	NC_008011	TTA	2	6	989058	989063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987236
21005	NC_008011	GCT	2	6	989064	989069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987236
21006	NC_008011	A	7	7	989074	989080	100 %	0 %	0 %	0 %	94987236
21007	NC_008011	TCA	2	6	989117	989122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987236
21008	NC_008011	GACAG	2	10	989222	989231	40 %	0 %	40 %	20 %	94987236
21009	NC_008011	AGA	2	6	989282	989287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987236
21010	NC_008011	A	6	6	989353	989358	100 %	0 %	0 %	0 %	94987236
21011	NC_008011	ATG	2	6	989652	989657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987237
21012	NC_008011	A	7	7	989658	989664	100 %	0 %	0 %	0 %	94987237
21013	NC_008011	ATT	2	6	989671	989676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987237
21014	NC_008011	AGA	2	6	989803	989808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987237
21015	NC_008011	ACT	2	6	989812	989817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987237
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21017	NC_008011	TGA	2	6	989845	989850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987237
21018	NC_008011	A	7	7	989876	989882	100 %	0 %	0 %	0 %	94987237
21019	NC_008011	A	6	6	989931	989936	100 %	0 %	0 %	0 %	94987237
21020	NC_008011	CAA	2	6	990069	990074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987237
21021	NC_008011	GGA	2	6	990100	990105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987237
21022	NC_008011	CTT	2	6	990128	990133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987237
21023	NC_008011	TGA	2	6	990184	990189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987237
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21028	NC_008011	GTG	2	6	990423	990428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987237
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21034	NC_008011	GT	3	6	990814	990819	0 %	50 %	50 %	0 %	94987237
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21040	NC_008011	TTTG	2	8	991158	991165	0 %	75 %	25 %	0 %	94987238
21041	NC_008011	GTA	2	6	991166	991171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987238
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21059	NC_008011	TGA	2	6	992284	992289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987238
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21065	NC_008011	TGC	2	6	992665	992670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987238
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21486	NC_008011	TAA	2	6	1012585	1012590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987256
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