MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_008011	TAT	2	6	853026	853031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987122
18003	NC_008011	TCC	2	6	853053	853058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987122
18004	NC_008011	AAC	2	6	853105	853110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987122
18005	NC_008011	TC	4	8	853114	853121	0 %	50 %	0 %	50 %	94987122
18006	NC_008011	TCT	2	6	853124	853129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987122
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18008	NC_008011	ATT	2	6	853156	853161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987123
18009	NC_008011	CCCT	2	8	853202	853209	0 %	25 %	0 %	75 %	94987123
18010	NC_008011	TGT	2	6	853266	853271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987123
18011	NC_008011	TAA	2	6	853321	853326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987123
18012	NC_008011	A	7	7	853325	853331	100 %	0 %	0 %	0 %	94987123
18013	NC_008011	TCC	2	6	853442	853447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987123
18014	NC_008011	CCA	2	6	853464	853469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987123
18015	NC_008011	TA	3	6	853492	853497	50 %	50 %	0 %	0 %	94987123
18016	NC_008011	TTC	2	6	853556	853561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987123
18017	NC_008011	CAA	2	6	853603	853608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987123
18018	NC_008011	AATTT	2	10	853609	853618	40 %	60 %	0 %	0 %	94987123
18019	NC_008011	T	7	7	853616	853622	0 %	100 %	0 %	0 %	94987123
18020	NC_008011	GTG	2	6	853651	853656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987123
18021	NC_008011	T	6	6	853697	853702	0 %	100 %	0 %	0 %	94987123
18022	NC_008011	CTT	3	9	853726	853734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987123
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18025	NC_008011	TGC	2	6	853892	853897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987123
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18027	NC_008011	T	6	6	853990	853995	0 %	100 %	0 %	0 %	94987123
18028	NC_008011	TTA	2	6	854037	854042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987123
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18031	NC_008011	TCT	2	6	854205	854210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987123
18032	NC_008011	ATA	2	6	854214	854219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987123
18033	NC_008011	AAG	2	6	854243	854248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987123
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18035	NC_008011	TAG	2	6	854359	854364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987123
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18037	NC_008011	AACT	2	8	854523	854530	50 %	25 %	0 %	25 %	94987124
18038	NC_008011	GCT	2	6	854551	854556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987124
18039	NC_008011	CT	3	6	854559	854564	0 %	50 %	0 %	50 %	94987124
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18042	NC_008011	TTA	2	6	854773	854778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987124
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18052	NC_008011	CTG	2	6	855125	855130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987124
18053	NC_008011	TAA	2	6	855165	855170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987124
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18055	NC_008011	GTA	2	6	855206	855211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987124
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18096	NC_008011	A	7	7	859490	859496	100 %	0 %	0 %	0 %	94987127
18097	NC_008011	AT	3	6	859504	859509	50 %	50 %	0 %	0 %	94987127
18098	NC_008011	A	6	6	859522	859527	100 %	0 %	0 %	0 %	94987127
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18496	NC_008011	TAC	2	6	878596	878601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987141
18497	NC_008011	GAA	2	6	878613	878618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987141
18498	NC_008011	TA	3	6	878627	878632	50 %	50 %	0 %	0 %	94987141
18499	NC_008011	A	6	6	878644	878649	100 %	0 %	0 %	0 %	94987141
18500	NC_008011	TAA	2	6	878669	878674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987141

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