MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_008011	ATAA	2	8	801698	801705	75 %	25 %	0 %	0 %	94987090
17003	NC_008011	CTAT	2	8	802648	802655	25 %	50 %	0 %	25 %	94987091
17004	NC_008011	A	6	6	802659	802664	100 %	0 %	0 %	0 %	94987091
17005	NC_008011	T	6	6	802677	802682	0 %	100 %	0 %	0 %	94987091
17006	NC_008011	AGT	2	6	802767	802772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987091
17007	NC_008011	TGG	2	6	802806	802811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987091
17008	NC_008011	TGT	2	6	802902	802907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987091
17009	NC_008011	GGT	2	6	802909	802914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987091
17010	NC_008011	TTG	2	6	802970	802975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987091
17011	NC_008011	AAATAC	2	12	802977	802988	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	94987091
17012	NC_008011	TAT	2	6	802998	803003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987091
17013	NC_008011	TGG	2	6	803004	803009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987091
17014	NC_008011	TGC	2	6	803022	803027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987091
17015	NC_008011	TGG	2	6	803040	803045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987091
17016	NC_008011	TGG	2	6	803094	803099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987091
17017	NC_008011	AAC	2	6	803187	803192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987091
17018	NC_008011	T	6	6	803256	803261	0 %	100 %	0 %	0 %	94987091
17019	NC_008011	TTCTAA	2	12	803295	803306	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94987091
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17021	NC_008011	CAA	2	6	803387	803392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987091
17022	NC_008011	TAG	2	6	803415	803420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987091
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17024	NC_008011	CAA	2	6	803472	803477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987091
17025	NC_008011	GCAA	2	8	803497	803504	50 %	0 %	25 %	25 %	94987091
17026	NC_008011	ATGG	2	8	803536	803543	25 %	25 %	50 %	0 %	94987091
17027	NC_008011	GTAAT	2	10	803576	803585	40 %	40 %	20 %	0 %	94987091
17028	NC_008011	TACT	2	8	803600	803607	25 %	50 %	0 %	25 %	94987091
17029	NC_008011	ATCT	2	8	803618	803625	25 %	50 %	0 %	25 %	94987091
17030	NC_008011	AATA	2	8	803634	803641	75 %	25 %	0 %	0 %	94987091
17031	NC_008011	ACT	2	6	803686	803691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987091
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17033	NC_008011	AGG	2	6	803730	803735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987091
17034	NC_008011	CAA	2	6	803789	803794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987091
17035	NC_008011	GA	3	6	803871	803876	50 %	0 %	50 %	0 %	94987091
17036	NC_008011	GGT	2	6	803914	803919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987091
17037	NC_008011	TATT	2	8	803924	803931	25 %	75 %	0 %	0 %	94987091
17038	NC_008011	CTG	2	6	803933	803938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987091
17039	NC_008011	GGA	2	6	803947	803952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987091
17040	NC_008011	ATT	2	6	803974	803979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987091
17041	NC_008011	AT	3	6	804079	804084	50 %	50 %	0 %	0 %	94987091
17042	NC_008011	ATT	2	6	804133	804138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987091
17043	NC_008011	CTAA	2	8	804268	804275	50 %	25 %	0 %	25 %	94987091
17044	NC_008011	CAG	2	6	804308	804313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987091
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17046	NC_008011	TAA	2	6	804372	804377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987091
17047	NC_008011	ATT	2	6	804378	804383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987091
17048	NC_008011	GGT	2	6	804421	804426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987091
17049	NC_008011	GCA	2	6	804442	804447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987091
17050	NC_008011	TAAGT	2	10	804504	804513	40 %	40 %	20 %	0 %	94987091
17051	NC_008011	GGATTT	2	12	804547	804558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	94987091
17052	NC_008011	AAAT	2	8	804570	804577	75 %	25 %	0 %	0 %	94987091
17053	NC_008011	ACT	2	6	804595	804600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987091
17054	NC_008011	TGGT	2	8	804620	804627	0 %	50 %	50 %	0 %	94987091
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17057	NC_008011	GAAA	2	8	804741	804748	75 %	0 %	25 %	0 %	94987091
17058	NC_008011	TTGG	2	8	804773	804780	0 %	50 %	50 %	0 %	94987091
17059	NC_008011	TGA	2	6	804792	804797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987091
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17061	NC_008011	AAG	2	6	804866	804871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987091
17062	NC_008011	GATTTA	2	12	804937	804948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94987091
17063	NC_008011	ATA	2	6	804958	804963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987091
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17067	NC_008011	TAT	2	6	806264	806269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987092
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17069	NC_008011	ACT	2	6	806310	806315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987092
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17073	NC_008011	A	7	7	806502	806508	100 %	0 %	0 %	0 %	94987092
17074	NC_008011	TACA	2	8	806514	806521	50 %	25 %	0 %	25 %	94987092
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17087	NC_008011	ATC	2	6	807105	807110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987092
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17090	NC_008011	TAT	2	6	807174	807179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987092
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17094	NC_008011	A	6	6	807359	807364	100 %	0 %	0 %	0 %	94987092
17095	NC_008011	ATG	2	6	807461	807466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987092
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17100	NC_008011	TCTCT	2	10	807720	807729	0 %	60 %	0 %	40 %	94987092
17101	NC_008011	TGA	2	6	807744	807749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987092
17102	NC_008011	AC	3	6	807799	807804	50 %	0 %	0 %	50 %	94987092
17103	NC_008011	TC	3	6	807863	807868	0 %	50 %	0 %	50 %	94987092
17104	NC_008011	TTA	2	6	807872	807877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987092
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17106	NC_008011	T	6	6	807956	807961	0 %	100 %	0 %	0 %	94987092
17107	NC_008011	GAA	2	6	807970	807975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987092
17108	NC_008011	AGA	2	6	808029	808034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987092
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17112	NC_008011	CATT	2	8	808182	808189	25 %	50 %	0 %	25 %	94987092
17113	NC_008011	ATAC	2	8	808204	808211	50 %	25 %	0 %	25 %	94987092
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17121	NC_008011	AATGG	2	10	808457	808466	40 %	20 %	40 %	0 %	94987092
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17494	NC_008011	CTT	2	6	824875	824880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987104
17495	NC_008011	CAC	2	6	824886	824891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987104
17496	NC_008011	TCC	2	6	824966	824971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987104
17497	NC_008011	CTTCAA	2	12	824980	824991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987104
17498	NC_008011	CTT	2	6	825001	825006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987104
17499	NC_008011	CTC	2	6	825091	825096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987104
17500	NC_008011	TTC	2	6	825104	825109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987104

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