MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008011	TC	3	6	754785	754790	0 %	50 %	0 %	50 %	94987054
16002	NC_008011	A	6	6	754798	754803	100 %	0 %	0 %	0 %	94987054
16003	NC_008011	CAAG	2	8	754808	754815	50 %	0 %	25 %	25 %	94987054
16004	NC_008011	GTT	2	6	754962	754967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987054
16005	NC_008011	T	6	6	754991	754996	0 %	100 %	0 %	0 %	94987054
16006	NC_008011	A	7	7	755024	755030	100 %	0 %	0 %	0 %	94987054
16007	NC_008011	TAA	2	6	755070	755075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987054
16008	NC_008011	TAT	2	6	755088	755093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987054
16009	NC_008011	T	6	6	755098	755103	0 %	100 %	0 %	0 %	94987054
16010	NC_008011	CAA	2	6	755110	755115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987054
16011	NC_008011	TGT	2	6	755125	755130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987054
16012	NC_008011	GCT	2	6	755153	755158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987054
16013	NC_008011	GTA	2	6	755172	755177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987054
16014	NC_008011	ATTT	2	8	755191	755198	25 %	75 %	0 %	0 %	94987054
16015	NC_008011	A	6	6	755211	755216	100 %	0 %	0 %	0 %	94987054
16016	NC_008011	AAT	3	9	755228	755236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987054
16017	NC_008011	TAATA	2	10	755241	755250	60 %	40 %	0 %	0 %	94987054
16018	NC_008011	TAC	2	6	755259	755264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987054
16019	NC_008011	CTG	2	6	755358	755363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987054
16020	NC_008011	ATTT	2	8	755415	755422	25 %	75 %	0 %	0 %	94987054
16021	NC_008011	AAT	2	6	755429	755434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987054
16022	NC_008011	CAG	2	6	755439	755444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987054
16023	NC_008011	CAAA	2	8	755446	755453	75 %	0 %	0 %	25 %	94987054
16024	NC_008011	TA	3	6	755479	755484	50 %	50 %	0 %	0 %	94987054
16025	NC_008011	CTT	2	6	755503	755508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987054
16026	NC_008011	TAA	2	6	755526	755531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987054
16027	NC_008011	AAT	2	6	755601	755606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987054
16028	NC_008011	T	6	6	755613	755618	0 %	100 %	0 %	0 %	94987054
16029	NC_008011	TGC	2	6	755716	755721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987054
16030	NC_008011	TAA	2	6	755759	755764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987054
16031	NC_008011	AGA	2	6	755776	755781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987054
16032	NC_008011	A	6	6	755781	755786	100 %	0 %	0 %	0 %	94987054
16033	NC_008011	CTT	2	6	755913	755918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987054
16034	NC_008011	AGT	2	6	755936	755941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987054
16035	NC_008011	TCA	2	6	755957	755962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987054
16036	NC_008011	TGT	2	6	756194	756199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987054
16037	NC_008011	AT	3	6	756311	756316	50 %	50 %	0 %	0 %	94987054
16038	NC_008011	TAA	2	6	756398	756403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987055
16039	NC_008011	ATC	2	6	756476	756481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987055
16040	NC_008011	GTAA	2	8	756483	756490	50 %	25 %	25 %	0 %	94987055
16041	NC_008011	TAT	2	6	756493	756498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987055
16042	NC_008011	GAA	2	6	756499	756504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987055
16043	NC_008011	CTT	2	6	756511	756516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987055
16044	NC_008011	AT	3	6	756535	756540	50 %	50 %	0 %	0 %	94987055
16045	NC_008011	GAA	2	6	756556	756561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987055
16046	NC_008011	CT	3	6	756588	756593	0 %	50 %	0 %	50 %	94987055
16047	NC_008011	A	6	6	756618	756623	100 %	0 %	0 %	0 %	94987055
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16052	NC_008011	TGT	2	6	756830	756835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987055
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16054	NC_008011	AT	3	6	756879	756884	50 %	50 %	0 %	0 %	94987055
16055	NC_008011	TGC	2	6	756899	756904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987055
16056	NC_008011	ATA	2	6	756905	756910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987055
16057	NC_008011	CTT	2	6	756973	756978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987055
16058	NC_008011	ACG	2	6	757007	757012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987055
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16060	NC_008011	TAC	2	6	757078	757083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987055
16061	NC_008011	T	6	6	757088	757093	0 %	100 %	0 %	0 %	94987055
16062	NC_008011	TTC	3	9	757118	757126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987055
16063	NC_008011	CT	3	6	757154	757159	0 %	50 %	0 %	50 %	94987055
16064	NC_008011	GTT	2	6	757191	757196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987055
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16066	NC_008011	TCT	2	6	757257	757262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987055
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16070	NC_008011	ATC	2	6	757304	757309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987055
16071	NC_008011	TCT	2	6	757341	757346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987055
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16073	NC_008011	TCA	2	6	757404	757409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987055
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16085	NC_008011	TA	3	6	758916	758921	50 %	50 %	0 %	0 %	94987056
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16088	NC_008011	ATT	2	6	758975	758980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987056
16089	NC_008011	GAAT	2	8	759031	759038	50 %	25 %	25 %	0 %	94987056
16090	NC_008011	TAT	2	6	759729	759734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987057
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16094	NC_008011	A	9	9	759937	759945	100 %	0 %	0 %	0 %	94987057
16095	NC_008011	A	7	7	759957	759963	100 %	0 %	0 %	0 %	94987057
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16102	NC_008011	CAATA	2	10	760120	760129	60 %	20 %	0 %	20 %	94987057
16103	NC_008011	TAA	2	6	760131	760136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987057
16104	NC_008011	GTT	2	6	760174	760179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987057
16105	NC_008011	AATT	2	8	760202	760209	50 %	50 %	0 %	0 %	94987057
16106	NC_008011	AAC	2	6	760262	760267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987057
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16108	NC_008011	TGC	2	6	760428	760433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987057
16109	NC_008011	ACGC	2	8	760457	760464	25 %	0 %	25 %	50 %	94987057
16110	NC_008011	CCT	2	6	760468	760473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987057
16111	NC_008011	A	6	6	760636	760641	100 %	0 %	0 %	0 %	94987058
16112	NC_008011	TA	3	6	760642	760647	50 %	50 %	0 %	0 %	94987058
16113	NC_008011	A	6	6	760647	760652	100 %	0 %	0 %	0 %	94987058
16114	NC_008011	TAG	2	6	760754	760759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987058
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16118	NC_008011	ACTT	2	8	760993	761000	25 %	50 %	0 %	25 %	94987058
16119	NC_008011	ACTT	2	8	761021	761028	25 %	50 %	0 %	25 %	94987058
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16122	NC_008011	CTA	2	6	761172	761177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987058
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16494	NC_008011	TAA	2	6	777692	777697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987071
16495	NC_008011	CTTT	2	8	777715	777722	0 %	75 %	0 %	25 %	94987071
16496	NC_008011	CAT	2	6	777776	777781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987071
16497	NC_008011	T	6	6	777791	777796	0 %	100 %	0 %	0 %	94987071
16498	NC_008011	TTC	2	6	777800	777805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987071
16499	NC_008011	CTG	2	6	777859	777864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987071
16500	NC_008011	CTT	2	6	777889	777894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987071

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