MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008011	TTC	3	9	659940	659948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986981
14002	NC_008011	CTT	2	6	659981	659986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986981
14003	NC_008011	GTT	2	6	659990	659995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986981
14004	NC_008011	T	6	6	660005	660010	0 %	100 %	0 %	0 %	94986981
14005	NC_008011	T	6	6	660058	660063	0 %	100 %	0 %	0 %	94986981
14006	NC_008011	CT	4	8	660086	660093	0 %	50 %	0 %	50 %	94986981
14007	NC_008011	TAA	2	6	660165	660170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986981
14008	NC_008011	TAA	2	6	660189	660194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986981
14009	NC_008011	TTC	2	6	660267	660272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986981
14010	NC_008011	TCT	2	6	660286	660291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986981
14011	NC_008011	CAA	2	6	660320	660325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986981
14012	NC_008011	TGT	2	6	660352	660357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986981
14013	NC_008011	AGAA	2	8	660384	660391	75 %	0 %	25 %	0 %	94986981
14014	NC_008011	T	7	7	660450	660456	0 %	100 %	0 %	0 %	94986982
14015	NC_008011	T	6	6	660485	660490	0 %	100 %	0 %	0 %	94986982
14016	NC_008011	CTG	2	6	660501	660506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986982
14017	NC_008011	A	6	6	660508	660513	100 %	0 %	0 %	0 %	94986982
14018	NC_008011	TAT	2	6	660527	660532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986982
14019	NC_008011	CAT	2	6	660542	660547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986982
14020	NC_008011	GCA	2	6	660550	660555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986982
14021	NC_008011	CAG	2	6	660707	660712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986982
14022	NC_008011	TGC	2	6	660723	660728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986982
14023	NC_008011	ATA	2	6	660748	660753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986982
14024	NC_008011	TAGAA	2	10	660762	660771	60 %	20 %	20 %	0 %	94986982
14025	NC_008011	ATC	2	6	660801	660806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986982
14026	NC_008011	TA	3	6	660824	660829	50 %	50 %	0 %	0 %	94986982
14027	NC_008011	GCTC	2	8	660862	660869	0 %	25 %	25 %	50 %	94986982
14028	NC_008011	GAA	2	6	660886	660891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986982
14029	NC_008011	ACG	2	6	660912	660917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986982
14030	NC_008011	TAA	2	6	660990	660995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986982
14031	NC_008011	CTTT	2	8	660998	661005	0 %	75 %	0 %	25 %	94986982
14032	NC_008011	AGA	2	6	661068	661073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986982
14033	NC_008011	ACA	2	6	661090	661095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986982
14034	NC_008011	CAAT	2	8	661169	661176	50 %	25 %	0 %	25 %	94986982
14035	NC_008011	CAG	2	6	661193	661198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986982
14036	NC_008011	TAA	2	6	661208	661213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986982
14037	NC_008011	CCA	2	6	661240	661245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986982
14038	NC_008011	GCA	2	6	661249	661254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986982
14039	NC_008011	CAC	2	6	661277	661282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986982
14040	NC_008011	AAT	2	6	661332	661337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986982
14041	NC_008011	AGG	2	6	661356	661361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986982
14042	NC_008011	CT	3	6	661452	661457	0 %	50 %	0 %	50 %	94986982
14043	NC_008011	GTAA	2	8	661537	661544	50 %	25 %	25 %	0 %	94986982
14044	NC_008011	ACT	2	6	661567	661572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986982
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14046	NC_008011	AT	3	6	661738	661743	50 %	50 %	0 %	0 %	94986982
14047	NC_008011	ACA	2	6	661842	661847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986983
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14049	NC_008011	CAA	3	9	661894	661902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986983
14050	NC_008011	TTG	2	6	661921	661926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986983
14051	NC_008011	T	6	6	661947	661952	0 %	100 %	0 %	0 %	94986983
14052	NC_008011	TAAC	2	8	661987	661994	50 %	25 %	0 %	25 %	94986983
14053	NC_008011	T	6	6	662075	662080	0 %	100 %	0 %	0 %	94986983
14054	NC_008011	TCA	2	6	662089	662094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986983
14055	NC_008011	ATA	3	9	662140	662148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986983
14056	NC_008011	CTT	2	6	662233	662238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986983
14057	NC_008011	GGA	2	6	662294	662299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986983
14058	NC_008011	AGA	2	6	662306	662311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986983
14059	NC_008011	A	7	7	662311	662317	100 %	0 %	0 %	0 %	94986983
14060	NC_008011	TAA	2	6	662327	662332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986983
14061	NC_008011	TTCT	2	8	662338	662345	0 %	75 %	0 %	25 %	94986983
14062	NC_008011	ATG	3	9	662359	662367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986983
14063	NC_008011	GAA	2	6	662406	662411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986984
14064	NC_008011	TAA	2	6	662442	662447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986984
14065	NC_008011	TCT	2	6	662483	662488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986984
14066	NC_008011	A	6	6	662493	662498	100 %	0 %	0 %	0 %	94986984
14067	NC_008011	A	7	7	662514	662520	100 %	0 %	0 %	0 %	94986984
14068	NC_008011	GAA	2	6	662529	662534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986984
14069	NC_008011	GTT	2	6	662594	662599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986984
14070	NC_008011	AATGG	2	10	662600	662609	40 %	20 %	40 %	0 %	94986984
14071	NC_008011	A	8	8	662624	662631	100 %	0 %	0 %	0 %	94986984
14072	NC_008011	CTG	2	6	662701	662706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986984
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14074	NC_008011	CTT	2	6	662726	662731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986984
14075	NC_008011	CTT	2	6	662819	662824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986984
14076	NC_008011	TTC	2	6	662827	662832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986984
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14078	NC_008011	AAGC	2	8	662898	662905	50 %	0 %	25 %	25 %	94986984
14079	NC_008011	AAG	2	6	662949	662954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986984
14080	NC_008011	TTC	2	6	662959	662964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986984
14081	NC_008011	CATTA	2	10	662977	662986	40 %	40 %	0 %	20 %	94986984
14082	NC_008011	TA	3	6	662985	662990	50 %	50 %	0 %	0 %	94986984
14083	NC_008011	TAT	2	6	663010	663015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986984
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14087	NC_008011	ATT	2	6	663071	663076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986984
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14090	NC_008011	A	7	7	663176	663182	100 %	0 %	0 %	0 %	94986985
14091	NC_008011	TAC	2	6	663399	663404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986985
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14094	NC_008011	T	6	6	663658	663663	0 %	100 %	0 %	0 %	94986985
14095	NC_008011	TTC	2	6	663690	663695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986985
14096	NC_008011	CTT	2	6	663716	663721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986985
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14098	NC_008011	CATTT	2	10	663774	663783	20 %	60 %	0 %	20 %	94986985
14099	NC_008011	AAT	2	6	663837	663842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986985
14100	NC_008011	A	8	8	663846	663853	100 %	0 %	0 %	0 %	94986985
14101	NC_008011	TAA	2	6	663854	663859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986985
14102	NC_008011	T	6	6	663883	663888	0 %	100 %	0 %	0 %	94986985
14103	NC_008011	TA	3	6	663921	663926	50 %	50 %	0 %	0 %	94986985
14104	NC_008011	TCTG	2	8	663927	663934	0 %	50 %	25 %	25 %	94986985
14105	NC_008011	ACTGTA	2	12	663963	663974	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94986986
14106	NC_008011	GCT	2	6	664028	664033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986986
14107	NC_008011	GAT	2	6	664052	664057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986986
14108	NC_008011	ATC	2	6	664114	664119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986986
14109	NC_008011	TCT	2	6	664151	664156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986986
14110	NC_008011	TGG	2	6	664210	664215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986986
14111	NC_008011	CAT	2	6	664242	664247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986986
14112	NC_008011	AGC	2	6	664304	664309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986986
14113	NC_008011	CTC	2	6	665275	665280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986987
14114	NC_008011	TCCTTT	2	12	665293	665304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986987
14115	NC_008011	AT	3	6	665311	665316	50 %	50 %	0 %	0 %	94986987
14116	NC_008011	CTT	3	9	665317	665325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986987
14117	NC_008011	T	6	6	665324	665329	0 %	100 %	0 %	0 %	94986987
14118	NC_008011	T	6	6	665365	665370	0 %	100 %	0 %	0 %	94986987
14119	NC_008011	TCT	3	9	665376	665384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986987
14120	NC_008011	TAA	2	6	665392	665397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986987
14121	NC_008011	GGA	2	6	665403	665408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986987
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14123	NC_008011	TTC	2	6	665435	665440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986987
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