MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008011	AGG	2	6	612111	612116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986943
13002	NC_008011	TAT	2	6	612437	612442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986944
13003	NC_008011	ACC	2	6	612449	612454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986944
13004	NC_008011	CTG	2	6	612471	612476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13005	NC_008011	GAA	2	6	612488	612493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986944
13006	NC_008011	CAA	2	6	612497	612502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986944
13007	NC_008011	AAG	2	6	612519	612524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986944
13008	NC_008011	CTATTG	2	12	612558	612569	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94986944
13009	NC_008011	ATA	2	6	612578	612583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986944
13010	NC_008011	TTC	2	6	612588	612593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986944
13011	NC_008011	T	7	7	612602	612608	0 %	100 %	0 %	0 %	94986944
13012	NC_008011	TAG	2	6	612615	612620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986944
13013	NC_008011	TTTC	2	8	612644	612651	0 %	75 %	0 %	25 %	94986944
13014	NC_008011	GAAT	2	8	612672	612679	50 %	25 %	25 %	0 %	94986944
13015	NC_008011	ACA	2	6	612704	612709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986944
13016	NC_008011	AGC	2	6	612712	612717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13017	NC_008011	CT	3	6	612810	612815	0 %	50 %	0 %	50 %	94986944
13018	NC_008011	CCT	2	6	612823	612828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986944
13019	NC_008011	TAG	2	6	612870	612875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986944
13020	NC_008011	GGA	2	6	612923	612928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986944
13021	NC_008011	CTG	2	6	613011	613016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13022	NC_008011	GCT	2	6	613064	613069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13023	NC_008011	AGC	2	6	613117	613122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13024	NC_008011	ATTT	2	8	613124	613131	25 %	75 %	0 %	0 %	94986944
13025	NC_008011	CAAT	2	8	613145	613152	50 %	25 %	0 %	25 %	94986944
13026	NC_008011	ATG	3	9	613154	613162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986944
13027	NC_008011	TGG	2	6	613177	613182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986944
13028	NC_008011	TAT	2	6	613189	613194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986944
13029	NC_008011	TAT	2	6	613201	613206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986944
13030	NC_008011	CAA	2	6	613338	613343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986944
13031	NC_008011	TAT	2	6	613369	613374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986944
13032	NC_008011	TTA	2	6	613379	613384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986944
13033	NC_008011	ATT	2	6	613417	613422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986944
13034	NC_008011	GTA	2	6	613470	613475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986944
13035	NC_008011	ACA	2	6	613628	613633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986944
13036	NC_008011	TGCT	2	8	613635	613642	0 %	50 %	25 %	25 %	94986944
13037	NC_008011	TGG	2	6	613696	613701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986944
13038	NC_008011	GTAC	2	8	613733	613740	25 %	25 %	25 %	25 %	94986944
13039	NC_008011	ACA	2	6	613772	613777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986944
13040	NC_008011	GAA	2	6	613850	613855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986944
13041	NC_008011	AGG	2	6	613930	613935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986944
13042	NC_008011	ACT	2	6	613936	613941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986944
13043	NC_008011	ATG	2	6	613967	613972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986944
13044	NC_008011	GTT	3	9	613997	614005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986944
13045	NC_008011	CGT	2	6	614012	614017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13046	NC_008011	CTG	2	6	614073	614078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13047	NC_008011	AGC	2	6	614095	614100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13048	NC_008011	ATT	2	6	614150	614155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986944
13049	NC_008011	ATT	2	6	614162	614167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986944
13050	NC_008011	ATTGG	2	10	614169	614178	20 %	40 %	40 %	0 %	94986944
13051	NC_008011	TGC	2	6	614188	614193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13052	NC_008011	CT	3	6	614195	614200	0 %	50 %	0 %	50 %	94986944
13053	NC_008011	A	7	7	614290	614296	100 %	0 %	0 %	0 %	94986944
13054	NC_008011	TGG	2	6	614317	614322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986944
13055	NC_008011	GCT	2	6	614345	614350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986944
13056	NC_008011	ATT	2	6	614420	614425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986944
13057	NC_008011	TAG	2	6	614430	614435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986944
13058	NC_008011	CTT	3	9	614441	614449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986944
13059	NC_008011	AAT	2	6	614751	614756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986945
13060	NC_008011	TGG	2	6	614762	614767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986945
13061	NC_008011	TCT	2	6	614793	614798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986945
13062	NC_008011	TAT	2	6	614884	614889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986945
13063	NC_008011	CAC	2	6	614926	614931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986945
13064	NC_008011	CAA	2	6	614935	614940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986945
13065	NC_008011	AAT	2	6	614941	614946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986945
13066	NC_008011	AGT	2	6	614947	614952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986945
13067	NC_008011	TGC	2	6	614972	614977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986945
13068	NC_008011	TAT	2	6	615040	615045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986945
13069	NC_008011	ATT	2	6	615050	615055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986945
13070	NC_008011	ACG	2	6	615074	615079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986945
13071	NC_008011	ATAA	2	8	615110	615117	75 %	25 %	0 %	0 %	94986945
13072	NC_008011	ACG	2	6	615182	615187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986945
13073	NC_008011	AAT	2	6	615215	615220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986945
13074	NC_008011	GCT	2	6	615238	615243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986945
13075	NC_008011	TAA	2	6	615244	615249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986945
13076	NC_008011	TCC	2	6	615304	615309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986945
13077	NC_008011	CAA	2	6	615331	615336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986945
13078	NC_008011	A	6	6	615399	615404	100 %	0 %	0 %	0 %	94986945
13079	NC_008011	ATGA	2	8	615455	615462	50 %	25 %	25 %	0 %	94986945
13080	NC_008011	CCA	2	6	615521	615526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986945
13081	NC_008011	AAG	2	6	615557	615562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986945
13082	NC_008011	AAG	2	6	615587	615592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986945
13083	NC_008011	TAA	2	6	615616	615621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986945
13084	NC_008011	CTTTA	2	10	615635	615644	20 %	60 %	0 %	20 %	94986945
13085	NC_008011	GGA	2	6	615747	615752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986945
13086	NC_008011	A	6	6	615798	615803	100 %	0 %	0 %	0 %	94986945
13087	NC_008011	A	6	6	615805	615810	100 %	0 %	0 %	0 %	94986945
13088	NC_008011	AAAT	2	8	615838	615845	75 %	25 %	0 %	0 %	94986945
13089	NC_008011	TAAT	2	8	615856	615863	50 %	50 %	0 %	0 %	94986945
13090	NC_008011	GAG	2	6	615885	615890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986945
13091	NC_008011	GGT	3	9	615897	615905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986945
13092	NC_008011	CAG	2	6	615993	615998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986946
13093	NC_008011	T	6	6	616028	616033	0 %	100 %	0 %	0 %	94986946
13094	NC_008011	ACT	2	6	616072	616077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986946
13095	NC_008011	TTTC	2	8	616083	616090	0 %	75 %	0 %	25 %	94986946
13096	NC_008011	ATT	2	6	616109	616114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986946
13097	NC_008011	CTGAC	2	10	616142	616151	20 %	20 %	20 %	40 %	94986946
13098	NC_008011	TAA	2	6	616155	616160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986946
13099	NC_008011	A	6	6	616246	616251	100 %	0 %	0 %	0 %	94986946
13100	NC_008011	TGT	2	6	616261	616266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986946
13101	NC_008011	ATTG	2	8	616274	616281	25 %	50 %	25 %	0 %	94986946
13102	NC_008011	TAA	2	6	617031	617036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986947
13103	NC_008011	GAT	2	6	617042	617047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986947
13104	NC_008011	TTAAA	2	10	617067	617076	60 %	40 %	0 %	0 %	94986947
13105	NC_008011	ATT	2	6	617083	617088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986947
13106	NC_008011	ATG	2	6	617112	617117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986947
13107	NC_008011	ATT	2	6	617132	617137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986947
13108	NC_008011	ACG	2	6	617173	617178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986947
13109	NC_008011	AAGA	2	8	617195	617202	75 %	0 %	25 %	0 %	94986947
13110	NC_008011	TCTT	2	8	617209	617216	0 %	75 %	0 %	25 %	94986947
13111	NC_008011	TACAA	2	10	617227	617236	60 %	20 %	0 %	20 %	94986947
13112	NC_008011	GCT	2	6	617303	617308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986947
13113	NC_008011	CTT	2	6	617357	617362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986947
13114	NC_008011	ATG	2	6	617406	617411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986947
13115	NC_008011	AT	3	6	617428	617433	50 %	50 %	0 %	0 %	94986947
13116	NC_008011	GCA	3	9	617477	617485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986947
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13120	NC_008011	T	6	6	617797	617802	0 %	100 %	0 %	0 %	94986947
13121	NC_008011	TTA	2	6	617949	617954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986948
13122	NC_008011	CTT	2	6	617977	617982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986948
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13244	NC_008011	A	7	7	623776	623782	100 %	0 %	0 %	0 %	94986952
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13494	NC_008011	AAT	2	6	635886	635891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986960
13495	NC_008011	TCTA	2	8	635892	635899	25 %	50 %	0 %	25 %	94986960
13496	NC_008011	TCT	2	6	635944	635949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986960
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