MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_008011	ATA	2	6	538178	538183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986883
11503	NC_008011	TAT	2	6	538284	538289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986884
11504	NC_008011	GAA	2	6	538291	538296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986884
11505	NC_008011	CCA	3	9	538300	538308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986884
11506	NC_008011	AT	3	6	538320	538325	50 %	50 %	0 %	0 %	94986884
11507	NC_008011	TCTT	2	8	538445	538452	0 %	75 %	0 %	25 %	94986884
11508	NC_008011	AT	3	6	538458	538463	50 %	50 %	0 %	0 %	94986884
11509	NC_008011	TTAT	2	8	538520	538527	25 %	75 %	0 %	0 %	94986884
11510	NC_008011	TAA	2	6	538539	538544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986884
11511	NC_008011	TGG	2	6	538588	538593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986884
11512	NC_008011	TATT	2	8	538621	538628	25 %	75 %	0 %	0 %	94986884
11513	NC_008011	TTC	2	6	538708	538713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986884
11514	NC_008011	GGAATG	2	12	538726	538737	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	94986884
11515	NC_008011	TGG	2	6	538809	538814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986884
11516	NC_008011	TAT	2	6	538860	538865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986884
11517	NC_008011	GAA	2	6	538903	538908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986884
11518	NC_008011	ACA	2	6	538921	538926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986884
11519	NC_008011	TAGT	2	8	538928	538935	25 %	50 %	25 %	0 %	94986884
11520	NC_008011	AAC	2	6	538973	538978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986884
11521	NC_008011	TAT	2	6	539003	539008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986885
11522	NC_008011	ATA	2	6	539098	539103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986885
11523	NC_008011	ATT	2	6	539138	539143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986885
11524	NC_008011	AGAT	2	8	539162	539169	50 %	25 %	25 %	0 %	94986885
11525	NC_008011	CCA	2	6	539202	539207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986885
11526	NC_008011	ATT	2	6	539214	539219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986885
11527	NC_008011	CTTAC	2	10	539245	539254	20 %	40 %	0 %	40 %	94986885
11528	NC_008011	ATT	2	6	539295	539300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986885
11529	NC_008011	AGCC	2	8	539306	539313	25 %	0 %	25 %	50 %	94986885
11530	NC_008011	CCAA	2	8	539354	539361	50 %	0 %	0 %	50 %	94986885
11531	NC_008011	CAG	2	6	539470	539475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986885
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11533	NC_008011	AGC	2	6	539495	539500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986885
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11535	NC_008011	ATT	2	6	540435	540440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986886
11536	NC_008011	A	8	8	540459	540466	100 %	0 %	0 %	0 %	94986886
11537	NC_008011	AATA	2	8	540479	540486	75 %	25 %	0 %	0 %	94986886
11538	NC_008011	TTA	2	6	540589	540594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986886
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11540	NC_008011	CTT	2	6	540719	540724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986887
11541	NC_008011	GTG	2	6	540737	540742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986887
11542	NC_008011	AT	3	6	540757	540762	50 %	50 %	0 %	0 %	94986887
11543	NC_008011	A	7	7	540840	540846	100 %	0 %	0 %	0 %	94986887
11544	NC_008011	CAAAA	2	10	540887	540896	80 %	0 %	0 %	20 %	94986887
11545	NC_008011	A	6	6	540893	540898	100 %	0 %	0 %	0 %	94986887
11546	NC_008011	ATT	2	6	540912	540917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986887
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11549	NC_008011	A	7	7	541141	541147	100 %	0 %	0 %	0 %	94986887
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11552	NC_008011	ATT	2	6	541296	541301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986887
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11555	NC_008011	AGG	2	6	541554	541559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986887
11556	NC_008011	ATT	2	6	541588	541593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986887
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11558	NC_008011	GAA	2	6	541663	541668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986887
11559	NC_008011	CAA	2	6	541696	541701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986887
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11561	NC_008011	ATG	2	6	541893	541898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986888
11562	NC_008011	GTT	2	6	542010	542015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986888
11563	NC_008011	A	6	6	542029	542034	100 %	0 %	0 %	0 %	94986888
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11571	NC_008011	TTA	2	6	542399	542404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986889
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11594	NC_008011	CAT	2	6	543268	543273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986889
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11596	NC_008011	TA	3	6	543359	543364	50 %	50 %	0 %	0 %	94986889
11597	NC_008011	GCT	2	6	543387	543392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986889
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11601	NC_008011	GCA	2	6	543481	543486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986889
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11609	NC_008011	CT	3	6	544052	544057	0 %	50 %	0 %	50 %	94986891
11610	NC_008011	TTC	2	6	544060	544065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986891
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11992	NC_008011	TCT	2	6	561214	561219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986907
11993	NC_008011	GTT	2	6	561226	561231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986907
11994	NC_008011	C	6	6	561340	561345	0 %	0 %	0 %	100 %	94986907
11995	NC_008011	TC	3	6	561379	561384	0 %	50 %	0 %	50 %	94986907
11996	NC_008011	TGC	2	6	561393	561398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986907
11997	NC_008011	CAG	2	6	561446	561451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986907
11998	NC_008011	CAA	2	6	561482	561487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986907
11999	NC_008011	TTG	2	6	561533	561538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986907
12000	NC_008011	AAT	2	6	561555	561560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986907

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