MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_008011	TG	3	6	469889	469894	0 %	50 %	50 %	0 %	94986822
10003	NC_008011	TC	3	6	469907	469912	0 %	50 %	0 %	50 %	94986822
10004	NC_008011	A	6	6	469927	469932	100 %	0 %	0 %	0 %	94986822
10005	NC_008011	TGA	2	6	469938	469943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986822
10006	NC_008011	ATA	2	6	469973	469978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986822
10007	NC_008011	ATG	2	6	469979	469984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986822
10008	NC_008011	CTA	2	6	470054	470059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986822
10009	NC_008011	TAG	2	6	470165	470170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986822
10010	NC_008011	TCA	2	6	470200	470205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986822
10011	NC_008011	TGC	2	6	470247	470252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986822
10012	NC_008011	CGTGAA	2	12	470305	470316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94986822
10013	NC_008011	GAA	2	6	470338	470343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986822
10014	NC_008011	A	6	6	470366	470371	100 %	0 %	0 %	0 %	94986822
10015	NC_008011	A	7	7	470388	470394	100 %	0 %	0 %	0 %	94986822
10016	NC_008011	GTTT	2	8	470407	470414	0 %	75 %	25 %	0 %	94986822
10017	NC_008011	AT	3	6	470427	470432	50 %	50 %	0 %	0 %	94986822
10018	NC_008011	TGA	2	6	470436	470441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986822
10019	NC_008011	A	7	7	470466	470472	100 %	0 %	0 %	0 %	94986822
10020	NC_008011	TAT	2	6	470502	470507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986822
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10022	NC_008011	AAG	2	6	470725	470730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986823
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10025	NC_008011	A	6	6	470864	470869	100 %	0 %	0 %	0 %	94986823
10026	NC_008011	TGAT	2	8	470920	470927	25 %	50 %	25 %	0 %	94986823
10027	NC_008011	TAT	2	6	471008	471013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986823
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10031	NC_008011	TGA	2	6	471212	471217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986823
10032	NC_008011	GAG	2	6	471283	471288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986823
10033	NC_008011	TGA	2	6	471314	471319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986823
10034	NC_008011	CTT	2	6	471333	471338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986823
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10038	NC_008011	TA	3	6	471453	471458	50 %	50 %	0 %	0 %	94986823
10039	NC_008011	A	8	8	471482	471489	100 %	0 %	0 %	0 %	94986823
10040	NC_008011	TAT	2	6	471504	471509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986823
10041	NC_008011	ATA	2	6	471514	471519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986823
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10051	NC_008011	TAG	2	6	471943	471948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986824
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10054	NC_008011	ATGA	2	8	472080	472087	50 %	25 %	25 %	0 %	94986824
10055	NC_008011	ATA	3	9	472153	472161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986824
10056	NC_008011	GTA	2	6	472171	472176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986824
10057	NC_008011	CAA	2	6	472207	472212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986824
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10059	NC_008011	AC	3	6	472258	472263	50 %	0 %	0 %	50 %	94986824
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10061	NC_008011	AT	3	6	472375	472380	50 %	50 %	0 %	0 %	94986824
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10091	NC_008011	A	7	7	473468	473474	100 %	0 %	0 %	0 %	94986825
10092	NC_008011	AT	3	6	473540	473545	50 %	50 %	0 %	0 %	94986825
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10099	NC_008011	A	8	8	473889	473896	100 %	0 %	0 %	0 %	94986826
10100	NC_008011	TTCT	2	8	473913	473920	0 %	75 %	0 %	25 %	94986826
10101	NC_008011	AAG	2	6	473934	473939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986826
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10103	NC_008011	TTA	2	6	473994	473999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986826
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10105	NC_008011	TAC	2	6	474031	474036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986826
10106	NC_008011	GCT	2	6	474044	474049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986826
10107	NC_008011	TTA	2	6	474084	474089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986826
10108	NC_008011	CAA	2	6	474093	474098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986826
10109	NC_008011	TGA	2	6	474136	474141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986826
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10111	NC_008011	CGT	2	6	474182	474187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986826
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10494	NC_008011	T	7	7	491151	491157	0 %	100 %	0 %	0 %	94986843
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10499	NC_008011	A	7	7	491221	491227	100 %	0 %	0 %	0 %	94986843
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