MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_008011	CTT	2	6	379870	379875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986746
8003	NC_008011	TAAA	2	8	379907	379914	75 %	25 %	0 %	0 %	94986746
8004	NC_008011	T	7	7	379940	379946	0 %	100 %	0 %	0 %	94986746
8005	NC_008011	AGA	2	6	379962	379967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986746
8006	NC_008011	CTT	2	6	379996	380001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986746
8007	NC_008011	TAT	2	6	380005	380010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986746
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8011	NC_008011	TTC	2	6	380132	380137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986747
8012	NC_008011	TAA	2	6	380188	380193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986747
8013	NC_008011	GTT	2	6	380263	380268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986747
8014	NC_008011	TCT	2	6	380289	380294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986747
8015	NC_008011	CTTTTG	2	12	380323	380334	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	94986747
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8017	NC_008011	ACT	2	6	380355	380360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986747
8018	NC_008011	AGC	2	6	380393	380398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986747
8019	NC_008011	AGG	2	6	380420	380425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986747
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8022	NC_008011	TCT	2	6	380493	380498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986747
8023	NC_008011	TTTC	2	8	380500	380507	0 %	75 %	0 %	25 %	94986747
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8043	NC_008011	A	6	6	381543	381548	100 %	0 %	0 %	0 %	94986748
8044	NC_008011	AAT	2	6	381554	381559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986748
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8055	NC_008011	TA	4	8	381812	381819	50 %	50 %	0 %	0 %	94986748
8056	NC_008011	TA	3	6	381827	381832	50 %	50 %	0 %	0 %	94986748
8057	NC_008011	A	6	6	381856	381861	100 %	0 %	0 %	0 %	94986748
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8063	NC_008011	AT	3	6	382037	382042	50 %	50 %	0 %	0 %	94986748
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8121	NC_008011	TAG	2	6	384540	384545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986749
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