MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 30963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_008011	A	6	6	270116	270121	100 %	0 %	0 %	0 %	94986657
5503	NC_008011	TCG	2	6	270529	270534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986658
5504	NC_008011	A	6	6	270539	270544	100 %	0 %	0 %	0 %	94986658
5505	NC_008011	AT	3	6	270634	270639	50 %	50 %	0 %	0 %	94986658
5506	NC_008011	GAA	2	6	270642	270647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986658
5507	NC_008011	TCTT	2	8	270715	270722	0 %	75 %	0 %	25 %	94986658
5508	NC_008011	ATG	2	6	270731	270736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986658
5509	NC_008011	AGA	2	6	270805	270810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986658
5510	NC_008011	TAG	2	6	270822	270827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986658
5511	NC_008011	ATTA	2	8	270849	270856	50 %	50 %	0 %	0 %	94986658
5512	NC_008011	A	8	8	270979	270986	100 %	0 %	0 %	0 %	94986659
5513	NC_008011	T	6	6	271035	271040	0 %	100 %	0 %	0 %	94986659
5514	NC_008011	TGC	2	6	271059	271064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986659
5515	NC_008011	AGT	2	6	271107	271112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986659
5516	NC_008011	AAC	2	6	271188	271193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986659
5517	NC_008011	AGA	2	6	271278	271283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986659
5518	NC_008011	ACAT	2	8	271443	271450	50 %	25 %	0 %	25 %	94986659
5519	NC_008011	A	7	7	271476	271482	100 %	0 %	0 %	0 %	94986659
5520	NC_008011	ATT	2	6	271498	271503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986659
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5522	NC_008011	TTG	3	9	271574	271582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986659
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5524	NC_008011	T	6	6	271677	271682	0 %	100 %	0 %	0 %	94986659
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5529	NC_008011	TA	3	6	271854	271859	50 %	50 %	0 %	0 %	94986659
5530	NC_008011	T	6	6	271933	271938	0 %	100 %	0 %	0 %	94986659
5531	NC_008011	TTA	2	6	272017	272022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986660
5532	NC_008011	ATA	2	6	272129	272134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986660
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5535	NC_008011	CTA	2	6	272291	272296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986660
5536	NC_008011	TAC	2	6	272301	272306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986660
5537	NC_008011	A	8	8	272328	272335	100 %	0 %	0 %	0 %	94986660
5538	NC_008011	AGAATT	2	12	272382	272393	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94986660
5539	NC_008011	GAT	2	6	272398	272403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986660
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5541	NC_008011	AGA	2	6	272427	272432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986660
5542	NC_008011	GAG	2	6	272510	272515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986660
5543	NC_008011	A	6	6	272622	272627	100 %	0 %	0 %	0 %	94986660
5544	NC_008011	TCT	2	6	272644	272649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986660
5545	NC_008011	A	6	6	272650	272655	100 %	0 %	0 %	0 %	94986660
5546	NC_008011	TCA	2	6	272662	272667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986660
5547	NC_008011	AT	3	6	272690	272695	50 %	50 %	0 %	0 %	94986660
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5555	NC_008011	A	6	6	273006	273011	100 %	0 %	0 %	0 %	94986660
5556	NC_008011	TAA	2	6	273141	273146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986660
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5559	NC_008011	TAT	2	6	273231	273236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986660
5560	NC_008011	AT	3	6	273347	273352	50 %	50 %	0 %	0 %	94986660
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5590	NC_008011	A	7	7	274363	274369	100 %	0 %	0 %	0 %	94986660
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5594	NC_008011	TA	3	6	274479	274484	50 %	50 %	0 %	0 %	94986661
5595	NC_008011	AGC	2	6	274495	274500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986661
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5598	NC_008011	TACT	2	8	274634	274641	25 %	50 %	0 %	25 %	94986661
5599	NC_008011	CAAA	2	8	274715	274722	75 %	0 %	0 %	25 %	94986661
5600	NC_008011	A	6	6	274720	274725	100 %	0 %	0 %	0 %	94986661
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5604	NC_008011	TA	4	8	274830	274837	50 %	50 %	0 %	0 %	94986661
5605	NC_008011	ACT	2	6	274843	274848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986661
5606	NC_008011	ATCTC	2	10	275100	275109	20 %	40 %	0 %	40 %	94986662
5607	NC_008011	CTG	2	6	275137	275142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986662
5608	NC_008011	TTG	2	6	275155	275160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986662
5609	NC_008011	GTT	2	6	275193	275198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986662
5610	NC_008011	CCT	2	6	275251	275256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986662
5611	NC_008011	AT	3	6	275270	275275	50 %	50 %	0 %	0 %	94986662
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5616	NC_008011	GAT	2	6	275378	275383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986662
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5618	NC_008011	A	6	6	275395	275400	100 %	0 %	0 %	0 %	94986662
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5620	NC_008011	TTC	2	6	275486	275491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986662
5621	NC_008011	T	6	6	275493	275498	0 %	100 %	0 %	0 %	94986662
5622	NC_008011	TGC	2	6	275802	275807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986663
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