MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_007576	TGA	2	6	1850899	1850904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81429473
33502	NC_007576	TGA	2	6	1850908	1850913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81429473
33503	NC_007576	CCA	2	6	1850946	1850951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81429473
33504	NC_007576	AGCC	2	8	1850983	1850990	25 %	0 %	25 %	50 %	81429473
33505	NC_007576	AACGC	2	10	1851088	1851097	40 %	0 %	20 %	40 %	81429474
33506	NC_007576	TAC	2	6	1851160	1851165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429474
33507	NC_007576	CGT	2	6	1851179	1851184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429474
33508	NC_007576	CAAA	2	8	1851189	1851196	75 %	0 %	0 %	25 %	81429474
33509	NC_007576	ATA	2	6	1851207	1851212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429474
33510	NC_007576	CAA	2	6	1851220	1851225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81429474
33511	NC_007576	ATA	3	9	1851226	1851234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429474
33512	NC_007576	CAAT	2	8	1851309	1851316	50 %	25 %	0 %	25 %	81429474
33513	NC_007576	ATT	2	6	1851443	1851448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81429475
33514	NC_007576	TTG	2	6	1851458	1851463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429475
33515	NC_007576	ACCA	2	8	1851531	1851538	50 %	0 %	0 %	50 %	81429475
33516	NC_007576	TCA	2	6	1851621	1851626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429475
33517	NC_007576	AACGC	2	10	1851648	1851657	40 %	0 %	20 %	40 %	81429475
33518	NC_007576	GCC	2	6	1851786	1851791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81429475
33519	NC_007576	TAA	2	6	1851855	1851860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429475
33520	NC_007576	GC	3	6	1851869	1851874	0 %	0 %	50 %	50 %	81429475
33521	NC_007576	CTG	2	6	1851884	1851889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429475
33522	NC_007576	CGT	2	6	1851923	1851928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429475
33523	NC_007576	TTTG	2	8	1851961	1851968	0 %	75 %	25 %	0 %	81429475
33524	NC_007576	GTG	2	6	1852046	1852051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81429476
33525	NC_007576	GACC	2	8	1852064	1852071	25 %	0 %	25 %	50 %	81429476
33526	NC_007576	TTGG	2	8	1852078	1852085	0 %	50 %	50 %	0 %	81429476
33527	NC_007576	GGCT	2	8	1852301	1852308	0 %	25 %	50 %	25 %	81429476
33528	NC_007576	ACG	2	6	1852332	1852337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429476
33529	NC_007576	CAG	2	6	1852463	1852468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429476
33530	NC_007576	TGC	2	6	1852726	1852731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429477
33531	NC_007576	GGCC	2	8	1852819	1852826	0 %	0 %	50 %	50 %	81429477
33532	NC_007576	CCA	2	6	1852854	1852859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81429477
33533	NC_007576	TGA	2	6	1852981	1852986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81429477
33534	NC_007576	A	6	6	1853081	1853086	100 %	0 %	0 %	0 %	81429477
33535	NC_007576	CGT	2	6	1853173	1853178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429477
33536	NC_007576	GTC	2	6	1853195	1853200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429477
33537	NC_007576	ATA	2	6	1853272	1853277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429477
33538	NC_007576	T	7	7	1853303	1853309	0 %	100 %	0 %	0 %	81429478
33539	NC_007576	AAT	2	6	1853332	1853337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429478
33540	NC_007576	GCT	4	12	1853348	1853359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429478
33541	NC_007576	TCGT	2	8	1853398	1853405	0 %	50 %	25 %	25 %	81429478
33542	NC_007576	CGC	2	6	1853419	1853424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81429478
33543	NC_007576	GTG	2	6	1853454	1853459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81429478
33544	NC_007576	TGG	2	6	1853480	1853485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81429478
33545	NC_007576	TGC	2	6	1853503	1853508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429478
33546	NC_007576	AAGT	2	8	1853534	1853541	50 %	25 %	25 %	0 %	81429478
33547	NC_007576	CGT	2	6	1853551	1853556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429478
33548	NC_007576	TCG	2	6	1853580	1853585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429478
33549	NC_007576	CTTG	2	8	1853628	1853635	0 %	50 %	25 %	25 %	81429478
33550	NC_007576	CTT	2	6	1853661	1853666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429478
33551	NC_007576	TGT	2	6	1853699	1853704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429478
33552	NC_007576	TTG	2	6	1853803	1853808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429478
33553	NC_007576	GT	3	6	1853839	1853844	0 %	50 %	50 %	0 %	81429478
33554	NC_007576	CTG	2	6	1853853	1853858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429478
33555	NC_007576	CTG	2	6	1853875	1853880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81429478
33556	NC_007576	CCG	2	6	1853979	1853984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81429478
33557	NC_007576	ATA	2	6	1854007	1854012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429478
33558	NC_007576	TTG	2	6	1854140	1854145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429479
33559	NC_007576	CG	3	6	1854183	1854188	0 %	0 %	50 %	50 %	81429479
33560	NC_007576	GAC	2	6	1854274	1854279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429479
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33562	NC_007576	GC	3	6	1854376	1854381	0 %	0 %	50 %	50 %	81429479
33563	NC_007576	GGT	2	6	1854394	1854399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81429479
33564	NC_007576	TCT	2	6	1854492	1854497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429479
33565	NC_007576	TGA	2	6	1854521	1854526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81429479
33566	NC_007576	GCCG	2	8	1854544	1854551	0 %	0 %	50 %	50 %	81429479
33567	NC_007576	TGG	2	6	1854655	1854660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81429479
33568	NC_007576	T	6	6	1854694	1854699	0 %	100 %	0 %	0 %	81429479
33569	NC_007576	TGGT	2	8	1854728	1854735	0 %	50 %	50 %	0 %	81429479
33570	NC_007576	TTGG	2	8	1854737	1854744	0 %	50 %	50 %	0 %	81429479
33571	NC_007576	GATA	2	8	1854786	1854793	50 %	25 %	25 %	0 %	81429479
33572	NC_007576	AAG	2	6	1854824	1854829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81429479
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33574	NC_007576	CAT	2	6	1854861	1854866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429479
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33578	NC_007576	GC	3	6	1855068	1855073	0 %	0 %	50 %	50 %	81429479
33579	NC_007576	ACT	2	6	1855112	1855117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429479
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33585	NC_007576	CAA	2	6	1855276	1855281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81429479
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33587	NC_007576	GTAT	2	8	1855354	1855361	25 %	50 %	25 %	0 %	81429479
33588	NC_007576	AAT	2	6	1855439	1855444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429479
33589	NC_007576	ACG	2	6	1855458	1855463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81429479
33590	NC_007576	AAT	2	6	1855528	1855533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429479
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33592	NC_007576	AAT	2	6	1855610	1855615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429479
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33598	NC_007576	GATG	2	8	1855785	1855792	25 %	25 %	50 %	0 %	81429480
33599	NC_007576	AAC	2	6	1855824	1855829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81429480
33600	NC_007576	GTTG	2	8	1855873	1855880	0 %	50 %	50 %	0 %	81429480
33601	NC_007576	GGTT	2	8	1855921	1855928	0 %	50 %	50 %	0 %	81429480
33602	NC_007576	TAC	2	6	1855961	1855966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81429480
33603	NC_007576	CCGC	2	8	1855967	1855974	0 %	0 %	25 %	75 %	81429480
33604	NC_007576	CTT	2	6	1856006	1856011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429480
33605	NC_007576	TCATG	2	10	1856012	1856021	20 %	40 %	20 %	20 %	81429480
33606	NC_007576	TAT	2	6	1856039	1856044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81429480
33607	NC_007576	TGCG	2	8	1856083	1856090	0 %	25 %	50 %	25 %	81429480
33608	NC_007576	AAT	2	6	1856160	1856165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81429480
33609	NC_007576	TGT	2	6	1856176	1856181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81429480
33610	NC_007576	AG	3	6	1856190	1856195	50 %	0 %	50 %	0 %	81429480
33611	NC_007576	GC	3	6	1856260	1856265	0 %	0 %	50 %	50 %	81429480
33612	NC_007576	TTC	2	6	1856319	1856324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81429480
33613	NC_007576	TCAA	2	8	1856446	1856453	50 %	25 %	0 %	25 %	81429480
33614	NC_007576	CG	3	6	1856553	1856558	0 %	0 %	50 %	50 %	81429480
33615	NC_007576	GGC	2	6	1856793	1856798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81429481
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33732	NC_007576	CCAA	2	8	1862635	1862642	50 %	0 %	0 %	50 %	81429486
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