MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_007576	GCT	2	6	1172010	1172015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428800
21003	NC_007576	TTC	2	6	1172028	1172033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428800
21004	NC_007576	GAA	2	6	1172054	1172059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428800
21005	NC_007576	AATC	2	8	1172132	1172139	50 %	25 %	0 %	25 %	81428800
21006	NC_007576	ATA	2	6	1172182	1172187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428800
21007	NC_007576	TCA	2	6	1172188	1172193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428800
21008	NC_007576	GAA	2	6	1172222	1172227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428800
21009	NC_007576	ATC	2	6	1172394	1172399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428800
21010	NC_007576	ATC	2	6	1172403	1172408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428800
21011	NC_007576	GAT	2	6	1172448	1172453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428800
21012	NC_007576	ATT	2	6	1172464	1172469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428800
21013	NC_007576	GAT	2	6	1172501	1172506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428800
21014	NC_007576	AATC	2	8	1172527	1172534	50 %	25 %	0 %	25 %	81428800
21015	NC_007576	TTC	2	6	1172543	1172548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428800
21016	NC_007576	GTA	2	6	1172638	1172643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428800
21017	NC_007576	GAA	2	6	1172652	1172657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428800
21018	NC_007576	ATG	2	6	1172710	1172715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428800
21019	NC_007576	TTC	2	6	1172754	1172759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428800
21020	NC_007576	ATG	2	6	1172767	1172772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428800
21021	NC_007576	ATT	2	6	1172798	1172803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428800
21022	NC_007576	AGT	2	6	1173057	1173062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428801
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21024	NC_007576	AACGT	2	10	1173075	1173084	40 %	20 %	20 %	20 %	81428801
21025	NC_007576	ATCA	2	8	1173127	1173134	50 %	25 %	0 %	25 %	81428801
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21031	NC_007576	ATA	2	6	1173314	1173319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428801
21032	NC_007576	TAA	2	6	1173334	1173339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428801
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21035	NC_007576	TAAAA	2	10	1173523	1173532	80 %	20 %	0 %	0 %	81428801
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21040	NC_007576	GCG	2	6	1173966	1173971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428802
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21042	NC_007576	CAT	3	9	1174189	1174197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428802
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21044	NC_007576	T	7	7	1174253	1174259	0 %	100 %	0 %	0 %	81428802
21045	NC_007576	ATCAC	2	10	1174416	1174425	40 %	20 %	0 %	40 %	81428803
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21051	NC_007576	CAA	2	6	1174612	1174617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428803
21052	NC_007576	A	7	7	1174616	1174622	100 %	0 %	0 %	0 %	81428803
21053	NC_007576	AAT	2	6	1174656	1174661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428803
21054	NC_007576	TAT	2	6	1174710	1174715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428804
21055	NC_007576	CAT	2	6	1174780	1174785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428804
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21057	NC_007576	GC	3	6	1174880	1174885	0 %	0 %	50 %	50 %	81428804
21058	NC_007576	CCCTT	2	10	1174950	1174959	0 %	40 %	0 %	60 %	81428804
21059	NC_007576	GGA	2	6	1174966	1174971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81428804
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21062	NC_007576	CCGT	2	8	1175166	1175173	0 %	25 %	25 %	50 %	81428805
21063	NC_007576	GTTG	2	8	1175214	1175221	0 %	50 %	50 %	0 %	81428805
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21067	NC_007576	CAA	2	6	1175374	1175379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428805
21068	NC_007576	CTG	3	9	1175380	1175388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428805
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21072	NC_007576	A	6	6	1175985	1175990	100 %	0 %	0 %	0 %	81428806
21073	NC_007576	ACG	2	6	1176024	1176029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428806
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21104	NC_007576	TTTA	2	8	1177475	1177482	25 %	75 %	0 %	0 %	81428808
21105	NC_007576	T	6	6	1177498	1177503	0 %	100 %	0 %	0 %	81428808
21106	NC_007576	CAT	2	6	1177513	1177518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428808
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21110	NC_007576	A	6	6	1177686	1177691	100 %	0 %	0 %	0 %	81428808
21111	NC_007576	ATAAA	2	10	1177716	1177725	80 %	20 %	0 %	0 %	81428808
21112	NC_007576	TTGC	2	8	1177729	1177736	0 %	50 %	25 %	25 %	81428808
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21118	NC_007576	T	6	6	1178193	1178198	0 %	100 %	0 %	0 %	81428809
21119	NC_007576	TGG	2	6	1178242	1178247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428809
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21121	NC_007576	TTG	2	6	1178308	1178313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428809
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21230	NC_007576	T	7	7	1184227	1184233	0 %	100 %	0 %	0 %	81428815
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21234	NC_007576	CTG	2	6	1184343	1184348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428815
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21240	NC_007576	TGA	2	6	1184867	1184872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428815
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21352	NC_007576	TC	3	6	1190502	1190507	0 %	50 %	0 %	50 %	81428819
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21473	NC_007576	CTTAAT	2	12	1196175	1196186	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	81428825
21474	NC_007576	TAT	2	6	1196256	1196261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428825
21475	NC_007576	TTAT	2	8	1196290	1196297	25 %	75 %	0 %	0 %	81428825
21476	NC_007576	TTA	2	6	1196349	1196354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428826
21477	NC_007576	ATG	2	6	1196442	1196447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428826
21478	NC_007576	TGA	2	6	1196461	1196466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428826
21479	NC_007576	TTC	2	6	1196506	1196511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428826
21480	NC_007576	ATCCCA	2	12	1196569	1196580	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	81428826
21481	NC_007576	ATAG	2	8	1196712	1196719	50 %	25 %	25 %	0 %	81428826
21482	NC_007576	CTT	3	9	1196723	1196731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428826
21483	NC_007576	CCG	2	6	1196762	1196767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428826
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21487	NC_007576	AATTT	2	10	1196833	1196842	40 %	60 %	0 %	0 %	81428826
21488	NC_007576	TCT	2	6	1196941	1196946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428826
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21490	NC_007576	GAC	2	6	1197035	1197040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428826
21491	NC_007576	TCT	2	6	1197046	1197051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428826
21492	NC_007576	GTCG	2	8	1197105	1197112	0 %	25 %	50 %	25 %	81428826
21493	NC_007576	ATC	2	6	1197117	1197122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428826
21494	NC_007576	GC	3	6	1197222	1197227	0 %	0 %	50 %	50 %	81428826
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21500	NC_007576	TTGATC	2	12	1197393	1197404	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	81428826

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