MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_007576	GCT	2	6	1035877	1035882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428655
18502	NC_007576	TTA	2	6	1035964	1035969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428655
18503	NC_007576	CAT	2	6	1035974	1035979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428655
18504	NC_007576	T	6	6	1035984	1035989	0 %	100 %	0 %	0 %	81428655
18505	NC_007576	GTT	2	6	1036190	1036195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428655
18506	NC_007576	AAT	2	6	1036230	1036235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428655
18507	NC_007576	GCA	2	6	1036270	1036275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428655
18508	NC_007576	ATC	2	6	1036303	1036308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428655
18509	NC_007576	AAAT	2	8	1036324	1036331	75 %	25 %	0 %	0 %	81428655
18510	NC_007576	CAA	2	6	1036406	1036411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428655
18511	NC_007576	CATT	2	8	1036481	1036488	25 %	50 %	0 %	25 %	81428655
18512	NC_007576	AAT	2	6	1036560	1036565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428655
18513	NC_007576	AGC	2	6	1036605	1036610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428655
18514	NC_007576	CCA	2	6	1036613	1036618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428655
18515	NC_007576	GAT	2	6	1036676	1036681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428655
18516	NC_007576	TAA	2	6	1036722	1036727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428655
18517	NC_007576	AAT	2	6	1036761	1036766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428655
18518	NC_007576	CGACAA	2	12	1036772	1036783	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	81428655
18519	NC_007576	ATT	2	6	1036848	1036853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428655
18520	NC_007576	CCA	2	6	1036893	1036898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428655
18521	NC_007576	ATA	2	6	1036924	1036929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428655
18522	NC_007576	ACA	2	6	1036991	1036996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428655
18523	NC_007576	CGT	2	6	1037029	1037034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428655
18524	NC_007576	ACC	2	6	1037113	1037118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428655
18525	NC_007576	ACC	2	6	1037142	1037147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428655
18526	NC_007576	TAT	2	6	1037398	1037403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428656
18527	NC_007576	CAT	2	6	1037447	1037452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428656
18528	NC_007576	TGA	2	6	1037527	1037532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428656
18529	NC_007576	TTGATA	2	12	1037631	1037642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	81428656
18530	NC_007576	CTT	2	6	1037660	1037665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428656
18531	NC_007576	CTG	2	6	1037687	1037692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428656
18532	NC_007576	TAA	2	6	1037700	1037705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428656
18533	NC_007576	TCA	2	6	1037720	1037725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428656
18534	NC_007576	GCT	2	6	1037788	1037793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428656
18535	NC_007576	TTTG	2	8	1037798	1037805	0 %	75 %	25 %	0 %	81428656
18536	NC_007576	TAA	2	6	1037814	1037819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428656
18537	NC_007576	TTG	2	6	1037913	1037918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428656
18538	NC_007576	AAC	2	6	1037973	1037978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428656
18539	NC_007576	CAT	2	6	1038080	1038085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428656
18540	NC_007576	TGT	2	6	1038117	1038122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428656
18541	NC_007576	ACA	2	6	1038160	1038165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428656
18542	NC_007576	CCTGG	2	10	1038251	1038260	0 %	20 %	40 %	40 %	81428656
18543	NC_007576	CCA	2	6	1038325	1038330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428656
18544	NC_007576	ACC	2	6	1038483	1038488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428656
18545	NC_007576	TGA	2	6	1038505	1038510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428656
18546	NC_007576	ACC	2	6	1038567	1038572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428656
18547	NC_007576	ACC	2	6	1038576	1038581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428656
18548	NC_007576	ACG	2	6	1038621	1038626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428656
18549	NC_007576	CGC	2	6	1038644	1038649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428656
18550	NC_007576	ATT	2	6	1038691	1038696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428656
18551	NC_007576	TAA	2	6	1038902	1038907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428657
18552	NC_007576	AAT	2	6	1038909	1038914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428657
18553	NC_007576	CAT	2	6	1038952	1038957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428657
18554	NC_007576	TCAA	2	8	1039017	1039024	50 %	25 %	0 %	25 %	81428657
18555	NC_007576	TTG	2	6	1039096	1039101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428657
18556	NC_007576	CAC	2	6	1039126	1039131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428657
18557	NC_007576	ATA	2	6	1039153	1039158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428657
18558	NC_007576	TCA	2	6	1039167	1039172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428657
18559	NC_007576	ATCA	2	8	1039193	1039200	50 %	25 %	0 %	25 %	81428657
18560	NC_007576	CAA	2	6	1039273	1039278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428657
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18562	NC_007576	AAG	2	6	1039464	1039469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428657
18563	NC_007576	ATA	2	6	1039548	1039553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428657
18564	NC_007576	CTT	3	9	1039627	1039635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428657
18565	NC_007576	GAA	2	6	1039685	1039690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428657
18566	NC_007576	ATC	2	6	1039697	1039702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428657
18567	NC_007576	GTT	2	6	1039717	1039722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428657
18568	NC_007576	CAAA	2	8	1039723	1039730	75 %	0 %	0 %	25 %	81428657
18569	NC_007576	ATC	2	6	1039746	1039751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428657
18570	NC_007576	CAC	2	6	1039819	1039824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428657
18571	NC_007576	TAA	2	6	1039832	1039837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428657
18572	NC_007576	AGA	2	6	1040153	1040158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428658
18573	NC_007576	ACA	3	9	1040186	1040194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428658
18574	NC_007576	GTC	2	6	1040199	1040204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428658
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18577	NC_007576	GAA	2	6	1040274	1040279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428658
18578	NC_007576	A	6	6	1040353	1040358	100 %	0 %	0 %	0 %	81428658
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18580	NC_007576	ATCT	2	8	1040430	1040437	25 %	50 %	0 %	25 %	81428658
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18583	NC_007576	TAAC	2	8	1040503	1040510	50 %	25 %	0 %	25 %	81428658
18584	NC_007576	ATC	2	6	1040539	1040544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428658
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18598	NC_007576	AC	3	6	1041468	1041473	50 %	0 %	0 %	50 %	81428659
18599	NC_007576	ATC	2	6	1041494	1041499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428659
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18601	NC_007576	GCT	2	6	1041698	1041703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428659
18602	NC_007576	CTTG	2	8	1041716	1041723	0 %	50 %	25 %	25 %	81428659
18603	NC_007576	AGA	2	6	1041745	1041750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428659
18604	NC_007576	CA	3	6	1041799	1041804	50 %	0 %	0 %	50 %	81428659
18605	NC_007576	TAT	2	6	1041835	1041840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428660
18606	NC_007576	GAT	2	6	1041871	1041876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428660
18607	NC_007576	AAG	2	6	1041900	1041905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428660
18608	NC_007576	TGA	2	6	1041913	1041918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428660
18609	NC_007576	GAT	2	6	1041956	1041961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428660
18610	NC_007576	ATC	2	6	1042000	1042005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428660
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18612	NC_007576	TGC	2	6	1042147	1042152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428660
18613	NC_007576	TCA	2	6	1042199	1042204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428660
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18615	NC_007576	GAA	2	6	1042316	1042321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428660
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