MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_007576	TTCAAT	2	12	1008356	1008367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	81428628
18003	NC_007576	TAATTC	2	12	1008374	1008385	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	81428628
18004	NC_007576	ACGA	2	8	1008410	1008417	50 %	0 %	25 %	25 %	81428628
18005	NC_007576	CAA	2	6	1008466	1008471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428628
18006	NC_007576	ATA	2	6	1008580	1008585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428628
18007	NC_007576	AAC	2	6	1008626	1008631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428628
18008	NC_007576	AAC	2	6	1008707	1008712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428628
18009	NC_007576	CAA	2	6	1008739	1008744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428628
18010	NC_007576	AAC	2	6	1008782	1008787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428628
18011	NC_007576	AGC	2	6	1008821	1008826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428628
18012	NC_007576	CAT	2	6	1008865	1008870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428628
18013	NC_007576	CAA	2	6	1009004	1009009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428629
18014	NC_007576	TCA	2	6	1009012	1009017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428629
18015	NC_007576	CCA	2	6	1009199	1009204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428629
18016	NC_007576	CCAT	2	8	1009255	1009262	25 %	25 %	0 %	50 %	81428629
18017	NC_007576	CTG	2	6	1009319	1009324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428629
18018	NC_007576	ATT	2	6	1009347	1009352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428629
18019	NC_007576	AAG	2	6	1009399	1009404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428629
18020	NC_007576	TCA	2	6	1009474	1009479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428629
18021	NC_007576	GTT	2	6	1009496	1009501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428629
18022	NC_007576	CAA	2	6	1009568	1009573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428629
18023	NC_007576	ATT	3	9	1009691	1009699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428630
18024	NC_007576	TAA	2	6	1009761	1009766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428630
18025	NC_007576	GTT	2	6	1009785	1009790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428630
18026	NC_007576	GCA	3	9	1009792	1009800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428630
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18028	NC_007576	AGATGA	2	12	1009851	1009862	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	81428630
18029	NC_007576	CTTGA	2	10	1009880	1009889	20 %	40 %	20 %	20 %	81428630
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18031	NC_007576	AGC	2	6	1009908	1009913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428630
18032	NC_007576	TTG	2	6	1009914	1009919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428630
18033	NC_007576	TTG	2	6	1009941	1009946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428630
18034	NC_007576	GCT	2	6	1009954	1009959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428630
18035	NC_007576	GCT	2	6	1009969	1009974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428630
18036	NC_007576	GCT	2	6	1010047	1010052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428630
18037	NC_007576	GCT	2	6	1010062	1010067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428630
18038	NC_007576	CTT	2	6	1010084	1010089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428630
18039	NC_007576	TACTCT	2	12	1010111	1010122	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	81428630
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18041	NC_007576	TCT	2	6	1010158	1010163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428630
18042	NC_007576	TAA	2	6	1010232	1010237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428630
18043	NC_007576	AAT	2	6	1010247	1010252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428630
18044	NC_007576	GCA	2	6	1010287	1010292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428630
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18047	NC_007576	T	6	6	1010373	1010378	0 %	100 %	0 %	0 %	81428630
18048	NC_007576	ATC	2	6	1010382	1010387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428630
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18050	NC_007576	AAC	2	6	1010504	1010509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428631
18051	NC_007576	TAAT	2	8	1010526	1010533	50 %	50 %	0 %	0 %	81428631
18052	NC_007576	GTCG	2	8	1010564	1010571	0 %	25 %	50 %	25 %	81428631
18053	NC_007576	AAT	2	6	1010671	1010676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428631
18054	NC_007576	TTGT	2	8	1010683	1010690	0 %	75 %	25 %	0 %	81428631
18055	NC_007576	CTT	2	6	1010740	1010745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428631
18056	NC_007576	GTT	2	6	1010758	1010763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428631
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18058	NC_007576	AAT	2	6	1010808	1010813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428631
18059	NC_007576	ATA	2	6	1010825	1010830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428631
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18062	NC_007576	GCT	2	6	1010922	1010927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428631
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18072	NC_007576	GCT	2	6	1011432	1011437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428631
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18075	NC_007576	TAA	2	6	1011826	1011831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428631
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18085	NC_007576	GTG	2	6	1012218	1012223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428632
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18087	NC_007576	TG	3	6	1012255	1012260	0 %	50 %	50 %	0 %	81428632
18088	NC_007576	A	7	7	1012276	1012282	100 %	0 %	0 %	0 %	81428632
18089	NC_007576	ATT	2	6	1012367	1012372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428632
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18101	NC_007576	TGCG	2	8	1013007	1013014	0 %	25 %	50 %	25 %	81428633
18102	NC_007576	T	7	7	1013070	1013076	0 %	100 %	0 %	0 %	81428633
18103	NC_007576	AAT	2	6	1013086	1013091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428633
18104	NC_007576	CGTC	2	8	1013172	1013179	0 %	25 %	25 %	50 %	81428633
18105	NC_007576	TGT	2	6	1013299	1013304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428634
18106	NC_007576	GAC	2	6	1013343	1013348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428634
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18108	NC_007576	ATA	2	6	1013562	1013567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428634
18109	NC_007576	A	6	6	1013582	1013587	100 %	0 %	0 %	0 %	81428634
18110	NC_007576	AACTA	2	10	1013616	1013625	60 %	20 %	0 %	20 %	81428634
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18112	NC_007576	AACG	2	8	1013659	1013666	50 %	0 %	25 %	25 %	81428634
18113	NC_007576	CCG	2	6	1013686	1013691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428634
18114	NC_007576	CAA	2	6	1013715	1013720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428634
18115	NC_007576	ATCAC	2	10	1013725	1013734	40 %	20 %	0 %	40 %	81428634
18116	NC_007576	ATCT	2	8	1013739	1013746	25 %	50 %	0 %	25 %	81428634
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18118	NC_007576	AAG	2	6	1014303	1014308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428635
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18236	NC_007576	CTT	2	6	1020869	1020874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428643
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18349	NC_007576	T	7	7	1027270	1027276	0 %	100 %	0 %	0 %	81428647
18350	NC_007576	TTTTA	2	10	1027427	1027436	20 %	80 %	0 %	0 %	81428648
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18470	NC_007576	ATAAGC	2	12	1034154	1034165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	81428653
18471	NC_007576	GCT	2	6	1034212	1034217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428653
18472	NC_007576	ACG	2	6	1034233	1034238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428653
18473	NC_007576	GCT	2	6	1034257	1034262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428653
18474	NC_007576	ACC	2	6	1034305	1034310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428653
18475	NC_007576	TGC	2	6	1034337	1034342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428653
18476	NC_007576	CAT	2	6	1034440	1034445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428654
18477	NC_007576	GTA	2	6	1034558	1034563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428654
18478	NC_007576	T	6	6	1034575	1034580	0 %	100 %	0 %	0 %	81428654
18479	NC_007576	CTTG	2	8	1034584	1034591	0 %	50 %	25 %	25 %	81428654
18480	NC_007576	AAT	2	6	1034669	1034674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428654
18481	NC_007576	GAT	2	6	1034833	1034838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428654
18482	NC_007576	CAA	2	6	1034845	1034850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428654
18483	NC_007576	TCA	2	6	1034913	1034918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428654
18484	NC_007576	TTC	2	6	1035005	1035010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428654
18485	NC_007576	TCG	2	6	1035042	1035047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428654
18486	NC_007576	AAG	2	6	1035072	1035077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428654
18487	NC_007576	GTT	2	6	1035150	1035155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428654
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18490	NC_007576	ACGTT	2	10	1035243	1035252	20 %	40 %	20 %	20 %	81428654
18491	NC_007576	TAAC	2	8	1035341	1035348	50 %	25 %	0 %	25 %	81428655
18492	NC_007576	CGC	2	6	1035363	1035368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428655
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18494	NC_007576	CTTG	2	8	1035433	1035440	0 %	50 %	25 %	25 %	81428655
18495	NC_007576	TAA	2	6	1035452	1035457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428655
18496	NC_007576	CAT	2	6	1035506	1035511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428655
18497	NC_007576	GC	3	6	1035650	1035655	0 %	0 %	50 %	50 %	81428655
18498	NC_007576	CAA	2	6	1035674	1035679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428655
18499	NC_007576	CGAC	2	8	1035703	1035710	25 %	0 %	25 %	50 %	81428655
18500	NC_007576	CCA	2	6	1035719	1035724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428655

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