MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007576	CAC	2	6	28792	28797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427645
502	NC_007576	TGA	2	6	28822	28827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427645
503	NC_007576	CAG	2	6	28861	28866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427645
504	NC_007576	AAC	2	6	28886	28891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427645
505	NC_007576	ATG	2	6	28935	28940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427645
506	NC_007576	TTC	2	6	29004	29009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427645
507	NC_007576	TAA	2	6	29114	29119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427645
508	NC_007576	T	6	6	29249	29254	0 %	100 %	0 %	0 %	81427645
509	NC_007576	GAAT	2	8	29271	29278	50 %	25 %	25 %	0 %	81427645
510	NC_007576	TCT	2	6	29283	29288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427645
511	NC_007576	GCA	2	6	29325	29330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427645
512	NC_007576	A	6	6	29334	29339	100 %	0 %	0 %	0 %	81427645
513	NC_007576	GCT	2	6	29340	29345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427645
514	NC_007576	AGAA	2	8	29346	29353	75 %	0 %	25 %	0 %	81427645
515	NC_007576	CAA	2	6	29668	29673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427646
516	NC_007576	TGGTAA	2	12	29771	29782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427646
517	NC_007576	GCGAT	2	10	29806	29815	20 %	20 %	40 %	20 %	81427646
518	NC_007576	AGC	2	6	29840	29845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427646
519	NC_007576	TAA	2	6	29906	29911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427646
520	NC_007576	AAG	2	6	29967	29972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427646
521	NC_007576	GTG	2	6	30023	30028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427646
522	NC_007576	TTC	2	6	30080	30085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427646
523	NC_007576	AAT	2	6	30159	30164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427646
524	NC_007576	TTC	2	6	30200	30205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427646
525	NC_007576	GTT	2	6	30255	30260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427646
526	NC_007576	CAC	2	6	30283	30288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427646
527	NC_007576	TGC	2	6	30368	30373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427646
528	NC_007576	GTT	3	9	30465	30473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427646
529	NC_007576	GTC	2	6	30477	30482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427646
530	NC_007576	TAA	2	6	30601	30606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427647
531	NC_007576	TCA	2	6	30663	30668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427647
532	NC_007576	GAT	2	6	30688	30693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427647
533	NC_007576	TCA	2	6	30875	30880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427647
534	NC_007576	GCG	2	6	31055	31060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427647
535	NC_007576	TGT	2	6	31241	31246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427647
536	NC_007576	TGC	2	6	31247	31252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427647
537	NC_007576	TGT	2	6	31277	31282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427647
538	NC_007576	TCA	2	6	31283	31288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427647
539	NC_007576	TAA	2	6	31375	31380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427647
540	NC_007576	GTTG	2	8	31487	31494	0 %	50 %	50 %	0 %	81427647
541	NC_007576	GAT	2	6	31527	31532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427647
542	NC_007576	AAT	2	6	31538	31543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427647
543	NC_007576	TTG	3	9	31544	31552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427647
544	NC_007576	CGG	2	6	31641	31646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427647
545	NC_007576	AAG	2	6	31658	31663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427647
546	NC_007576	GTTGCT	2	12	31719	31730	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	81427647
547	NC_007576	GTA	2	6	31733	31738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427647
548	NC_007576	TGG	2	6	31956	31961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427648
549	NC_007576	TTC	2	6	31976	31981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427648
550	NC_007576	TAA	2	6	32035	32040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427648
551	NC_007576	ATT	2	6	32066	32071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427648
552	NC_007576	ATC	2	6	32183	32188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427648
553	NC_007576	ATA	2	6	32238	32243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427648
554	NC_007576	CAAG	2	8	32371	32378	50 %	0 %	25 %	25 %	81427649
555	NC_007576	GCG	2	6	32379	32384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427649
556	NC_007576	AACA	2	8	32407	32414	75 %	0 %	0 %	25 %	81427649
557	NC_007576	ACC	2	6	32423	32428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427649
558	NC_007576	CAAG	2	8	32436	32443	50 %	0 %	25 %	25 %	81427649
559	NC_007576	A	6	6	32451	32456	100 %	0 %	0 %	0 %	81427649
560	NC_007576	CCA	2	6	32469	32474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427649
561	NC_007576	TTA	2	6	32502	32507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427649
562	NC_007576	CTG	2	6	32511	32516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427649
563	NC_007576	TTGG	2	8	32546	32553	0 %	50 %	50 %	0 %	81427649
564	NC_007576	TAA	2	6	32582	32587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427649
565	NC_007576	CAT	2	6	32600	32605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427649
566	NC_007576	TCA	2	6	32653	32658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427649
567	NC_007576	ATA	2	6	32676	32681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427649
568	NC_007576	TAA	2	6	32756	32761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427649
569	NC_007576	GAT	2	6	32782	32787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427649
570	NC_007576	GAA	2	6	32849	32854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427649
571	NC_007576	GCC	2	6	32865	32870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81427649
572	NC_007576	GAC	2	6	33173	33178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427649
573	NC_007576	TAG	2	6	33254	33259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427649
574	NC_007576	TAA	2	6	33326	33331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427649
575	NC_007576	AATAT	2	10	33428	33437	60 %	40 %	0 %	0 %	81427649
576	NC_007576	CT	3	6	33540	33545	0 %	50 %	0 %	50 %	81427650
577	NC_007576	TAA	2	6	33566	33571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427650
578	NC_007576	TTC	3	9	33602	33610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427650
579	NC_007576	TTG	2	6	33623	33628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427650
580	NC_007576	AAG	2	6	33630	33635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427650
581	NC_007576	CGC	2	6	33683	33688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81427650
582	NC_007576	CGGGG	2	10	33703	33712	0 %	0 %	80 %	20 %	81427650
583	NC_007576	ACT	2	6	33891	33896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427650
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585	NC_007576	TTA	2	6	33942	33947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427650
586	NC_007576	TTG	2	6	33959	33964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427650
587	NC_007576	TTC	2	6	34010	34015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427650
588	NC_007576	TTTG	2	8	34029	34036	0 %	75 %	25 %	0 %	81427650
589	NC_007576	AAGA	2	8	34045	34052	75 %	0 %	25 %	0 %	81427650
590	NC_007576	AAT	2	6	34102	34107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427650
591	NC_007576	TTGG	2	8	34133	34140	0 %	50 %	50 %	0 %	81427650
592	NC_007576	TCA	2	6	34317	34322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427650
593	NC_007576	AAG	2	6	34402	34407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427650
594	NC_007576	TTGG	2	8	34461	34468	0 %	50 %	50 %	0 %	81427650
595	NC_007576	AAGC	2	8	34471	34478	50 %	0 %	25 %	25 %	81427650
596	NC_007576	TTC	2	6	34532	34537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427650
597	NC_007576	T	6	6	34732	34737	0 %	100 %	0 %	0 %	81427651
598	NC_007576	TTG	2	6	34901	34906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427651
599	NC_007576	AAG	2	6	35007	35012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427651
600	NC_007576	TGA	2	6	35067	35072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427651
601	NC_007576	AGT	2	6	35088	35093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427651
602	NC_007576	A	6	6	35099	35104	100 %	0 %	0 %	0 %	81427651
603	NC_007576	GCG	2	6	35105	35110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427651
604	NC_007576	GCTT	2	8	35115	35122	0 %	50 %	25 %	25 %	81427651
605	NC_007576	TGAT	2	8	35133	35140	25 %	50 %	25 %	0 %	81427651
606	NC_007576	GGA	2	6	35257	35262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81427651
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608	NC_007576	AGCA	2	8	35718	35725	50 %	0 %	25 %	25 %	81427652
609	NC_007576	GCA	2	6	35732	35737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427652
610	NC_007576	TGT	2	6	35767	35772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427652
611	NC_007576	ACG	2	6	35820	35825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427652
612	NC_007576	ATC	2	6	35925	35930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427652
613	NC_007576	CAA	2	6	35961	35966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427652
614	NC_007576	TGG	2	6	35974	35979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427652
615	NC_007576	TCA	2	6	36095	36100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427652
616	NC_007576	CAG	2	6	36204	36209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427652
617	NC_007576	GAA	2	6	36243	36248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427652
618	NC_007576	TAT	2	6	36352	36357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427652
619	NC_007576	CAT	2	6	36386	36391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427652
620	NC_007576	TCGATT	2	12	36405	36416	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	81427652
621	NC_007576	ATT	2	6	36435	36440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427652
622	NC_007576	GGT	2	6	36441	36446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427652
623	NC_007576	TTGG	2	8	36534	36541	0 %	50 %	50 %	0 %	81427652
624	NC_007576	TGG	2	6	36543	36548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427652
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626	NC_007576	ATT	2	6	36562	36567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427652
627	NC_007576	GAA	2	6	36732	36737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427653
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629	NC_007576	GAA	2	6	36974	36979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427653
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