MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_007576	CAT	2	6	440524	440529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428046
8002	NC_007576	TTA	2	6	440622	440627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428046
8003	NC_007576	GTG	2	6	440667	440672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428046
8004	NC_007576	CAACA	2	10	440833	440842	60 %	0 %	0 %	40 %	81428046
8005	NC_007576	A	6	6	440869	440874	100 %	0 %	0 %	0 %	81428046
8006	NC_007576	TTA	2	6	440988	440993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428046
8007	NC_007576	CAAC	2	8	441042	441049	50 %	0 %	0 %	50 %	81428046
8008	NC_007576	A	7	7	441095	441101	100 %	0 %	0 %	0 %	81428047
8009	NC_007576	T	6	6	441117	441122	0 %	100 %	0 %	0 %	81428047
8010	NC_007576	GCG	2	6	441152	441157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428047
8011	NC_007576	GCAAAT	2	12	441214	441225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	81428047
8012	NC_007576	CTT	2	6	441361	441366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428047
8013	NC_007576	CGG	2	6	441372	441377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428047
8014	NC_007576	GGC	2	6	441417	441422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428047
8015	NC_007576	ATT	2	6	441596	441601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428047
8016	NC_007576	T	6	6	441644	441649	0 %	100 %	0 %	0 %	81428047
8017	NC_007576	ATT	2	6	441674	441679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428047
8018	NC_007576	AAG	2	6	441692	441697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428047
8019	NC_007576	AAG	2	6	441714	441719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428047
8020	NC_007576	ATT	2	6	441898	441903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428048
8021	NC_007576	ATT	3	9	441951	441959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428048
8022	NC_007576	GCT	2	6	441967	441972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428048
8023	NC_007576	ATT	2	6	442020	442025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428048
8024	NC_007576	TTC	2	6	442105	442110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428048
8025	NC_007576	TCT	2	6	442151	442156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428048
8026	NC_007576	GGT	2	6	442234	442239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428048
8027	NC_007576	TTC	2	6	442261	442266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428048
8028	NC_007576	ATG	2	6	442271	442276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428048
8029	NC_007576	TGT	2	6	442306	442311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428048
8030	NC_007576	CTT	2	6	442323	442328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428048
8031	NC_007576	TCA	2	6	442406	442411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428048
8032	NC_007576	ATA	2	6	442514	442519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428049
8033	NC_007576	GTTG	2	8	442669	442676	0 %	50 %	50 %	0 %	81428049
8034	NC_007576	TTG	2	6	442681	442686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428049
8035	NC_007576	TGG	2	6	442700	442705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428049
8036	NC_007576	GTT	2	6	442788	442793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428049
8037	NC_007576	TGA	2	6	442835	442840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428049
8038	NC_007576	AGA	2	6	442888	442893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428049
8039	NC_007576	TCA	2	6	442896	442901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428049
8040	NC_007576	ACG	2	6	442939	442944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428049
8041	NC_007576	GAT	2	6	442948	442953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428049
8042	NC_007576	CAAT	2	8	442991	442998	50 %	25 %	0 %	25 %	81428049
8043	NC_007576	CCA	3	9	443009	443017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428049
8044	NC_007576	AGT	2	6	443064	443069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428049
8045	NC_007576	GTT	2	6	443077	443082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428049
8046	NC_007576	CAA	2	6	443145	443150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428049
8047	NC_007576	GTT	2	6	443168	443173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428049
8048	NC_007576	TCT	2	6	443204	443209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81428049
8049	NC_007576	TGAGC	2	10	443289	443298	20 %	20 %	40 %	20 %	81428049
8050	NC_007576	GCC	2	6	443365	443370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428049
8051	NC_007576	GAT	2	6	443389	443394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428049
8052	NC_007576	GTA	2	6	443422	443427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428049
8053	NC_007576	AGC	2	6	443428	443433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428049
8054	NC_007576	ACCA	2	8	443698	443705	50 %	0 %	0 %	50 %	81428050
8055	NC_007576	TACAGG	2	12	443847	443858	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	81428050
8056	NC_007576	TGA	2	6	443895	443900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428050
8057	NC_007576	ATG	2	6	444013	444018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428050
8058	NC_007576	GAA	2	6	444046	444051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428050
8059	NC_007576	GGT	2	6	444073	444078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428050
8060	NC_007576	GTT	2	6	444136	444141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428050
8061	NC_007576	ATCA	2	8	444199	444206	50 %	25 %	0 %	25 %	81428050
8062	NC_007576	TCAA	2	8	444211	444218	50 %	25 %	0 %	25 %	81428050
8063	NC_007576	GCA	2	6	444531	444536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428051
8064	NC_007576	TGA	2	6	444561	444566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428051
8065	NC_007576	ATT	2	6	444644	444649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428051
8066	NC_007576	CCG	2	6	444657	444662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81428051
8067	NC_007576	AGC	2	6	444714	444719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428051
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8069	NC_007576	T	6	6	444807	444812	0 %	100 %	0 %	0 %	81428052
8070	NC_007576	GCG	2	6	444883	444888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428052
8071	NC_007576	CGA	2	6	444908	444913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428052
8072	NC_007576	T	7	7	444984	444990	0 %	100 %	0 %	0 %	81428052
8073	NC_007576	AAT	2	6	445041	445046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428052
8074	NC_007576	AATT	2	8	445132	445139	50 %	50 %	0 %	0 %	81428052
8075	NC_007576	TGA	2	6	453087	453092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428053
8076	NC_007576	GGT	2	6	453116	453121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428053
8077	NC_007576	TAG	2	6	453126	453131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81428053
8078	NC_007576	ATT	2	6	453134	453139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428053
8079	NC_007576	CAAG	2	8	453173	453180	50 %	0 %	25 %	25 %	81428053
8080	NC_007576	ACA	2	6	453181	453186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428053
8081	NC_007576	TTTA	2	8	453219	453226	25 %	75 %	0 %	0 %	81428053
8082	NC_007576	TGG	2	6	453235	453240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81428053
8083	NC_007576	GCG	2	6	453269	453274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428053
8084	NC_007576	AGA	2	6	453277	453282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428053
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8086	NC_007576	ACA	2	6	453365	453370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428053
8087	NC_007576	AAT	2	6	453398	453403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428053
8088	NC_007576	ATTG	2	8	453448	453455	25 %	50 %	25 %	0 %	81428053
8089	NC_007576	GCA	2	6	453466	453471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428053
8090	NC_007576	AAT	2	6	453539	453544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428053
8091	NC_007576	A	7	7	453554	453560	100 %	0 %	0 %	0 %	81428053
8092	NC_007576	TAT	2	6	453607	453612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428053
8093	NC_007576	GATG	2	8	453616	453623	25 %	25 %	50 %	0 %	81428053
8094	NC_007576	AAATCA	2	12	453631	453642	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	81428053
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8096	NC_007576	CAG	2	6	453665	453670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428053
8097	NC_007576	AAG	2	6	453846	453851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428053
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8099	NC_007576	T	7	7	453982	453988	0 %	100 %	0 %	0 %	81428054
8100	NC_007576	GCG	2	6	454009	454014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81428054
8101	NC_007576	TTA	2	6	454016	454021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81428054
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8103	NC_007576	TTG	2	6	454038	454043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428054
8104	NC_007576	AAGT	2	8	454110	454117	50 %	25 %	25 %	0 %	81428054
8105	NC_007576	TCA	2	6	454132	454137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428054
8106	NC_007576	ATA	2	6	454228	454233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428054
8107	NC_007576	TCG	2	6	454253	454258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81428054
8108	NC_007576	GCGA	2	8	454354	454361	25 %	0 %	50 %	25 %	81428054
8109	NC_007576	TGT	2	6	454393	454398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428054
8110	NC_007576	CAT	2	6	454421	454426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81428054
8111	NC_007576	AGC	2	6	454455	454460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81428054
8112	NC_007576	ACC	2	6	454503	454508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81428054
8113	NC_007576	ATA	2	6	454572	454577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428054
8114	NC_007576	GTT	2	6	454688	454693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81428054
8115	NC_007576	TAA	3	9	454706	454714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81428054
8116	NC_007576	GGCT	2	8	454795	454802	0 %	25 %	50 %	25 %	81428054
8117	NC_007576	T	6	6	454834	454839	0 %	100 %	0 %	0 %	81428054
8118	NC_007576	TTAA	2	8	454843	454850	50 %	50 %	0 %	0 %	81428054
8119	NC_007576	CAA	2	6	455024	455029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428055
8120	NC_007576	TAAA	2	8	455049	455056	75 %	25 %	0 %	0 %	81428055
8121	NC_007576	GAA	2	6	455075	455080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81428055
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8123	NC_007576	AAC	2	6	455187	455192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81428055
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