MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007576	GGT	2	6	272045	272050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427891
5002	NC_007576	GTC	2	6	272121	272126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427891
5003	NC_007576	TCA	2	6	272177	272182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427891
5004	NC_007576	GTG	2	6	272199	272204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427891
5005	NC_007576	TGAA	2	8	272205	272212	50 %	25 %	25 %	0 %	81427891
5006	NC_007576	GCT	2	6	272252	272257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427891
5007	NC_007576	TGG	2	6	272293	272298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427891
5008	NC_007576	GCT	2	6	272327	272332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427891
5009	NC_007576	ATG	2	6	272406	272411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427891
5010	NC_007576	AAG	2	6	272424	272429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427891
5011	NC_007576	ATT	2	6	272436	272441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427891
5012	NC_007576	TTG	2	6	272624	272629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427892
5013	NC_007576	ATG	2	6	272630	272635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427892
5014	NC_007576	TTG	2	6	272645	272650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427892
5015	NC_007576	ACT	2	6	272652	272657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427892
5016	NC_007576	ATG	2	6	272770	272775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427892
5017	NC_007576	TGG	2	6	272837	272842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427892
5018	NC_007576	AAC	2	6	272853	272858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427892
5019	NC_007576	TCA	2	6	272882	272887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427892
5020	NC_007576	ATT	2	6	272952	272957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427892
5021	NC_007576	GCG	2	6	272958	272963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427892
5022	NC_007576	CAA	2	6	272968	272973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427892
5023	NC_007576	CAAA	2	8	273060	273067	75 %	0 %	0 %	25 %	81427892
5024	NC_007576	GAT	2	6	273139	273144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427892
5025	NC_007576	GTCA	2	8	273205	273212	25 %	25 %	25 %	25 %	81427892
5026	NC_007576	GAA	2	6	273229	273234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427892
5027	NC_007576	A	6	6	273327	273332	100 %	0 %	0 %	0 %	81427893
5028	NC_007576	GAAA	2	8	273347	273354	75 %	0 %	25 %	0 %	81427893
5029	NC_007576	GTT	2	6	273362	273367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427893
5030	NC_007576	TTG	2	6	273399	273404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427893
5031	NC_007576	CAA	2	6	273432	273437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427893
5032	NC_007576	AAT	2	6	273447	273452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427893
5033	NC_007576	GAT	2	6	273476	273481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427893
5034	NC_007576	TGCGAT	2	12	273488	273499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	81427893
5035	NC_007576	CGC	2	6	273594	273599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81427893
5036	NC_007576	ATTAC	2	10	273635	273644	40 %	40 %	0 %	20 %	81427893
5037	NC_007576	GAA	3	9	273753	273761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427893
5038	NC_007576	GTCA	2	8	273801	273808	25 %	25 %	25 %	25 %	81427893
5039	NC_007576	ATT	2	6	273834	273839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427893
5040	NC_007576	AC	5	10	273898	273907	50 %	0 %	0 %	50 %	81427893
5041	NC_007576	CAA	2	6	273924	273929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427893
5042	NC_007576	AAC	2	6	274027	274032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427893
5043	NC_007576	AGA	2	6	274060	274065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427893
5044	NC_007576	TGA	2	6	274105	274110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427893
5045	NC_007576	AAT	2	6	274146	274151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427893
5046	NC_007576	GCAA	2	8	274186	274193	50 %	0 %	25 %	25 %	81427893
5047	NC_007576	ATG	2	6	274246	274251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427893
5048	NC_007576	CAA	2	6	274254	274259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427893
5049	NC_007576	ATT	2	6	274283	274288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427893
5050	NC_007576	CGG	2	6	274382	274387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427893
5051	NC_007576	TTA	2	6	274547	274552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427894
5052	NC_007576	GCAAC	2	10	274580	274589	40 %	0 %	20 %	40 %	81427894
5053	NC_007576	GAT	2	6	274726	274731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427894
5054	NC_007576	TGT	2	6	274741	274746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427894
5055	NC_007576	ATG	2	6	274914	274919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427894
5056	NC_007576	ATG	2	6	274925	274930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427894
5057	NC_007576	TTGAT	2	10	274968	274977	20 %	60 %	20 %	0 %	81427894
5058	NC_007576	CAA	2	6	274982	274987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427894
5059	NC_007576	GTCA	2	8	274988	274995	25 %	25 %	25 %	25 %	81427894
5060	NC_007576	GA	3	6	275058	275063	50 %	0 %	50 %	0 %	81427894
5061	NC_007576	AAAC	2	8	275171	275178	75 %	0 %	0 %	25 %	81427894
5062	NC_007576	CGA	2	6	275206	275211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427894
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5065	NC_007576	A	6	6	275465	275470	100 %	0 %	0 %	0 %	81427894
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5067	NC_007576	CA	3	6	275575	275580	50 %	0 %	0 %	50 %	81427894
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5071	NC_007576	GAC	2	6	275716	275721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427894
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5073	NC_007576	CAT	2	6	276012	276017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427895
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5090	NC_007576	TG	3	6	276687	276692	0 %	50 %	50 %	0 %	81427895
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5102	NC_007576	ATCG	2	8	277344	277351	25 %	25 %	25 %	25 %	81427895
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5107	NC_007576	CAA	2	6	277497	277502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427895
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5110	NC_007576	A	6	6	277537	277542	100 %	0 %	0 %	0 %	81427896
5111	NC_007576	TTA	2	6	277579	277584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427896
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5113	NC_007576	TCATCT	2	12	277621	277632	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	81427896
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5115	NC_007576	AGA	2	6	277695	277700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427896
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5119	NC_007576	AGT	2	6	277807	277812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427896
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5121	NC_007576	CAA	2	6	277876	277881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427896
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5123	NC_007576	ATC	2	6	277911	277916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427896
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5497	NC_007576	ATG	2	6	297829	297834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427914
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