MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 39661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006814	GTTT	2	8	180423	180430	0 %	75 %	25 %	0 %	58336529
3502	NC_006814	TAA	2	6	180462	180467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336529
3503	NC_006814	GAA	2	6	180529	180534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336529
3504	NC_006814	TGA	2	6	180558	180563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336529
3505	NC_006814	AGAGAA	2	12	180735	180746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336530
3506	NC_006814	TTA	2	6	180825	180830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336530
3507	NC_006814	GAA	2	6	180881	180886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336530
3508	NC_006814	CAG	2	6	180916	180921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336530
3509	NC_006814	AGT	2	6	181116	181121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336530
3510	NC_006814	TAC	2	6	181124	181129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336530
3511	NC_006814	TGC	2	6	181142	181147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336530
3512	NC_006814	TAT	2	6	181215	181220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336530
3513	NC_006814	GAT	2	6	181250	181255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336530
3514	NC_006814	GGC	2	6	181305	181310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336530
3515	NC_006814	GTG	2	6	181345	181350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336530
3516	NC_006814	ATG	2	6	181381	181386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336530
3517	NC_006814	CG	3	6	181390	181395	0 %	0 %	50 %	50 %	58336530
3518	NC_006814	TTA	2	6	181429	181434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336530
3519	NC_006814	A	6	6	181446	181451	100 %	0 %	0 %	0 %	58336530
3520	NC_006814	CAA	2	6	181542	181547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336530
3521	NC_006814	TCA	2	6	181581	181586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336530
3522	NC_006814	GAT	2	6	181613	181618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336530
3523	NC_006814	GAT	2	6	181620	181625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336530
3524	NC_006814	CAAC	2	8	181641	181648	50 %	0 %	0 %	50 %	58336530
3525	NC_006814	AGA	2	6	181649	181654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336530
3526	NC_006814	GTAC	2	8	181677	181684	25 %	25 %	25 %	25 %	58336530
3527	NC_006814	AGAA	2	8	181699	181706	75 %	0 %	25 %	0 %	58336530
3528	NC_006814	TAA	2	6	181712	181717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336530
3529	NC_006814	GAA	2	6	181746	181751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336530
3530	NC_006814	GTTTTA	2	12	181756	181767	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	58336530
3531	NC_006814	GAA	2	6	181809	181814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336530
3532	NC_006814	TAAT	2	8	181820	181827	50 %	50 %	0 %	0 %	58336530
3533	NC_006814	T	6	6	181870	181875	0 %	100 %	0 %	0 %	58336531
3534	NC_006814	GAT	2	6	181882	181887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336531
3535	NC_006814	AAAT	2	8	181908	181915	75 %	25 %	0 %	0 %	58336531
3536	NC_006814	A	6	6	181973	181978	100 %	0 %	0 %	0 %	58336531
3537	NC_006814	TATT	2	8	182028	182035	25 %	75 %	0 %	0 %	58336531
3538	NC_006814	GGT	2	6	182129	182134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336531
3539	NC_006814	T	6	6	182166	182171	0 %	100 %	0 %	0 %	58336531
3540	NC_006814	TCC	2	6	182245	182250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58336531
3541	NC_006814	AAG	2	6	182298	182303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336531
3542	NC_006814	AG	3	6	182388	182393	50 %	0 %	50 %	0 %	58336531
3543	NC_006814	AAG	3	9	182414	182422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336531
3544	NC_006814	TGAG	2	8	182487	182494	25 %	25 %	50 %	0 %	58336532
3545	NC_006814	AAG	2	6	182498	182503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
3546	NC_006814	A	6	6	182504	182509	100 %	0 %	0 %	0 %	58336532
3547	NC_006814	ATT	2	6	182528	182533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336532
3548	NC_006814	AGC	2	6	182545	182550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336532
3549	NC_006814	TTC	2	6	182552	182557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336532
3550	NC_006814	TGA	2	6	182616	182621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
3551	NC_006814	TTG	2	6	182636	182641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336532
3552	NC_006814	AAG	3	9	182693	182701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
3553	NC_006814	CTT	2	6	182773	182778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336532
3554	NC_006814	GAT	2	6	182986	182991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
3555	NC_006814	ACT	2	6	182997	183002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336532
3556	NC_006814	CTT	2	6	183310	183315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336532
3557	NC_006814	AGT	2	6	183322	183327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
3558	NC_006814	TGA	2	6	183408	183413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
3559	NC_006814	TCA	2	6	183414	183419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336532
3560	NC_006814	ATG	2	6	183422	183427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
3561	NC_006814	GTT	2	6	183428	183433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336532
3562	NC_006814	ATT	2	6	183447	183452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336532
3563	NC_006814	CTTT	2	8	183501	183508	0 %	75 %	0 %	25 %	58336532
3564	NC_006814	ATA	2	6	183516	183521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336532
3565	NC_006814	GTT	2	6	183569	183574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336532
3566	NC_006814	CTT	2	6	183590	183595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336532
3567	NC_006814	TTGA	2	8	183635	183642	25 %	50 %	25 %	0 %	58336532
3568	NC_006814	TAC	2	6	183667	183672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336532
3569	NC_006814	TCT	2	6	183696	183701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336532
3570	NC_006814	ATT	2	6	183725	183730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336532
3571	NC_006814	ACA	2	6	183779	183784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
3572	NC_006814	CAA	2	6	183798	183803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
3573	NC_006814	TTGG	2	8	183825	183832	0 %	50 %	50 %	0 %	58336532
3574	NC_006814	CAA	2	6	183841	183846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
3575	NC_006814	GTG	2	6	183864	183869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336532
3576	NC_006814	TGA	2	6	183892	183897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
3577	NC_006814	ACA	2	6	183934	183939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
3578	NC_006814	TCTT	2	8	183990	183997	0 %	75 %	0 %	25 %	58336532
3579	NC_006814	AAG	2	6	184016	184021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
3580	NC_006814	CGT	2	6	184037	184042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336532
3581	NC_006814	ATG	2	6	184098	184103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
3582	NC_006814	ATA	2	6	184137	184142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336532
3583	NC_006814	ACT	2	6	184206	184211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336532
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3586	NC_006814	CAAT	2	8	184433	184440	50 %	25 %	0 %	25 %	58336532
3587	NC_006814	GCA	2	6	184461	184466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336532
3588	NC_006814	TGG	3	9	184483	184491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336532
3589	NC_006814	TACT	2	8	184648	184655	25 %	50 %	0 %	25 %	58336532
3590	NC_006814	AGA	2	6	184666	184671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
3591	NC_006814	TAA	2	6	184690	184695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336532
3592	NC_006814	AAG	2	6	184736	184741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
3593	NC_006814	ACT	2	6	184772	184777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336532
3594	NC_006814	GGT	2	6	184814	184819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336532
3595	NC_006814	AAC	2	6	184862	184867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
3596	NC_006814	AAT	2	6	184877	184882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336532
3597	NC_006814	CTG	3	9	184920	184928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336532
3598	NC_006814	AAG	2	6	184985	184990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
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3600	NC_006814	TGAC	2	8	185166	185173	25 %	25 %	25 %	25 %	58336532
3601	NC_006814	ACTA	2	8	185177	185184	50 %	25 %	0 %	25 %	58336532
3602	NC_006814	ATG	2	6	185210	185215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336532
3603	NC_006814	AAG	2	6	185273	185278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
3604	NC_006814	AAG	2	6	185357	185362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336532
3605	NC_006814	AAC	2	6	185373	185378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
3606	NC_006814	AAC	2	6	185468	185473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336532
3607	NC_006814	A	7	7	185580	185586	100 %	0 %	0 %	0 %	58336533
3608	NC_006814	TGC	2	6	185609	185614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336533
3609	NC_006814	A	6	6	185663	185668	100 %	0 %	0 %	0 %	58336533
3610	NC_006814	A	6	6	185777	185782	100 %	0 %	0 %	0 %	58336533
3611	NC_006814	ATGGA	2	10	185787	185796	40 %	20 %	40 %	0 %	58336533
3612	NC_006814	AAG	2	6	185943	185948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336533
3613	NC_006814	ACA	2	6	185956	185961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336533
3614	NC_006814	AG	3	6	185976	185981	50 %	0 %	50 %	0 %	58336533
3615	NC_006814	ACG	2	6	186028	186033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336533
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3618	NC_006814	ATA	2	6	186160	186165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336533
3619	NC_006814	ATA	2	6	186178	186183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336533
3620	NC_006814	AGT	2	6	186207	186212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336533
3621	NC_006814	TTA	2	6	186260	186265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336533
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3992	NC_006814	TGA	2	6	204029	204034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336549
3993	NC_006814	TTC	2	6	204096	204101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336549
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3995	NC_006814	TTA	2	6	204321	204326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336550
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3999	NC_006814	CTA	2	6	204535	204540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336550
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