MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 39661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_006814	AGA	2	6	920780	920785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58337244
18503	NC_006814	A	7	7	920821	920827	100 %	0 %	0 %	0 %	58337244
18504	NC_006814	TGA	3	9	920867	920875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337244
18505	NC_006814	A	8	8	920926	920933	100 %	0 %	0 %	0 %	58337244
18506	NC_006814	GAT	2	6	920976	920981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337244
18507	NC_006814	ATT	2	6	920990	920995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58337244
18508	NC_006814	TGG	2	6	921203	921208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58337244
18509	NC_006814	TGA	2	6	921209	921214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337244
18510	NC_006814	GTT	2	6	921234	921239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337244
18511	NC_006814	AGA	2	6	921240	921245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58337244
18512	NC_006814	TCT	2	6	921257	921262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58337244
18513	NC_006814	GATG	2	8	921296	921303	25 %	25 %	50 %	0 %	58337244
18514	NC_006814	G	6	6	921303	921308	0 %	0 %	100 %	0 %	58337244
18515	NC_006814	GAT	2	6	921387	921392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337244
18516	NC_006814	TAA	2	6	921608	921613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58337244
18517	NC_006814	GAA	2	6	921638	921643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58337244
18518	NC_006814	AAG	2	6	921649	921654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58337244
18519	NC_006814	TGT	2	6	921718	921723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337244
18520	NC_006814	TTG	2	6	921814	921819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337245
18521	NC_006814	GGC	2	6	921852	921857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58337245
18522	NC_006814	TGG	2	6	921865	921870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58337245
18523	NC_006814	CGG	2	6	921899	921904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58337245
18524	NC_006814	TGG	2	6	921911	921916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58337245
18525	NC_006814	ATT	2	6	921939	921944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58337245
18526	NC_006814	TTG	2	6	921946	921951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337245
18527	NC_006814	TCG	2	6	921989	921994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58337245
18528	NC_006814	AAC	2	6	922085	922090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58337245
18529	NC_006814	GTT	2	6	922152	922157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337245
18530	NC_006814	GGC	2	6	922164	922169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58337245
18531	NC_006814	GTG	2	6	922171	922176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58337245
18532	NC_006814	CAA	2	6	922198	922203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58337245
18533	NC_006814	GTT	2	6	922277	922282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337245
18534	NC_006814	TAG	2	6	922297	922302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337245
18535	NC_006814	TTG	2	6	922329	922334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337245
18536	NC_006814	GCA	2	6	922365	922370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58337245
18537	NC_006814	TAC	2	6	922379	922384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58337245
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18539	NC_006814	AATT	2	8	922639	922646	50 %	50 %	0 %	0 %	58337245
18540	NC_006814	ATG	2	6	922723	922728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337245
18541	NC_006814	GTAA	2	8	922767	922774	50 %	25 %	25 %	0 %	58337245
18542	NC_006814	AATG	2	8	922778	922785	50 %	25 %	25 %	0 %	58337245
18543	NC_006814	GAA	2	6	922803	922808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58337245
18544	NC_006814	GAA	2	6	922827	922832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58337245
18545	NC_006814	GTT	2	6	922839	922844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337245
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18548	NC_006814	TAT	2	6	922985	922990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58337245
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18550	NC_006814	GAT	2	6	923025	923030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337245
18551	NC_006814	CGA	2	6	923060	923065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58337245
18552	NC_006814	AAT	2	6	923101	923106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58337245
18553	NC_006814	ATA	2	6	923312	923317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58337246
18554	NC_006814	TTTA	2	8	923327	923334	25 %	75 %	0 %	0 %	58337246
18555	NC_006814	A	6	6	923343	923348	100 %	0 %	0 %	0 %	58337246
18556	NC_006814	AT	3	6	923350	923355	50 %	50 %	0 %	0 %	58337246
18557	NC_006814	TAT	2	6	923372	923377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58337246
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18560	NC_006814	GCA	2	6	923512	923517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58337246
18561	NC_006814	T	7	7	923591	923597	0 %	100 %	0 %	0 %	58337246
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18564	NC_006814	ATG	2	6	923671	923676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337246
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18570	NC_006814	ATGT	2	8	923942	923949	25 %	50 %	25 %	0 %	58337246
18571	NC_006814	TGC	2	6	923955	923960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58337246
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18574	NC_006814	TTTATC	2	12	924044	924055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58337246
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18576	NC_006814	TGATTT	2	12	924134	924145	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	58337246
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18578	NC_006814	GTAG	2	8	924301	924308	25 %	25 %	50 %	0 %	58337246
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18581	NC_006814	AATT	2	8	924416	924423	50 %	50 %	0 %	0 %	58337246
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18585	NC_006814	A	6	6	924563	924568	100 %	0 %	0 %	0 %	58337246
18586	NC_006814	GCA	2	6	924652	924657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58337246
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18588	NC_006814	TAA	2	6	924908	924913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58337246
18589	NC_006814	TATTCA	2	12	924922	924933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	58337246
18590	NC_006814	ATC	2	6	924938	924943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58337246
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18592	NC_006814	ATTT	2	8	925241	925248	25 %	75 %	0 %	0 %	58337247
18593	NC_006814	ATCCA	2	10	925402	925411	40 %	20 %	0 %	40 %	58337247
18594	NC_006814	GTT	2	6	925512	925517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337247
18595	NC_006814	AATAT	2	10	925561	925570	60 %	40 %	0 %	0 %	58337247
18596	NC_006814	TGGA	2	8	925639	925646	25 %	25 %	50 %	0 %	58337247
18597	NC_006814	AC	3	6	925699	925704	50 %	0 %	0 %	50 %	58337247
18598	NC_006814	TGA	2	6	925775	925780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337247
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18601	NC_006814	AAG	2	6	925905	925910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58337247
18602	NC_006814	A	7	7	925994	926000	100 %	0 %	0 %	0 %	58337247
18603	NC_006814	GTT	3	9	926024	926032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58337248
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18605	NC_006814	AGA	2	6	926131	926136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58337248
18606	NC_006814	CTG	2	6	926142	926147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58337248
18607	NC_006814	AG	3	6	926206	926211	50 %	0 %	50 %	0 %	58337248
18608	NC_006814	A	6	6	926217	926222	100 %	0 %	0 %	0 %	58337248
18609	NC_006814	TGA	2	6	926227	926232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337248
18610	NC_006814	GAA	2	6	926294	926299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58337248
18611	NC_006814	GATT	2	8	926373	926380	25 %	50 %	25 %	0 %	58337248
18612	NC_006814	ATG	2	6	926390	926395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337248
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18614	NC_006814	CTG	2	6	926460	926465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58337248
18615	NC_006814	GCA	2	6	926483	926488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58337248
18616	NC_006814	TGA	2	6	926544	926549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58337248
18617	NC_006814	TA	3	6	926568	926573	50 %	50 %	0 %	0 %	58337248
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18620	NC_006814	TA	3	6	926733	926738	50 %	50 %	0 %	0 %	58337248
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