MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 39661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006814	AAG	2	6	228650	228655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336572
4502	NC_006814	GAA	2	6	228935	228940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336573
4503	NC_006814	ATTT	2	8	228991	228998	25 %	75 %	0 %	0 %	58336573
4504	NC_006814	TGA	2	6	229051	229056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4505	NC_006814	ACC	2	6	229065	229070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336573
4506	NC_006814	AGA	2	6	229072	229077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336573
4507	NC_006814	GAA	3	9	229079	229087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336573
4508	NC_006814	CAC	2	6	229103	229108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336573
4509	NC_006814	AAG	2	6	229109	229114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336573
4510	NC_006814	CTT	2	6	229123	229128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336573
4511	NC_006814	GAT	2	6	229148	229153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4512	NC_006814	ATC	2	6	229154	229159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336573
4513	NC_006814	ATG	2	6	229170	229175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4514	NC_006814	AGA	2	6	229180	229185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336573
4515	NC_006814	TGA	2	6	229207	229212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4516	NC_006814	TGA	3	9	229216	229224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4517	NC_006814	TGA	2	6	229231	229236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4518	NC_006814	ATG	2	6	229248	229253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4519	NC_006814	ATG	3	9	229260	229268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4520	NC_006814	TGA	2	6	229270	229275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4521	NC_006814	GAC	2	6	229328	229333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336573
4522	NC_006814	GAT	2	6	229337	229342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336573
4523	NC_006814	AT	3	6	229471	229476	50 %	50 %	0 %	0 %	58336574
4524	NC_006814	CTT	2	6	229541	229546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336574
4525	NC_006814	AT	3	6	229588	229593	50 %	50 %	0 %	0 %	58336574
4526	NC_006814	TGA	2	6	229648	229653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336574
4527	NC_006814	TAC	2	6	229729	229734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336574
4528	NC_006814	AAG	2	6	229749	229754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336574
4529	NC_006814	CA	3	6	229809	229814	50 %	0 %	0 %	50 %	58336574
4530	NC_006814	AAG	3	9	229829	229837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336574
4531	NC_006814	TAC	2	6	229855	229860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336574
4532	NC_006814	ATT	2	6	229874	229879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336574
4533	NC_006814	TGG	2	6	229888	229893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336574
4534	NC_006814	CGT	2	6	229946	229951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336574
4535	NC_006814	CTT	2	6	230000	230005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336574
4536	NC_006814	TTC	2	6	230091	230096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336574
4537	NC_006814	AAC	2	6	230103	230108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336574
4538	NC_006814	ATT	2	6	230194	230199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336574
4539	NC_006814	GAA	2	6	230299	230304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336574
4540	NC_006814	AT	3	6	230383	230388	50 %	50 %	0 %	0 %	58336574
4541	NC_006814	ACA	2	6	230407	230412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336574
4542	NC_006814	ACA	2	6	230427	230432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336574
4543	NC_006814	ATA	2	6	230478	230483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336574
4544	NC_006814	TGG	2	6	230524	230529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336574
4545	NC_006814	ACGTA	2	10	230644	230653	40 %	20 %	20 %	20 %	58336574
4546	NC_006814	AAC	2	6	230702	230707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336574
4547	NC_006814	ATT	2	6	230708	230713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336574
4548	NC_006814	TGA	2	6	230734	230739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336574
4549	NC_006814	TGG	2	6	230749	230754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336574
4550	NC_006814	AAGG	2	8	230789	230796	50 %	0 %	50 %	0 %	58336574
4551	NC_006814	CGTCAC	2	12	230843	230854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	58336574
4552	NC_006814	AATA	2	8	230870	230877	75 %	25 %	0 %	0 %	58336574
4553	NC_006814	TCT	2	6	230907	230912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336574
4554	NC_006814	AGA	2	6	230961	230966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336574
4555	NC_006814	ACC	2	6	230988	230993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336574
4556	NC_006814	TCAT	2	8	231038	231045	25 %	50 %	0 %	25 %	58336574
4557	NC_006814	GAT	2	6	231220	231225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336575
4558	NC_006814	TGG	2	6	231232	231237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336575
4559	NC_006814	AGT	2	6	231325	231330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336575
4560	NC_006814	TTA	2	6	231377	231382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336575
4561	NC_006814	AAC	2	6	231415	231420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336575
4562	NC_006814	CAT	2	6	231489	231494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336575
4563	NC_006814	CTT	2	6	231512	231517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336575
4564	NC_006814	TGG	2	6	231550	231555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336575
4565	NC_006814	AAAATG	2	12	231624	231635	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58336575
4566	NC_006814	AGA	2	6	231658	231663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336575
4567	NC_006814	CAA	2	6	231711	231716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336575
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4569	NC_006814	TAT	2	6	231757	231762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336575
4570	NC_006814	CTT	2	6	231805	231810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336575
4571	NC_006814	GTG	2	6	231834	231839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336575
4572	NC_006814	ATT	2	6	231902	231907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336575
4573	NC_006814	TGC	2	6	231943	231948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336575
4574	NC_006814	GTATTC	2	12	231963	231974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58336575
4575	NC_006814	ATA	2	6	231975	231980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336575
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4578	NC_006814	CTT	2	6	232157	232162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336575
4579	NC_006814	ATA	2	6	232194	232199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336575
4580	NC_006814	CAT	2	6	232270	232275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336575
4581	NC_006814	AAC	2	6	232293	232298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336575
4582	NC_006814	TGA	2	6	232347	232352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336575
4583	NC_006814	ACG	2	6	232376	232381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336575
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4585	NC_006814	TA	3	6	232501	232506	50 %	50 %	0 %	0 %	58336575
4586	NC_006814	CAAG	2	8	232595	232602	50 %	0 %	25 %	25 %	58336576
4587	NC_006814	TCA	2	6	232616	232621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336576
4588	NC_006814	AAG	2	6	232650	232655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336576
4589	NC_006814	TTG	2	6	232666	232671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336576
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4591	NC_006814	TTA	2	6	232861	232866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336576
4592	NC_006814	AGA	2	6	232871	232876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336576
4593	NC_006814	AGT	2	6	232899	232904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336576
4594	NC_006814	GTA	2	6	232921	232926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336576
4595	NC_006814	CGT	2	6	233012	233017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336576
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4597	NC_006814	TTGATC	2	12	233199	233210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58336577
4598	NC_006814	GCC	2	6	233220	233225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58336577
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4600	NC_006814	TTG	2	6	233268	233273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336577
4601	NC_006814	TGA	2	6	233294	233299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336577
4602	NC_006814	TGT	2	6	233317	233322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336577
4603	NC_006814	GCA	2	6	233382	233387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336577
4604	NC_006814	ATC	2	6	233399	233404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336577
4605	NC_006814	GTG	2	6	233480	233485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336577
4606	NC_006814	ACC	2	6	233486	233491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336577
4607	NC_006814	TCT	2	6	233637	233642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336577
4608	NC_006814	ACC	2	6	233651	233656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336577
4609	NC_006814	TAG	2	6	233701	233706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336577
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4611	NC_006814	ATC	2	6	233831	233836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336577
4612	NC_006814	TAGTG	2	10	233860	233869	20 %	40 %	40 %	0 %	58336577
4613	NC_006814	GTT	2	6	233875	233880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336577
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4619	NC_006814	TGTT	2	8	234002	234009	0 %	75 %	25 %	0 %	58336577
4620	NC_006814	ATT	2	6	234088	234093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336578
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4622	NC_006814	T	6	6	234276	234281	0 %	100 %	0 %	0 %	58336578
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4996	NC_006814	TAC	2	6	253670	253675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336602
4997	NC_006814	GTC	2	6	253746	253751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336602
4998	NC_006814	ATC	2	6	253770	253775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336602
4999	NC_006814	ATG	2	6	253803	253808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336602
5000	NC_006814	AGG	2	6	253824	253829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336602

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