MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 48020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_006087	ATC	2	6	2214485	2214490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50955663
42002	NC_006087	GCA	2	6	2214517	2214522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955663
42003	NC_006087	CTT	2	6	2214574	2214579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50955663
42004	NC_006087	GGCCGA	2	12	2214640	2214651	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	50955663
42005	NC_006087	GAC	2	6	2214821	2214826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955664
42006	NC_006087	GCG	2	6	2214843	2214848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955664
42007	NC_006087	ATC	3	9	2214849	2214857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50955664
42008	NC_006087	CCG	3	9	2214858	2214866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955664
42009	NC_006087	AGA	2	6	2214910	2214915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50955664
42010	NC_006087	GCTGGC	2	12	2214928	2214939	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	50955664
42011	NC_006087	GTT	2	6	2214983	2214988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50955664
42012	NC_006087	CG	3	6	2215107	2215112	0 %	0 %	50 %	50 %	50955664
42013	NC_006087	ACG	2	6	2215131	2215136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955664
42014	NC_006087	GCG	2	6	2215144	2215149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955664
42015	NC_006087	CGC	2	6	2215162	2215167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955664
42016	NC_006087	CAC	2	6	2215168	2215173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955664
42017	NC_006087	CGC	2	6	2215174	2215179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955664
42018	NC_006087	CAC	2	6	2215180	2215185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955664
42019	NC_006087	CTG	2	6	2215190	2215195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955664
42020	NC_006087	CTC	3	9	2215217	2215225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955664
42021	NC_006087	GCC	2	6	2215227	2215232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955664
42022	NC_006087	GCC	2	6	2215236	2215241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955664
42023	NC_006087	GCC	3	9	2215248	2215256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955664
42024	NC_006087	TGC	2	6	2215257	2215262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955664
42025	NC_006087	GCC	2	6	2215290	2215295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955664
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42027	NC_006087	CTG	2	6	2215358	2215363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955664
42028	NC_006087	GCG	2	6	2215416	2215421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955664
42029	NC_006087	GC	3	6	2215443	2215448	0 %	0 %	50 %	50 %	50955664
42030	NC_006087	CCTGGG	2	12	2215462	2215473	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	50955664
42031	NC_006087	GTTG	2	8	2215502	2215509	0 %	50 %	50 %	0 %	50955664
42032	NC_006087	C	6	6	2215599	2215604	0 %	0 %	0 %	100 %	50955664
42033	NC_006087	CAG	3	9	2215607	2215615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955664
42034	NC_006087	CCGC	2	8	2215635	2215642	0 %	0 %	25 %	75 %	50955664
42035	NC_006087	GCGAG	2	10	2215654	2215663	20 %	0 %	60 %	20 %	50955664
42036	NC_006087	CCG	2	6	2215699	2215704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955664
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42038	NC_006087	CGT	2	6	2215844	2215849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955664
42039	NC_006087	ATC	2	6	2215860	2215865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50955664
42040	NC_006087	CTG	2	6	2215868	2215873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955664
42041	NC_006087	CTG	2	6	2215895	2215900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955664
42042	NC_006087	AGG	2	6	2215912	2215917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50955664
42043	NC_006087	CGA	2	6	2215942	2215947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955664
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42052	NC_006087	GC	3	6	2216321	2216326	0 %	0 %	50 %	50 %	50955665
42053	NC_006087	ACG	2	6	2216330	2216335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955665
42054	NC_006087	TGC	2	6	2216363	2216368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955665
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42057	NC_006087	CG	3	6	2216479	2216484	0 %	0 %	50 %	50 %	50955665
42058	NC_006087	CGGCAG	2	12	2216489	2216500	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	50955665
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42060	NC_006087	CAGC	2	8	2216558	2216565	25 %	0 %	25 %	50 %	50955665
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42102	NC_006087	GCC	2	6	2219153	2219158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955667
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42104	NC_006087	CGC	2	6	2219244	2219249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955667
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42117	NC_006087	GC	3	6	2222606	2222611	0 %	0 %	50 %	50 %	50955669
42118	NC_006087	CTC	2	6	2222614	2222619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955669
42119	NC_006087	GAT	2	6	2222664	2222669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50955669
42120	NC_006087	CTGG	2	8	2222673	2222680	0 %	25 %	50 %	25 %	50955669
42121	NC_006087	GGC	2	6	2222733	2222738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955669
42122	NC_006087	GTC	2	6	2222800	2222805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955669
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42124	NC_006087	CCT	2	6	2222877	2222882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955669
42125	NC_006087	TCG	2	6	2222885	2222890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955669
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42230	NC_006087	CG	3	6	2231560	2231565	0 %	0 %	50 %	50 %	50955674
42231	NC_006087	CCG	2	6	2231567	2231572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955674
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42470	NC_006087	CTC	2	6	2243400	2243405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955684
42471	NC_006087	TCCC	2	8	2243427	2243434	0 %	25 %	0 %	75 %	50955684
42472	NC_006087	CGC	2	6	2243459	2243464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955684
42473	NC_006087	CTC	2	6	2243484	2243489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955684
42474	NC_006087	GCA	2	6	2243513	2243518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955684
42475	NC_006087	CGCCAG	2	12	2243556	2243567	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	50955684
42476	NC_006087	GCC	2	6	2243583	2243588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955684
42477	NC_006087	CGA	2	6	2243642	2243647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955684
42478	NC_006087	GTG	2	6	2243656	2243661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50955684
42479	NC_006087	CGC	2	6	2243664	2243669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955684
42480	NC_006087	GCTC	2	8	2243684	2243691	0 %	25 %	25 %	50 %	50955684
42481	NC_006087	GCC	2	6	2243762	2243767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955684
42482	NC_006087	GTC	2	6	2243779	2243784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955684
42483	NC_006087	CCG	2	6	2243785	2243790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955684
42484	NC_006087	CCG	2	6	2243797	2243802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955684
42485	NC_006087	GGA	2	6	2243804	2243809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50955684
42486	NC_006087	CTG	2	6	2243856	2243861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955684
42487	NC_006087	CGGT	2	8	2243997	2244004	0 %	25 %	50 %	25 %	50955685
42488	NC_006087	CGG	2	6	2244083	2244088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955685
42489	NC_006087	CCGGCG	2	12	2244095	2244106	0 %	0 %	50 %	50 %	50955685
42490	NC_006087	CTG	2	6	2244216	2244221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955685
42491	NC_006087	CGA	2	6	2244325	2244330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955685
42492	NC_006087	GAC	2	6	2244401	2244406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955685
42493	NC_006087	CGGC	2	8	2244465	2244472	0 %	0 %	50 %	50 %	50955685
42494	NC_006087	GGCCG	2	10	2244478	2244487	0 %	0 %	60 %	40 %	50955685
42495	NC_006087	GAC	2	6	2244488	2244493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955685
42496	NC_006087	CGC	2	6	2244588	2244593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955686
42497	NC_006087	TCC	2	6	2244598	2244603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955686
42498	NC_006087	GTA	2	6	2244636	2244641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50955686
42499	NC_006087	GC	4	8	2244643	2244650	0 %	0 %	50 %	50 %	50955686
42500	NC_006087	CG	3	6	2244690	2244695	0 %	0 %	50 %	50 %	50955686

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