MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 48020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_006087	GTC	2	6	1652730	1652735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955203
31002	NC_006087	GGC	2	6	1652882	1652887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955204
31003	NC_006087	CCA	2	6	1652920	1652925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955204
31004	NC_006087	TGC	2	6	1652993	1652998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955204
31005	NC_006087	AGC	3	9	1653033	1653041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955204
31006	NC_006087	GCG	2	6	1653051	1653056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955204
31007	NC_006087	TGC	2	6	1653064	1653069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955204
31008	NC_006087	GTC	2	6	1653083	1653088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955204
31009	NC_006087	CTC	2	6	1653098	1653103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955204
31010	NC_006087	AGA	2	6	1653107	1653112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50955204
31011	NC_006087	TCG	2	6	1653137	1653142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955204
31012	NC_006087	GCT	2	6	1653189	1653194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955204
31013	NC_006087	CGG	2	6	1653269	1653274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955204
31014	NC_006087	CGAC	2	8	1653366	1653373	25 %	0 %	25 %	50 %	50955204
31015	NC_006087	CTCG	2	8	1653398	1653405	0 %	25 %	25 %	50 %	50955204
31016	NC_006087	CCT	2	6	1653433	1653438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955204
31017	NC_006087	CCG	2	6	1653443	1653448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955204
31018	NC_006087	CTT	2	6	1653466	1653471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50955204
31019	NC_006087	CAC	2	6	1653473	1653478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955204
31020	NC_006087	TGA	2	6	1653827	1653832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50955205
31021	NC_006087	TACACG	2	12	1653892	1653903	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50955205
31022	NC_006087	ATC	2	6	1654003	1654008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50955205
31023	NC_006087	ACT	2	6	1654061	1654066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50955205
31024	NC_006087	GTG	2	6	1654081	1654086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50955205
31025	NC_006087	CGC	2	6	1654107	1654112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955205
31026	NC_006087	ACC	2	6	1654115	1654120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955205
31027	NC_006087	GGC	2	6	1654153	1654158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955205
31028	NC_006087	TGG	2	6	1654253	1654258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50955205
31029	NC_006087	CGT	2	6	1654287	1654292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955205
31030	NC_006087	GCC	2	6	1654336	1654341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955205
31031	NC_006087	CGA	2	6	1654343	1654348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955205
31032	NC_006087	CTG	2	6	1654385	1654390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955205
31033	NC_006087	GCT	2	6	1654413	1654418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955205
31034	NC_006087	ATC	2	6	1654423	1654428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50955205
31035	NC_006087	AT	3	6	1654531	1654536	50 %	50 %	0 %	0 %	50955205
31036	NC_006087	CGC	3	9	1654542	1654550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955205
31037	NC_006087	TGA	2	6	1654604	1654609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50955205
31038	NC_006087	GCTG	2	8	1654696	1654703	0 %	25 %	50 %	25 %	50955205
31039	NC_006087	TCACG	2	10	1654728	1654737	20 %	20 %	20 %	40 %	50955205
31040	NC_006087	GCG	2	6	1654778	1654783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955205
31041	NC_006087	GGC	2	6	1654810	1654815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955205
31042	NC_006087	CGC	2	6	1654860	1654865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955205
31043	NC_006087	CGT	2	6	1654887	1654892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955205
31044	NC_006087	CGGTG	2	10	1654899	1654908	0 %	20 %	60 %	20 %	50955205
31045	NC_006087	TCA	2	6	1654919	1654924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50955205
31046	NC_006087	ACC	2	6	1654937	1654942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955205
31047	NC_006087	CGA	2	6	1654968	1654973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955205
31048	NC_006087	CG	4	8	1660092	1660099	0 %	0 %	50 %	50 %	50955206
31049	NC_006087	CTC	2	6	1660102	1660107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955206
31050	NC_006087	CGC	2	6	1660161	1660166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955206
31051	NC_006087	CGAC	2	8	1660194	1660201	25 %	0 %	25 %	50 %	50955206
31052	NC_006087	GCA	2	6	1660209	1660214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31053	NC_006087	CGC	2	6	1660225	1660230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955206
31054	NC_006087	CCT	2	6	1660236	1660241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955206
31055	NC_006087	GCGG	2	8	1660258	1660265	0 %	0 %	75 %	25 %	50955206
31056	NC_006087	GCA	2	6	1660296	1660301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31057	NC_006087	TTG	2	6	1660334	1660339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50955206
31058	NC_006087	GAC	2	6	1660342	1660347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31059	NC_006087	CCA	2	6	1660434	1660439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955206
31060	NC_006087	CCT	2	6	1660467	1660472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955206
31061	NC_006087	GT	3	6	1660542	1660547	0 %	50 %	50 %	0 %	50955206
31062	NC_006087	GCCG	2	8	1660551	1660558	0 %	0 %	50 %	50 %	50955206
31063	NC_006087	CAG	2	6	1660645	1660650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31064	NC_006087	CGGTTC	2	12	1660706	1660717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31065	NC_006087	CGCTT	2	10	1660721	1660730	0 %	40 %	20 %	40 %	50955206
31066	NC_006087	CG	3	6	1660731	1660736	0 %	0 %	50 %	50 %	50955206
31067	NC_006087	GCG	3	9	1660789	1660797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955206
31068	NC_006087	CG	3	6	1660827	1660832	0 %	0 %	50 %	50 %	50955206
31069	NC_006087	CCG	2	6	1660853	1660858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955206
31070	NC_006087	ACC	2	6	1660864	1660869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955206
31071	NC_006087	GCA	2	6	1660911	1660916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31072	NC_006087	GCTG	2	8	1660971	1660978	0 %	25 %	50 %	25 %	50955206
31073	NC_006087	TCACCT	2	12	1661010	1661021	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	50955206
31074	NC_006087	CAC	2	6	1661023	1661028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955206
31075	NC_006087	TCC	2	6	1661030	1661035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955206
31076	NC_006087	GC	4	8	1661037	1661044	0 %	0 %	50 %	50 %	50955206
31077	NC_006087	GAC	2	6	1661101	1661106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31078	NC_006087	CTC	2	6	1661116	1661121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955206
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31080	NC_006087	GCA	2	6	1661172	1661177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31081	NC_006087	GCCG	2	8	1661197	1661204	0 %	0 %	50 %	50 %	50955206
31082	NC_006087	GCG	2	6	1661216	1661221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955206
31083	NC_006087	CTG	2	6	1661248	1661253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31084	NC_006087	ACG	2	6	1661282	1661287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31085	NC_006087	GA	3	6	1661342	1661347	50 %	0 %	50 %	0 %	50955206
31086	NC_006087	CG	3	6	1661368	1661373	0 %	0 %	50 %	50 %	50955206
31087	NC_006087	CTC	2	6	1661374	1661379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955206
31088	NC_006087	GCT	2	6	1661388	1661393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31089	NC_006087	CGT	2	6	1661397	1661402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31090	NC_006087	CCGT	2	8	1661411	1661418	0 %	25 %	25 %	50 %	50955206
31091	NC_006087	GGT	2	6	1661422	1661427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50955206
31092	NC_006087	CTG	2	6	1661476	1661481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31093	NC_006087	CG	3	6	1661495	1661500	0 %	0 %	50 %	50 %	50955206
31094	NC_006087	CGT	2	6	1661505	1661510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955206
31095	NC_006087	ACT	2	6	1661627	1661632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50955207
31096	NC_006087	GC	3	6	1661677	1661682	0 %	0 %	50 %	50 %	50955207
31097	NC_006087	CTC	2	6	1661761	1661766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50955207
31098	NC_006087	C	6	6	1661775	1661780	0 %	0 %	0 %	100 %	50955207
31099	NC_006087	GAA	2	6	1661937	1661942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50955207
31100	NC_006087	ACG	2	6	1661989	1661994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955207
31101	NC_006087	GAAC	2	8	1662027	1662034	50 %	0 %	25 %	25 %	50955207
31102	NC_006087	CTGG	2	8	1662087	1662094	0 %	25 %	50 %	25 %	50955207
31103	NC_006087	CAC	2	6	1662159	1662164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955207
31104	NC_006087	CG	3	6	1662169	1662174	0 %	0 %	50 %	50 %	50955207
31105	NC_006087	CGCC	2	8	1662204	1662211	0 %	0 %	25 %	75 %	50955207
31106	NC_006087	GGCCG	2	10	1662303	1662312	0 %	0 %	60 %	40 %	50955208
31107	NC_006087	TCGG	2	8	1662337	1662344	0 %	25 %	50 %	25 %	50955208
31108	NC_006087	GCC	2	6	1662366	1662371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955208
31109	NC_006087	CAC	2	6	1662385	1662390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50955208
31110	NC_006087	GCGGCC	2	12	1662436	1662447	0 %	0 %	50 %	50 %	50955208
31111	NC_006087	GAC	2	6	1662540	1662545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955208
31112	NC_006087	CGC	2	6	1662560	1662565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955208
31113	NC_006087	GCG	2	6	1662569	1662574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955208
31114	NC_006087	CGA	3	9	1662638	1662646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955208
31115	NC_006087	CG	3	6	1662682	1662687	0 %	0 %	50 %	50 %	50955208
31116	NC_006087	CGC	2	6	1662719	1662724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955208
31117	NC_006087	GCC	2	6	1662731	1662736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955208
31118	NC_006087	CGC	2	6	1662788	1662793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955208
31119	NC_006087	CTCGA	2	10	1662841	1662850	20 %	20 %	20 %	40 %	50955208
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31121	NC_006087	GTA	2	6	1662915	1662920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50955208
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31150	NC_006087	GA	3	6	1664420	1664425	50 %	0 %	50 %	0 %	50955210
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31217	NC_006087	CAGGGT	2	12	1668627	1668638	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	50955213
31218	NC_006087	CGA	2	6	1668648	1668653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955213
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31222	NC_006087	GC	3	6	1668754	1668759	0 %	0 %	50 %	50 %	50955213
31223	NC_006087	TCG	2	6	1668760	1668765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955213
31224	NC_006087	GCCA	2	8	1669099	1669106	25 %	0 %	25 %	50 %	50955214
31225	NC_006087	CGC	2	6	1669128	1669133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955214
31226	NC_006087	TCGCC	2	10	1669136	1669145	0 %	20 %	20 %	60 %	50955214
31227	NC_006087	CAG	2	6	1669185	1669190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955214
31228	NC_006087	GC	3	6	1669228	1669233	0 %	0 %	50 %	50 %	50955214
31229	NC_006087	ACG	2	6	1669329	1669334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955215
31230	NC_006087	ATG	2	6	1669434	1669439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50955215
31231	NC_006087	CTT	2	6	1669495	1669500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50955215
31232	NC_006087	G	6	6	1669788	1669793	0 %	0 %	100 %	0 %	50955216
31233	NC_006087	GC	3	6	1669852	1669857	0 %	0 %	50 %	50 %	50955216
31234	NC_006087	CG	4	8	1669895	1669902	0 %	0 %	50 %	50 %	50955216
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31236	NC_006087	CG	3	6	1669943	1669948	0 %	0 %	50 %	50 %	50955216
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31471	NC_006087	CGC	2	6	1681014	1681019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955225
31472	NC_006087	TCG	2	6	1681040	1681045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955225
31473	NC_006087	GC	3	6	1681080	1681085	0 %	0 %	50 %	50 %	50955225
31474	NC_006087	GGC	2	6	1681185	1681190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955225
31475	NC_006087	CGC	2	6	1681200	1681205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955225
31476	NC_006087	CGC	2	6	1681238	1681243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955225
31477	NC_006087	CGA	2	6	1681272	1681277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50955225
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31479	NC_006087	GGC	2	6	1681336	1681341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955225
31480	NC_006087	GCG	2	6	1681354	1681359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955225
31481	NC_006087	CGC	2	6	1681372	1681377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955225
31482	NC_006087	GCG	2	6	1681379	1681384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50955225
31483	NC_006087	GC	4	8	1681407	1681414	0 %	0 %	50 %	50 %	50955225
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31490	NC_006087	CGGC	2	8	1681555	1681562	0 %	0 %	50 %	50 %	50955225
31491	NC_006087	GAT	2	6	1681569	1681574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50955225
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31493	NC_006087	CCGC	2	8	1681656	1681663	0 %	0 %	25 %	75 %	50955225
31494	NC_006087	CCG	2	6	1681677	1681682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50955225
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31496	NC_006087	GTA	2	6	1681759	1681764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50955225
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31499	NC_006087	TCG	2	6	1681919	1681924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50955225
31500	NC_006087	CG	3	6	1681923	1681928	0 %	0 %	50 %	50 %	50955225

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