MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 48020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_006087	CGG	2	6	921294	921299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954610
16002	NC_006087	CGA	2	6	921318	921323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954610
16003	NC_006087	AGA	2	6	921341	921346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954610
16004	NC_006087	TGG	2	6	921350	921355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954610
16005	NC_006087	CGA	2	6	921369	921374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954610
16006	NC_006087	TCGC	2	8	921388	921395	0 %	25 %	25 %	50 %	50954610
16007	NC_006087	CGA	2	6	921408	921413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954610
16008	NC_006087	ACG	2	6	921431	921436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954610
16009	NC_006087	CAG	2	6	921639	921644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954611
16010	NC_006087	ACG	2	6	921718	921723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954611
16011	NC_006087	CGG	2	6	921734	921739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954611
16012	NC_006087	ACC	2	6	921760	921765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954611
16013	NC_006087	GTC	2	6	921768	921773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954611
16014	NC_006087	GATGCC	2	12	921783	921794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	50954611
16015	NC_006087	CGC	2	6	921845	921850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954611
16016	NC_006087	AG	3	6	921852	921857	50 %	0 %	50 %	0 %	50954611
16017	NC_006087	ATG	2	6	921865	921870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954611
16018	NC_006087	CGC	2	6	921875	921880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954611
16019	NC_006087	ACG	2	6	921907	921912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954611
16020	NC_006087	GGT	2	6	921990	921995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50954611
16021	NC_006087	CAG	2	6	922071	922076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954611
16022	NC_006087	GTC	2	6	922146	922151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954611
16023	NC_006087	GCA	2	6	922154	922159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954611
16024	NC_006087	CCGT	2	8	922168	922175	0 %	25 %	25 %	50 %	50954611
16025	NC_006087	CGA	2	6	922181	922186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954611
16026	NC_006087	CGGG	2	8	922227	922234	0 %	0 %	75 %	25 %	50954611
16027	NC_006087	GAG	2	6	922236	922241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954611
16028	NC_006087	GCG	2	6	922291	922296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954611
16029	NC_006087	CGGCG	2	10	922350	922359	0 %	0 %	60 %	40 %	50954611
16030	NC_006087	CGG	2	6	922373	922378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954611
16031	NC_006087	GCC	2	6	922410	922415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954611
16032	NC_006087	GCG	2	6	922501	922506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954611
16033	NC_006087	CGG	2	6	922511	922516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954611
16034	NC_006087	GCG	2	6	922519	922524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954611
16035	NC_006087	CGT	2	6	922720	922725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954612
16036	NC_006087	CG	3	6	922754	922759	0 %	0 %	50 %	50 %	50954612
16037	NC_006087	ATC	2	6	922760	922765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954612
16038	NC_006087	GGA	2	6	922819	922824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954612
16039	NC_006087	GGCG	2	8	922870	922877	0 %	0 %	75 %	25 %	50954612
16040	NC_006087	CGC	2	6	922897	922902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954612
16041	NC_006087	CGGC	2	8	922981	922988	0 %	0 %	50 %	50 %	50954612
16042	NC_006087	CG	3	6	922990	922995	0 %	0 %	50 %	50 %	50954612
16043	NC_006087	CGAGC	2	10	923038	923047	20 %	0 %	40 %	40 %	50954612
16044	NC_006087	GGC	2	6	923063	923068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954612
16045	NC_006087	GCG	2	6	923107	923112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954612
16046	NC_006087	GC	3	6	923123	923128	0 %	0 %	50 %	50 %	50954612
16047	NC_006087	TGGG	2	8	923132	923139	0 %	25 %	75 %	0 %	50954612
16048	NC_006087	CGC	2	6	923182	923187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954612
16049	NC_006087	CG	3	6	923196	923201	0 %	0 %	50 %	50 %	50954612
16050	NC_006087	AGGTGG	2	12	923202	923213	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	50954612
16051	NC_006087	CA	3	6	923325	923330	50 %	0 %	0 %	50 %	50954612
16052	NC_006087	GGA	2	6	923335	923340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954612
16053	NC_006087	CCGG	2	8	923410	923417	0 %	0 %	50 %	50 %	50954612
16054	NC_006087	CGC	2	6	923427	923432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954612
16055	NC_006087	TCG	2	6	923445	923450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954612
16056	NC_006087	CGG	2	6	923458	923463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954612
16057	NC_006087	CGC	2	6	923464	923469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954612
16058	NC_006087	CGA	3	9	923566	923574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954612
16059	NC_006087	GC	4	8	923640	923647	0 %	0 %	50 %	50 %	50954612
16060	NC_006087	GACGG	2	10	923649	923658	20 %	0 %	60 %	20 %	50954612
16061	NC_006087	GTC	2	6	923736	923741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16062	NC_006087	ACC	2	6	923742	923747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954613
16063	NC_006087	GTC	2	6	923748	923753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16064	NC_006087	CTG	2	6	923754	923759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16065	NC_006087	ACT	2	6	923809	923814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954613
16066	NC_006087	ACA	2	6	923848	923853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50954613
16067	NC_006087	TCG	2	6	923854	923859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16068	NC_006087	GTC	2	6	923958	923963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16069	NC_006087	CCG	2	6	923992	923997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954613
16070	NC_006087	TCGT	2	8	924009	924016	0 %	50 %	25 %	25 %	50954613
16071	NC_006087	TCT	2	6	924040	924045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954613
16072	NC_006087	CCA	2	6	924079	924084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954613
16073	NC_006087	CGT	2	6	924095	924100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16074	NC_006087	CGT	2	6	924110	924115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16075	NC_006087	CTG	2	6	924165	924170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16076	NC_006087	CTG	3	9	924183	924191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16077	NC_006087	GGCT	2	8	924210	924217	0 %	25 %	50 %	25 %	50954613
16078	NC_006087	CGG	2	6	924312	924317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954613
16079	NC_006087	CG	3	6	924332	924337	0 %	0 %	50 %	50 %	50954613
16080	NC_006087	CGC	2	6	924404	924409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954613
16081	NC_006087	ACG	2	6	924414	924419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16082	NC_006087	CTGGC	2	10	924450	924459	0 %	20 %	40 %	40 %	50954613
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16087	NC_006087	GTC	2	6	924576	924581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16088	NC_006087	TCG	2	6	924583	924588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
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16090	NC_006087	CTG	2	6	924714	924719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16091	NC_006087	GCT	2	6	924734	924739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16092	NC_006087	TGC	2	6	924787	924792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16093	NC_006087	CTG	2	6	924827	924832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954613
16094	NC_006087	CCG	2	6	924858	924863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954613
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16099	NC_006087	AGG	2	6	925020	925025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954614
16100	NC_006087	TCG	2	6	925034	925039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954614
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16103	NC_006087	GA	4	8	925339	925346	50 %	0 %	50 %	0 %	50954615
16104	NC_006087	TGA	2	6	925351	925356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954615
16105	NC_006087	TCG	2	6	925410	925415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954615
16106	NC_006087	CG	3	6	925414	925419	0 %	0 %	50 %	50 %	50954615
16107	NC_006087	CGA	2	6	925537	925542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954615
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16109	NC_006087	TGA	2	6	925600	925605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954615
16110	NC_006087	GAA	2	6	925640	925645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954615
16111	NC_006087	CG	4	8	925648	925655	0 %	0 %	50 %	50 %	50954615
16112	NC_006087	TGC	2	6	925656	925661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954615
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16120	NC_006087	GCA	2	6	926965	926970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954616
16121	NC_006087	CGG	2	6	927039	927044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954616
16122	NC_006087	TCG	2	6	927084	927089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
16123	NC_006087	GTC	2	6	927098	927103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
16124	NC_006087	GC	3	6	927104	927109	0 %	0 %	50 %	50 %	50954616
16125	NC_006087	AC	3	6	927117	927122	50 %	0 %	0 %	50 %	50954616
16126	NC_006087	GCG	2	6	927124	927129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954616
16127	NC_006087	GCTCT	2	10	927146	927155	0 %	40 %	20 %	40 %	50954616
16128	NC_006087	TGC	2	6	927177	927182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
16129	NC_006087	GC	3	6	927202	927207	0 %	0 %	50 %	50 %	50954616
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16131	NC_006087	TCG	2	6	927276	927281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
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16133	NC_006087	CTG	3	9	927362	927370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
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16137	NC_006087	TCG	3	9	927438	927446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
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16139	NC_006087	GTC	2	6	927530	927535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
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16144	NC_006087	CGTG	2	8	927628	927635	0 %	25 %	50 %	25 %	50954616
16145	NC_006087	GCT	2	6	927679	927684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
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16148	NC_006087	TCG	2	6	927738	927743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
16149	NC_006087	CG	3	6	927769	927774	0 %	0 %	50 %	50 %	50954616
16150	NC_006087	GAC	2	6	927866	927871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954616
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16152	NC_006087	CTG	3	9	928025	928033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
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16154	NC_006087	CGT	2	6	928051	928056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
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16157	NC_006087	CTG	2	6	928094	928099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954616
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16353	NC_006087	GGC	2	6	935227	935232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954623
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16356	NC_006087	CGCCC	2	10	935284	935293	0 %	0 %	20 %	80 %	50954623
16357	NC_006087	CGT	3	9	935299	935307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954623
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16482	NC_006087	CGG	2	6	939751	939756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954628
16483	NC_006087	GTC	2	6	939770	939775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954628
16484	NC_006087	ATC	2	6	939776	939781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954628
16485	NC_006087	CCG	2	6	939783	939788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954628
16486	NC_006087	TCCG	2	8	939796	939803	0 %	25 %	25 %	50 %	50954628
16487	NC_006087	GCC	2	6	939806	939811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954628
16488	NC_006087	GCG	2	6	939835	939840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954628
16489	NC_006087	GCT	2	6	939841	939846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954628
16490	NC_006087	CGT	2	6	939874	939879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954628
16491	NC_006087	TGGCCG	2	12	939921	939932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	50954628
16492	NC_006087	CCA	2	6	939939	939944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954628
16493	NC_006087	CGGGC	2	10	939957	939966	0 %	0 %	60 %	40 %	50954628
16494	NC_006087	CGCGG	2	10	939982	939991	0 %	0 %	60 %	40 %	50954628
16495	NC_006087	TCA	2	6	939996	940001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954628
16496	NC_006087	GC	3	6	940023	940028	0 %	0 %	50 %	50 %	50954628
16497	NC_006087	GCGG	2	8	940045	940052	0 %	0 %	75 %	25 %	50954628
16498	NC_006087	CTG	3	9	940058	940066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954628
16499	NC_006087	CGG	2	6	940075	940080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954628
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