MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 chromosome

Total Repeats: 48020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_006087	GAG	2	6	837155	837160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954550
14503	NC_006087	GGC	2	6	837168	837173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954550
14504	NC_006087	CGT	2	6	837269	837274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954550
14505	NC_006087	GTC	2	6	837275	837280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954550
14506	NC_006087	TCA	2	6	837713	837718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954551
14507	NC_006087	GC	3	6	837746	837751	0 %	0 %	50 %	50 %	50954551
14508	NC_006087	GAA	2	6	837822	837827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50954551
14509	NC_006087	GGC	2	6	837853	837858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954551
14510	NC_006087	CGAC	2	8	837872	837879	25 %	0 %	25 %	50 %	50954551
14511	NC_006087	CAT	2	6	838030	838035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954552
14512	NC_006087	CGC	2	6	838093	838098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954552
14513	NC_006087	GCA	2	6	838099	838104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954552
14514	NC_006087	CAT	2	6	838186	838191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954552
14515	NC_006087	CTT	2	6	838225	838230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954552
14516	NC_006087	TTC	3	9	838274	838282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954552
14517	NC_006087	TCG	2	6	838314	838319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954552
14518	NC_006087	CTG	2	6	838349	838354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954552
14519	NC_006087	ATC	2	6	838385	838390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954552
14520	NC_006087	TCA	2	6	838413	838418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954552
14521	NC_006087	TGC	2	6	838470	838475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954552
14522	NC_006087	ATC	2	6	838508	838513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954552
14523	NC_006087	CGT	2	6	838515	838520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954552
14524	NC_006087	GAT	2	6	838531	838536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954552
14525	NC_006087	CTG	2	6	838595	838600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954552
14526	NC_006087	GTC	2	6	838613	838618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954552
14527	NC_006087	CAG	3	9	838774	838782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14528	NC_006087	CGC	2	6	838803	838808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954553
14529	NC_006087	GGGCT	2	10	838855	838864	0 %	20 %	60 %	20 %	50954553
14530	NC_006087	TCG	2	6	838958	838963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14531	NC_006087	GTCG	2	8	839082	839089	0 %	25 %	50 %	25 %	50954553
14532	NC_006087	TCG	2	6	839132	839137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14533	NC_006087	GAC	2	6	839142	839147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14534	NC_006087	TGC	2	6	839153	839158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14535	NC_006087	TG	3	6	839253	839258	0 %	50 %	50 %	0 %	50954553
14536	NC_006087	TCA	2	6	839267	839272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50954553
14537	NC_006087	C	6	6	839280	839285	0 %	0 %	0 %	100 %	50954553
14538	NC_006087	GGA	2	6	839328	839333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954553
14539	NC_006087	GTC	3	9	839374	839382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14540	NC_006087	GAG	2	6	839386	839391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954553
14541	NC_006087	TCG	2	6	839452	839457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14542	NC_006087	GGC	3	9	839463	839471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954553
14543	NC_006087	CAG	2	6	839526	839531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14544	NC_006087	GCG	2	6	839538	839543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954553
14545	NC_006087	GCT	2	6	839616	839621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14546	NC_006087	TCT	2	6	839648	839653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954553
14547	NC_006087	CGC	2	6	839679	839684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954553
14548	NC_006087	AGCGCG	2	12	839726	839737	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	50954553
14549	NC_006087	GGA	2	6	839757	839762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954553
14550	NC_006087	CGC	2	6	839841	839846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954553
14551	NC_006087	CCA	2	6	839847	839852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50954553
14552	NC_006087	TGC	2	6	839861	839866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14553	NC_006087	GTC	2	6	839917	839922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14554	NC_006087	CGT	2	6	839970	839975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
14555	NC_006087	GC	3	6	840051	840056	0 %	0 %	50 %	50 %	50954553
14556	NC_006087	GGA	2	6	840102	840107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954553
14557	NC_006087	GTCG	2	8	840123	840130	0 %	25 %	50 %	25 %	50954553
14558	NC_006087	TCGC	2	8	840133	840140	0 %	25 %	25 %	50 %	50954553
14559	NC_006087	ACA	2	6	840185	840190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50954553
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14561	NC_006087	GTC	2	6	840246	840251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
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14563	NC_006087	GC	3	6	840292	840297	0 %	0 %	50 %	50 %	50954553
14564	NC_006087	GCA	2	6	840306	840311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954553
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14569	NC_006087	CCG	2	6	840453	840458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954553
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14572	NC_006087	GC	3	6	840587	840592	0 %	0 %	50 %	50 %	50954553
14573	NC_006087	TCG	2	6	840746	840751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954553
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14579	NC_006087	GAC	2	6	840903	840908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954553
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14581	NC_006087	CGGGAG	2	12	840934	840945	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	50954553
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14588	NC_006087	GCC	2	6	841289	841294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954554
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14592	NC_006087	CT	3	6	841467	841472	0 %	50 %	0 %	50 %	50954554
14593	NC_006087	CGG	2	6	841531	841536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954554
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14599	NC_006087	GC	3	6	841828	841833	0 %	0 %	50 %	50 %	50954554
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14602	NC_006087	CGC	2	6	841912	841917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954554
14603	NC_006087	GCCG	2	8	841957	841964	0 %	0 %	50 %	50 %	50954554
14604	NC_006087	CA	3	6	841978	841983	50 %	0 %	0 %	50 %	50954554
14605	NC_006087	GAG	2	6	841988	841993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50954554
14606	NC_006087	CCG	2	6	842010	842015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50954554
14607	NC_006087	GTC	2	6	842030	842035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954554
14608	NC_006087	CCCGA	2	10	842057	842066	20 %	0 %	20 %	60 %	50954554
14609	NC_006087	CGT	2	6	842108	842113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954554
14610	NC_006087	GC	3	6	842118	842123	0 %	0 %	50 %	50 %	50954554
14611	NC_006087	TCG	2	6	842130	842135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954554
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14614	NC_006087	AC	3	6	842313	842318	50 %	0 %	0 %	50 %	50954554
14615	NC_006087	CATCGA	2	12	842338	842349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50954554
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14619	NC_006087	CGA	2	6	842473	842478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954554
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14621	NC_006087	GCA	2	6	842556	842561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954554
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14865	NC_006087	GAC	3	9	860143	860151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954565
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14868	NC_006087	CGG	2	6	860246	860251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954565
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14871	NC_006087	CCCG	2	8	860412	860419	0 %	0 %	25 %	75 %	50954565
14872	NC_006087	CGG	3	9	860450	860458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954565
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14984	NC_006087	GCT	2	6	865025	865030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954568
14985	NC_006087	ACG	2	6	865047	865052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50954568
14986	NC_006087	TGC	2	6	865081	865086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954568
14987	NC_006087	GCG	2	6	865098	865103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954568
14988	NC_006087	TCG	2	6	865132	865137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954568
14989	NC_006087	TCG	3	9	865141	865149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954568
14990	NC_006087	CTG	2	6	865164	865169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954568
14991	NC_006087	CCTC	2	8	865201	865208	0 %	25 %	0 %	75 %	50954568
14992	NC_006087	GT	3	6	865210	865215	0 %	50 %	50 %	0 %	50954568
14993	NC_006087	TCT	2	6	865243	865248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954568
14994	NC_006087	TGA	2	6	865261	865266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50954568
14995	NC_006087	TCT	2	6	865273	865278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50954568
14996	NC_006087	GCCG	2	8	865305	865312	0 %	0 %	50 %	50 %	50954568
14997	NC_006087	CGAGAT	2	12	865328	865339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50954568
14998	NC_006087	CGG	2	6	865399	865404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50954568
14999	NC_006087	CTG	2	6	865419	865424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50954568
15000	NC_006087	TCC	2	6	865432	865437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50954568

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