MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 5571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005824	TTCCA	2	10	243899	243908	20 %	40 %	0 %	40 %	45655773
4002	NC_005824	CTTT	2	8	243971	243978	0 %	75 %	0 %	25 %	45655773
4003	NC_005824	T	6	6	243982	243987	0 %	100 %	0 %	0 %	45655773
4004	NC_005824	TTC	2	6	244034	244039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655773
4005	NC_005824	CAT	2	6	244063	244068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655773
4006	NC_005824	TAC	2	6	244267	244272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655773
4007	NC_005824	TCCAAA	2	12	244276	244287	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45655773
4008	NC_005824	T	8	8	244307	244314	0 %	100 %	0 %	0 %	45655773
4009	NC_005824	ATCC	2	8	244319	244326	25 %	25 %	0 %	50 %	45655773
4010	NC_005824	T	6	6	244372	244377	0 %	100 %	0 %	0 %	45655773
4011	NC_005824	A	6	6	244424	244429	100 %	0 %	0 %	0 %	45655773
4012	NC_005824	TTC	2	6	244440	244445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655773
4013	NC_005824	TCC	2	6	244477	244482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655773
4014	NC_005824	TTC	2	6	244542	244547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655773
4015	NC_005824	T	6	6	244553	244558	0 %	100 %	0 %	0 %	45655773
4016	NC_005824	TGG	3	9	244562	244570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655773
4017	NC_005824	TTC	2	6	244621	244626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655773
4018	NC_005824	TGA	2	6	244679	244684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655773
4019	NC_005824	T	6	6	244709	244714	0 %	100 %	0 %	0 %	45655773
4020	NC_005824	TA	3	6	244747	244752	50 %	50 %	0 %	0 %	45655773
4021	NC_005824	A	6	6	244814	244819	100 %	0 %	0 %	0 %	45655773
4022	NC_005824	TTC	2	6	244852	244857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655773
4023	NC_005824	TCT	2	6	244865	244870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655773
4024	NC_005824	TG	3	6	244934	244939	0 %	50 %	50 %	0 %	45655773
4025	NC_005824	ATA	2	6	245054	245059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655773
4026	NC_005824	TGAAT	2	10	245191	245200	40 %	40 %	20 %	0 %	45655774
4027	NC_005824	AAG	2	6	245278	245283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655774
4028	NC_005824	AGA	2	6	245345	245350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655774
4029	NC_005824	TTC	2	6	245361	245366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655774
4030	NC_005824	T	8	8	245376	245383	0 %	100 %	0 %	0 %	45655774
4031	NC_005824	CTTCT	2	10	245455	245464	0 %	60 %	0 %	40 %	45655774
4032	NC_005824	TCC	2	6	245489	245494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655774
4033	NC_005824	AAG	2	6	245504	245509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655774
4034	NC_005824	CAA	2	6	245515	245520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655774
4035	NC_005824	CTC	2	6	245530	245535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655774
4036	NC_005824	TCCA	2	8	245594	245601	25 %	25 %	0 %	50 %	45655774
4037	NC_005824	AGA	2	6	245633	245638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655774
4038	NC_005824	A	6	6	245675	245680	100 %	0 %	0 %	0 %	45655774
4039	NC_005824	CAG	2	6	245707	245712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655774
4040	NC_005824	T	6	6	245733	245738	0 %	100 %	0 %	0 %	45655774
4041	NC_005824	CTA	2	6	245827	245832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655774
4042	NC_005824	ATTC	2	8	245906	245913	25 %	50 %	0 %	25 %	45655774
4043	NC_005824	ATA	2	6	245961	245966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655774
4044	NC_005824	TTGAA	2	10	245973	245982	40 %	40 %	20 %	0 %	45655774
4045	NC_005824	TCT	2	6	245985	245990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655774
4046	NC_005824	CAA	2	6	248380	248385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655775
4047	NC_005824	CATT	2	8	248388	248395	25 %	50 %	0 %	25 %	45655775
4048	NC_005824	CAG	2	6	248397	248402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655775
4049	NC_005824	TTC	2	6	248413	248418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655775
4050	NC_005824	TGC	2	6	248455	248460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655775
4051	NC_005824	GGAA	2	8	248572	248579	50 %	0 %	50 %	0 %	45655775
4052	NC_005824	T	6	6	248582	248587	0 %	100 %	0 %	0 %	45655775
4053	NC_005824	AGC	2	6	248605	248610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655775
4054	NC_005824	GAA	2	6	248630	248635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655775
4055	NC_005824	CCTT	2	8	248675	248682	0 %	50 %	0 %	50 %	45655775
4056	NC_005824	TCCT	2	8	248697	248704	0 %	50 %	0 %	50 %	45655775
4057	NC_005824	AGC	2	6	248785	248790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655775
4058	NC_005824	TAAA	2	8	248868	248875	75 %	25 %	0 %	0 %	45655775
4059	NC_005824	ATTC	2	8	248876	248883	25 %	50 %	0 %	25 %	45655775
4060	NC_005824	AGA	2	6	248923	248928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655775
4061	NC_005824	TACT	2	8	249027	249034	25 %	50 %	0 %	25 %	45655775
4062	NC_005824	A	6	6	249134	249139	100 %	0 %	0 %	0 %	45655775
4063	NC_005824	GAT	2	6	249200	249205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655775
4064	NC_005824	A	6	6	249262	249267	100 %	0 %	0 %	0 %	45655775
4065	NC_005824	AGG	2	6	249361	249366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655775
4066	NC_005824	GAG	2	6	249384	249389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655775
4067	NC_005824	AGG	2	6	249403	249408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655775
4068	NC_005824	ATC	2	6	249416	249421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655775
4069	NC_005824	CCCT	2	8	249423	249430	0 %	25 %	0 %	75 %	45655775
4070	NC_005824	CCA	2	6	249432	249437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655775
4071	NC_005824	TTA	2	6	249467	249472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655775
4072	NC_005824	GTA	2	6	249488	249493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655775
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4075	NC_005824	GA	3	6	249929	249934	50 %	0 %	50 %	0 %	45655776
4076	NC_005824	TAT	2	6	250018	250023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655776
4077	NC_005824	TCC	2	6	250202	250207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655776
4078	NC_005824	TCC	2	6	250268	250273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655776
4079	NC_005824	A	7	7	250303	250309	100 %	0 %	0 %	0 %	45655776
4080	NC_005824	GTC	2	6	250416	250421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655776
4081	NC_005824	ATT	3	9	250482	250490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655777
4082	NC_005824	TTA	2	6	250491	250496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655777
4083	NC_005824	CCTT	2	8	250527	250534	0 %	50 %	0 %	50 %	45655777
4084	NC_005824	TCT	2	6	250575	250580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655777
4085	NC_005824	AT	3	6	250730	250735	50 %	50 %	0 %	0 %	45655777
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4087	NC_005824	TC	3	6	250761	250766	0 %	50 %	0 %	50 %	45655777
4088	NC_005824	T	6	6	250801	250806	0 %	100 %	0 %	0 %	45655777
4089	NC_005824	TA	3	6	250817	250822	50 %	50 %	0 %	0 %	45655777
4090	NC_005824	TGG	2	6	250882	250887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655777
4091	NC_005824	AGC	2	6	250895	250900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655777
4092	NC_005824	GCT	2	6	250968	250973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655777
4093	NC_005824	T	7	7	251087	251093	0 %	100 %	0 %	0 %	45655777
4094	NC_005824	AAG	2	6	251119	251124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655777
4095	NC_005824	GGA	2	6	251142	251147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655777
4096	NC_005824	TAG	2	6	251161	251166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655777
4097	NC_005824	GATC	2	8	251291	251298	25 %	25 %	25 %	25 %	45655777
4098	NC_005824	GTT	2	6	251445	251450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655777
4099	NC_005824	CGGT	2	8	251458	251465	0 %	25 %	50 %	25 %	45655777
4100	NC_005824	ACG	2	6	251539	251544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655777
4101	NC_005824	CAACC	2	10	251553	251562	40 %	0 %	0 %	60 %	45655777
4102	NC_005824	TTC	2	6	251597	251602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655777
4103	NC_005824	CCT	3	9	251661	251669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655777
4104	NC_005824	CTT	2	6	251743	251748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655777
4105	NC_005824	GCA	2	6	251838	251843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655777
4106	NC_005824	A	7	7	251843	251849	100 %	0 %	0 %	0 %	45655777
4107	NC_005824	GTT	2	6	251868	251873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655777
4108	NC_005824	AGG	2	6	251885	251890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655777
4109	NC_005824	AGCG	2	8	251915	251922	25 %	0 %	50 %	25 %	45655777
4110	NC_005824	CTC	2	6	251944	251949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655777
4111	NC_005824	AT	3	6	252053	252058	50 %	50 %	0 %	0 %	45655777
4112	NC_005824	A	6	6	252091	252096	100 %	0 %	0 %	0 %	45655777
4113	NC_005824	GAA	2	6	252114	252119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655777
4114	NC_005824	TAT	2	6	252153	252158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655777
4115	NC_005824	CT	3	6	252252	252257	0 %	50 %	0 %	50 %	45655777
4116	NC_005824	AAG	2	6	252292	252297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655777
4117	NC_005824	AAG	2	6	252328	252333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655777
4118	NC_005824	AAG	2	6	252357	252362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655777
4119	NC_005824	AG	3	6	252361	252366	50 %	0 %	50 %	0 %	45655777
4120	NC_005824	AGG	2	6	252479	252484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655777
4121	NC_005824	TGG	2	6	252557	252562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655777
4122	NC_005824	AAC	2	6	252618	252623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655777
4123	NC_005824	TAA	2	6	252686	252691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655777
4124	NC_005824	AGA	2	6	252719	252724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655777
4125	NC_005824	A	6	6	252769	252774	100 %	0 %	0 %	0 %	45655777
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4127	NC_005824	AT	3	6	253550	253555	50 %	50 %	0 %	0 %	45655778
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4500	NC_005824	TCC	2	6	274973	274978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655794

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