MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 5571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005824	TCGG	2	8	181434	181441	0 %	25 %	50 %	25 %	45655731
3002	NC_005824	ATC	2	6	181472	181477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655731
3003	NC_005824	GCC	3	9	181979	181987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45655732
3004	NC_005824	CCCG	2	8	182075	182082	0 %	0 %	25 %	75 %	45655732
3005	NC_005824	A	6	6	182132	182137	100 %	0 %	0 %	0 %	45655732
3006	NC_005824	T	8	8	182158	182165	0 %	100 %	0 %	0 %	45655732
3007	NC_005824	T	6	6	182250	182255	0 %	100 %	0 %	0 %	45655732
3008	NC_005824	CAA	2	6	182266	182271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655732
3009	NC_005824	CCA	2	6	183203	183208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655733
3010	NC_005824	TAA	2	6	183209	183214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655733
3011	NC_005824	ATTG	2	8	183249	183256	25 %	50 %	25 %	0 %	45655733
3012	NC_005824	A	7	7	183275	183281	100 %	0 %	0 %	0 %	45655733
3013	NC_005824	ATTTA	2	10	183367	183376	40 %	60 %	0 %	0 %	45655733
3014	NC_005824	TCCTG	2	10	183395	183404	0 %	40 %	20 %	40 %	45655733
3015	NC_005824	TCC	2	6	183478	183483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655733
3016	NC_005824	TGA	2	6	183515	183520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655733
3017	NC_005824	CTTC	2	8	183527	183534	0 %	50 %	0 %	50 %	45655733
3018	NC_005824	CTC	2	6	183633	183638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655733
3019	NC_005824	CT	3	6	183682	183687	0 %	50 %	0 %	50 %	45655733
3020	NC_005824	TTTG	2	8	183691	183698	0 %	75 %	25 %	0 %	45655733
3021	NC_005824	ATA	2	6	183725	183730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655733
3022	NC_005824	A	6	6	183761	183766	100 %	0 %	0 %	0 %	45655733
3023	NC_005824	ACA	2	6	183839	183844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655733
3024	NC_005824	GGA	2	6	183893	183898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655733
3025	NC_005824	GTT	2	6	183971	183976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655733
3026	NC_005824	ATC	2	6	183994	183999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655733
3027	NC_005824	ACT	2	6	184019	184024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655733
3028	NC_005824	A	8	8	184063	184070	100 %	0 %	0 %	0 %	45655733
3029	NC_005824	TA	3	6	184086	184091	50 %	50 %	0 %	0 %	45655733
3030	NC_005824	ATTC	2	8	184122	184129	25 %	50 %	0 %	25 %	45655733
3031	NC_005824	TTA	2	6	184256	184261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655733
3032	NC_005824	TTA	2	6	184367	184372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655733
3033	NC_005824	AGT	2	6	184516	184521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655733
3034	NC_005824	ACCGC	2	10	184577	184586	20 %	0 %	20 %	60 %	45655733
3035	NC_005824	T	6	6	184649	184654	0 %	100 %	0 %	0 %	45655733
3036	NC_005824	AGT	2	6	184672	184677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655733
3037	NC_005824	T	6	6	184696	184701	0 %	100 %	0 %	0 %	45655733
3038	NC_005824	AATTA	2	10	184717	184726	60 %	40 %	0 %	0 %	45655733
3039	NC_005824	CTC	2	6	184731	184736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655733
3040	NC_005824	CTA	2	6	184814	184819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655733
3041	NC_005824	A	6	6	184922	184927	100 %	0 %	0 %	0 %	45655733
3042	NC_005824	TAC	2	6	184930	184935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655733
3043	NC_005824	GCA	2	6	184967	184972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655733
3044	NC_005824	TCT	2	6	185041	185046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655733
3045	NC_005824	TTC	2	6	185080	185085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655733
3046	NC_005824	A	6	6	185217	185222	100 %	0 %	0 %	0 %	45655733
3047	NC_005824	A	7	7	185256	185262	100 %	0 %	0 %	0 %	45655733
3048	NC_005824	TAA	2	6	185353	185358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655734
3049	NC_005824	A	6	6	185431	185436	100 %	0 %	0 %	0 %	45655734
3050	NC_005824	TTTG	2	8	185485	185492	0 %	75 %	25 %	0 %	45655734
3051	NC_005824	AAG	2	6	185537	185542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655734
3052	NC_005824	GTAGAA	2	12	185563	185574	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45655734
3053	NC_005824	TTC	2	6	185838	185843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655734
3054	NC_005824	TTG	2	6	185871	185876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655734
3055	NC_005824	CGG	2	6	185900	185905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655734
3056	NC_005824	TGT	2	6	185908	185913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655734
3057	NC_005824	A	6	6	186074	186079	100 %	0 %	0 %	0 %	45655735
3058	NC_005824	AGT	2	6	186083	186088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655735
3059	NC_005824	AGTGTA	2	12	186114	186125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655735
3060	NC_005824	TTG	2	6	186167	186172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655735
3061	NC_005824	GTA	2	6	186187	186192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655735
3062	NC_005824	AAG	3	9	186218	186226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655735
3063	NC_005824	TAT	2	6	186227	186232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655735
3064	NC_005824	TCA	2	6	186268	186273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655735
3065	NC_005824	AGT	2	6	186396	186401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655735
3066	NC_005824	AAG	2	6	186419	186424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655735
3067	NC_005824	TAA	2	6	186492	186497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655735
3068	NC_005824	T	6	6	186513	186518	0 %	100 %	0 %	0 %	45655735
3069	NC_005824	GTC	2	6	186519	186524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655735
3070	NC_005824	TGT	2	6	186567	186572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655735
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3073	NC_005824	T	6	6	187111	187116	0 %	100 %	0 %	0 %	45655736
3074	NC_005824	TTTA	2	8	187139	187146	25 %	75 %	0 %	0 %	45655736
3075	NC_005824	A	6	6	187146	187151	100 %	0 %	0 %	0 %	45655736
3076	NC_005824	AAG	2	6	187186	187191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655736
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3079	NC_005824	ATCT	2	8	187528	187535	25 %	50 %	0 %	25 %	45655736
3080	NC_005824	ACA	2	6	187559	187564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655736
3081	NC_005824	TTA	2	6	187623	187628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655736
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3083	NC_005824	AGTT	2	8	187768	187775	25 %	50 %	25 %	0 %	45655736
3084	NC_005824	T	6	6	187805	187810	0 %	100 %	0 %	0 %	45655737
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3088	NC_005824	T	6	6	187972	187977	0 %	100 %	0 %	0 %	45655737
3089	NC_005824	GC	3	6	188039	188044	0 %	0 %	50 %	50 %	45655737
3090	NC_005824	TCGGA	2	10	188054	188063	20 %	20 %	40 %	20 %	45655737
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3092	NC_005824	GAT	2	6	188162	188167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655737
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3095	NC_005824	CTT	2	6	188390	188395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655737
3096	NC_005824	AAT	2	6	188414	188419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655737
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3098	NC_005824	TCAA	2	8	188497	188504	50 %	25 %	0 %	25 %	45655737
3099	NC_005824	ATA	2	6	188532	188537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655737
3100	NC_005824	T	6	6	188545	188550	0 %	100 %	0 %	0 %	45655737
3101	NC_005824	TTG	2	6	188567	188572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655737
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3103	NC_005824	CAT	2	6	189012	189017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655738
3104	NC_005824	TTCT	2	8	189035	189042	0 %	75 %	0 %	25 %	45655738
3105	NC_005824	GCA	2	6	189046	189051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655738
3106	NC_005824	T	6	6	189108	189113	0 %	100 %	0 %	0 %	45655738
3107	NC_005824	T	6	6	189118	189123	0 %	100 %	0 %	0 %	45655738
3108	NC_005824	AATA	2	8	189141	189148	75 %	25 %	0 %	0 %	45655738
3109	NC_005824	AAAG	2	8	189214	189221	75 %	0 %	25 %	0 %	45655738
3110	NC_005824	T	6	6	189243	189248	0 %	100 %	0 %	0 %	45655738
3111	NC_005824	TTTG	2	8	189272	189279	0 %	75 %	25 %	0 %	45655738
3112	NC_005824	GTA	2	6	189452	189457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655739
3113	NC_005824	GA	3	6	189460	189465	50 %	0 %	50 %	0 %	45655739
3114	NC_005824	A	7	7	189537	189543	100 %	0 %	0 %	0 %	45655739
3115	NC_005824	T	7	7	189627	189633	0 %	100 %	0 %	0 %	45655739
3116	NC_005824	GA	3	6	189634	189639	50 %	0 %	50 %	0 %	45655739
3117	NC_005824	GTA	2	6	189647	189652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655739
3118	NC_005824	A	6	6	189662	189667	100 %	0 %	0 %	0 %	45655739
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3122	NC_005824	CCT	2	6	189942	189947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655739
3123	NC_005824	AGTA	2	8	190027	190034	50 %	25 %	25 %	0 %	45655739
3124	NC_005824	AAG	2	6	190039	190044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655739
3125	NC_005824	GAAAA	2	10	190120	190129	80 %	0 %	20 %	0 %	45655739
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