MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 5571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005824	CAA	2	6	86215	86220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655659
1502	NC_005824	AGA	2	6	86234	86239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655659
1503	NC_005824	T	6	6	86279	86284	0 %	100 %	0 %	0 %	45655659
1504	NC_005824	CTT	2	6	86302	86307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655659
1505	NC_005824	GATTT	2	10	86441	86450	20 %	60 %	20 %	0 %	45655659
1506	NC_005824	ATA	2	6	86567	86572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655659
1507	NC_005824	AAAT	2	8	86573	86580	75 %	25 %	0 %	0 %	45655659
1508	NC_005824	AGA	2	6	86615	86620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655659
1509	NC_005824	GAA	2	6	86625	86630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655659
1510	NC_005824	T	6	6	86717	86722	0 %	100 %	0 %	0 %	45655660
1511	NC_005824	TAA	2	6	86737	86742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655660
1512	NC_005824	CTT	2	6	86770	86775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655660
1513	NC_005824	ATC	2	6	86790	86795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655660
1514	NC_005824	GAA	2	6	86800	86805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655660
1515	NC_005824	TTTGA	2	10	86882	86891	20 %	60 %	20 %	0 %	45655660
1516	NC_005824	ATAGAA	2	12	86970	86981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45655660
1517	NC_005824	AGG	3	9	86987	86995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655660
1518	NC_005824	T	6	6	87087	87092	0 %	100 %	0 %	0 %	45655660
1519	NC_005824	TTGCTT	2	12	87127	87138	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	45655660
1520	NC_005824	TTTG	2	8	87217	87224	0 %	75 %	25 %	0 %	45655660
1521	NC_005824	GTT	2	6	87235	87240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655660
1522	NC_005824	GTA	2	6	87350	87355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655660
1523	NC_005824	T	6	6	87356	87361	0 %	100 %	0 %	0 %	45655660
1524	NC_005824	GAA	2	6	87366	87371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655660
1525	NC_005824	ATAA	2	8	87383	87390	75 %	25 %	0 %	0 %	45655660
1526	NC_005824	T	7	7	87413	87419	0 %	100 %	0 %	0 %	45655660
1527	NC_005824	GT	3	6	87443	87448	0 %	50 %	50 %	0 %	45655660
1528	NC_005824	CGT	2	6	87457	87462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655660
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1531	NC_005824	GAT	3	9	87640	87648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655660
1532	NC_005824	T	6	6	87758	87763	0 %	100 %	0 %	0 %	45655660
1533	NC_005824	CTGA	2	8	87799	87806	25 %	25 %	25 %	25 %	45655660
1534	NC_005824	TTG	2	6	87844	87849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655660
1535	NC_005824	T	8	8	87863	87870	0 %	100 %	0 %	0 %	45655660
1536	NC_005824	T	8	8	87879	87886	0 %	100 %	0 %	0 %	45655660
1537	NC_005824	GAA	2	6	87903	87908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655660
1538	NC_005824	T	9	9	87922	87930	0 %	100 %	0 %	0 %	45655660
1539	NC_005824	TCT	2	6	87945	87950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655660
1540	NC_005824	ATA	2	6	87966	87971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655660
1541	NC_005824	TTTCGA	2	12	88053	88064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45655660
1542	NC_005824	GTT	2	6	88113	88118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655660
1543	NC_005824	CTT	2	6	88327	88332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655661
1544	NC_005824	TTTG	2	8	88405	88412	0 %	75 %	25 %	0 %	45655661
1545	NC_005824	T	6	6	88488	88493	0 %	100 %	0 %	0 %	45655661
1546	NC_005824	A	6	6	88532	88537	100 %	0 %	0 %	0 %	45655661
1547	NC_005824	GTA	2	6	88583	88588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655661
1548	NC_005824	TGT	2	6	88593	88598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655661
1549	NC_005824	TCT	2	6	88639	88644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655661
1550	NC_005824	TCG	2	6	88683	88688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655661
1551	NC_005824	T	6	6	88733	88738	0 %	100 %	0 %	0 %	45655661
1552	NC_005824	AGT	2	6	88800	88805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655661
1553	NC_005824	TTTTTC	2	12	88811	88822	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45655661
1554	NC_005824	ATG	2	6	89587	89592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655662
1555	NC_005824	TAT	2	6	89642	89647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655662
1556	NC_005824	A	6	6	89718	89723	100 %	0 %	0 %	0 %	45655662
1557	NC_005824	CAG	2	6	89810	89815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655662
1558	NC_005824	AAG	2	6	89816	89821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655662
1559	NC_005824	A	6	6	89822	89827	100 %	0 %	0 %	0 %	45655662
1560	NC_005824	GCT	2	6	89845	89850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655662
1561	NC_005824	T	6	6	89886	89891	0 %	100 %	0 %	0 %	45655662
1562	NC_005824	A	6	6	89899	89904	100 %	0 %	0 %	0 %	45655662
1563	NC_005824	GAT	2	6	89914	89919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655662
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1565	NC_005824	GATT	2	8	90038	90045	25 %	50 %	25 %	0 %	45655662
1566	NC_005824	AAG	2	6	90077	90082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655662
1567	NC_005824	T	6	6	90172	90177	0 %	100 %	0 %	0 %	45655662
1568	NC_005824	AGG	2	6	90252	90257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655662
1569	NC_005824	A	6	6	90321	90326	100 %	0 %	0 %	0 %	45655662
1570	NC_005824	T	7	7	90378	90384	0 %	100 %	0 %	0 %	45655662
1571	NC_005824	T	6	6	90525	90530	0 %	100 %	0 %	0 %	45655663
1572	NC_005824	TAT	2	6	90735	90740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655663
1573	NC_005824	TTC	2	6	90817	90822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655663
1574	NC_005824	AAG	2	6	91134	91139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655664
1575	NC_005824	AAGAT	2	10	91145	91154	60 %	20 %	20 %	0 %	45655664
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1579	NC_005824	AG	3	6	91295	91300	50 %	0 %	50 %	0 %	45655664
1580	NC_005824	TGT	2	6	91323	91328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655664
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1583	NC_005824	T	6	6	91442	91447	0 %	100 %	0 %	0 %	45655664
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1593	NC_005824	TTTCG	2	10	92784	92793	0 %	60 %	20 %	20 %	45655665
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1599	NC_005824	TTC	2	6	93087	93092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655665
1600	NC_005824	TGG	2	6	93101	93106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655665
1601	NC_005824	AAG	2	6	93107	93112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655665
1602	NC_005824	CTT	2	6	93176	93181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655665
1603	NC_005824	GGT	2	6	93204	93209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655665
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1605	NC_005824	CGG	2	6	93282	93287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655665
1606	NC_005824	A	7	7	93309	93315	100 %	0 %	0 %	0 %	45655665
1607	NC_005824	CTGG	2	8	93354	93361	0 %	25 %	50 %	25 %	45655665
1608	NC_005824	TCT	2	6	93375	93380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655665
1609	NC_005824	GAA	2	6	93424	93429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655665
1610	NC_005824	AGG	2	6	93479	93484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655665
1611	NC_005824	AAC	2	6	93499	93504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655666
1612	NC_005824	TC	3	6	93538	93543	0 %	50 %	0 %	50 %	45655666
1613	NC_005824	A	7	7	93628	93634	100 %	0 %	0 %	0 %	45655666
1614	NC_005824	TCT	2	6	93734	93739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655666
1615	NC_005824	GAA	2	6	93824	93829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655666
1616	NC_005824	TGG	2	6	93836	93841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655666
1617	NC_005824	T	6	6	93860	93865	0 %	100 %	0 %	0 %	45655666
1618	NC_005824	A	6	6	94010	94015	100 %	0 %	0 %	0 %	45655666
1619	NC_005824	TC	3	6	94097	94102	0 %	50 %	0 %	50 %	45655666
1620	NC_005824	TTC	2	6	94281	94286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655666
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1622	NC_005824	GTA	2	6	94319	94324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655666
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1625	NC_005824	AAC	2	6	94439	94444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655666
1626	NC_005824	A	6	6	94460	94465	100 %	0 %	0 %	0 %	45655666
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1628	NC_005824	CTT	2	6	94569	94574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655666
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1998	NC_005824	GAAAA	2	10	118182	118191	80 %	0 %	20 %	0 %	45655685
1999	NC_005824	GAA	2	6	118258	118263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655685
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