MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 5571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005824	CAA	2	6	274999	275004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655794
4502	NC_005824	GGA	2	6	275028	275033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655794
4503	NC_005824	AAT	2	6	275103	275108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655794
4504	NC_005824	AACA	2	8	275232	275239	75 %	0 %	0 %	25 %	45655794
4505	NC_005824	T	6	6	275270	275275	0 %	100 %	0 %	0 %	45655794
4506	NC_005824	ACC	2	6	275286	275291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655794
4507	NC_005824	CAA	2	6	275304	275309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655794
4508	NC_005824	AAT	2	6	275319	275324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655794
4509	NC_005824	TAC	2	6	275345	275350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655794
4510	NC_005824	CGG	2	6	275435	275440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655794
4511	NC_005824	ACT	2	6	275441	275446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655794
4512	NC_005824	GATC	2	8	275669	275676	25 %	25 %	25 %	25 %	45655794
4513	NC_005824	AAAC	2	8	275819	275826	75 %	0 %	0 %	25 %	45655794
4514	NC_005824	AAT	2	6	275841	275846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655794
4515	NC_005824	TTGGT	2	10	275912	275921	0 %	60 %	40 %	0 %	45655794
4516	NC_005824	GGTT	2	8	276016	276023	0 %	50 %	50 %	0 %	45655794
4517	NC_005824	ATC	2	6	276078	276083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655794
4518	NC_005824	AATTT	2	10	276084	276093	40 %	60 %	0 %	0 %	45655794
4519	NC_005824	GAC	2	6	276177	276182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655794
4520	NC_005824	CAA	2	6	276239	276244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655794
4521	NC_005824	ATC	2	6	276360	276365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655794
4522	NC_005824	TA	3	6	276370	276375	50 %	50 %	0 %	0 %	45655794
4523	NC_005824	GA	3	6	276377	276382	50 %	0 %	50 %	0 %	45655794
4524	NC_005824	GA	3	6	276394	276399	50 %	0 %	50 %	0 %	45655794
4525	NC_005824	CTTAC	2	10	276462	276471	20 %	40 %	0 %	40 %	45655794
4526	NC_005824	AGG	2	6	276473	276478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655794
4527	NC_005824	ATT	2	6	276483	276488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655794
4528	NC_005824	CTTT	2	8	276490	276497	0 %	75 %	0 %	25 %	45655794
4529	NC_005824	A	8	8	276527	276534	100 %	0 %	0 %	0 %	45655795
4530	NC_005824	TAC	2	6	276663	276668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655795
4531	NC_005824	CCT	2	6	276683	276688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655795
4532	NC_005824	CTAC	2	8	276758	276765	25 %	25 %	0 %	50 %	45655795
4533	NC_005824	GAA	2	6	276776	276781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655795
4534	NC_005824	TTC	2	6	276811	276816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655795
4535	NC_005824	ATTC	2	8	276851	276858	25 %	50 %	0 %	25 %	45655795
4536	NC_005824	TAAA	2	8	276927	276934	75 %	25 %	0 %	0 %	45655795
4537	NC_005824	AATTTT	2	12	277210	277221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655796
4538	NC_005824	TTC	2	6	277251	277256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655796
4539	NC_005824	AT	3	6	277329	277334	50 %	50 %	0 %	0 %	45655796
4540	NC_005824	TC	3	6	277344	277349	0 %	50 %	0 %	50 %	45655796
4541	NC_005824	GGTC	2	8	277372	277379	0 %	25 %	50 %	25 %	45655796
4542	NC_005824	AAG	2	6	277401	277406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655796
4543	NC_005824	ATC	2	6	277412	277417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655796
4544	NC_005824	ATT	2	6	277644	277649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655796
4545	NC_005824	AAG	2	6	277724	277729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655796
4546	NC_005824	CTCC	2	8	277834	277841	0 %	25 %	0 %	75 %	45655797
4547	NC_005824	GAA	2	6	277851	277856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655797
4548	NC_005824	TGG	2	6	277882	277887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655797
4549	NC_005824	TTC	2	6	277900	277905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655797
4550	NC_005824	CTT	2	6	277931	277936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655797
4551	NC_005824	A	7	7	277937	277943	100 %	0 %	0 %	0 %	45655797
4552	NC_005824	ATCAAT	2	12	277950	277961	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45655797
4553	NC_005824	TTC	2	6	278135	278140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655797
4554	NC_005824	TTTTA	2	10	278321	278330	20 %	80 %	0 %	0 %	45655798
4555	NC_005824	GAA	3	9	278376	278384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655798
4556	NC_005824	TCT	2	6	278388	278393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655798
4557	NC_005824	AGA	2	6	278426	278431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655798
4558	NC_005824	TCC	2	6	278435	278440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655798
4559	NC_005824	AAC	2	6	278456	278461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655798
4560	NC_005824	CCAA	2	8	278503	278510	50 %	0 %	0 %	50 %	45655798
4561	NC_005824	AGA	2	6	278516	278521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655798
4562	NC_005824	ATTT	2	8	278584	278591	25 %	75 %	0 %	0 %	45655798
4563	NC_005824	T	7	7	278645	278651	0 %	100 %	0 %	0 %	45655798
4564	NC_005824	CAG	2	6	278668	278673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655798
4565	NC_005824	GTC	2	6	278694	278699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655798
4566	NC_005824	GTT	2	6	278700	278705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655798
4567	NC_005824	TGA	2	6	278771	278776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655798
4568	NC_005824	AGC	2	6	278777	278782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655798
4569	NC_005824	TTTC	2	8	278863	278870	0 %	75 %	0 %	25 %	45655798
4570	NC_005824	AGA	2	6	278876	278881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655798
4571	NC_005824	TGA	2	6	280056	280061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655799
4572	NC_005824	ATG	2	6	280083	280088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655799
4573	NC_005824	TTTC	2	8	280094	280101	0 %	75 %	0 %	25 %	45655799
4574	NC_005824	CAA	2	6	280120	280125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655799
4575	NC_005824	A	7	7	280124	280130	100 %	0 %	0 %	0 %	45655799
4576	NC_005824	CACAAA	2	12	280139	280150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655799
4577	NC_005824	TAT	2	6	280222	280227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655799
4578	NC_005824	A	9	9	280271	280279	100 %	0 %	0 %	0 %	45655799
4579	NC_005824	TGG	2	6	280321	280326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655799
4580	NC_005824	CCT	2	6	280382	280387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655799
4581	NC_005824	AAAG	2	8	280406	280413	75 %	0 %	25 %	0 %	45655799
4582	NC_005824	A	6	6	280431	280436	100 %	0 %	0 %	0 %	45655799
4583	NC_005824	T	6	6	280522	280527	0 %	100 %	0 %	0 %	45655799
4584	NC_005824	GAA	2	6	280619	280624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655799
4585	NC_005824	TAC	2	6	280634	280639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655799
4586	NC_005824	CA	3	6	280657	280662	50 %	0 %	0 %	50 %	45655799
4587	NC_005824	ATC	2	6	280727	280732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655799
4588	NC_005824	TCTTT	2	10	280856	280865	0 %	80 %	0 %	20 %	45655800
4589	NC_005824	ATTT	2	8	280938	280945	25 %	75 %	0 %	0 %	45655800
4590	NC_005824	T	8	8	280991	280998	0 %	100 %	0 %	0 %	45655800
4591	NC_005824	AGA	2	6	281023	281028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655800
4592	NC_005824	AT	4	8	281070	281077	50 %	50 %	0 %	0 %	45655800
4593	NC_005824	AGG	2	6	281126	281131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655800
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4595	NC_005824	AAT	2	6	281188	281193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655800
4596	NC_005824	AAC	2	6	281208	281213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655800
4597	NC_005824	A	6	6	281350	281355	100 %	0 %	0 %	0 %	45655800
4598	NC_005824	CGT	2	6	281373	281378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655800
4599	NC_005824	TC	3	6	281404	281409	0 %	50 %	0 %	50 %	45655800
4600	NC_005824	A	6	6	281412	281417	100 %	0 %	0 %	0 %	45655800
4601	NC_005824	GAT	2	6	281445	281450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655800
4602	NC_005824	GAT	2	6	281619	281624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655800
4603	NC_005824	TTC	2	6	281669	281674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655800
4604	NC_005824	A	6	6	281680	281685	100 %	0 %	0 %	0 %	45655800
4605	NC_005824	GAG	2	6	281711	281716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655800
4606	NC_005824	GAAC	2	8	281862	281869	50 %	0 %	25 %	25 %	45655800
4607	NC_005824	AAAC	2	8	281884	281891	75 %	0 %	0 %	25 %	45655800
4608	NC_005824	CAA	2	6	281892	281897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655800
4609	NC_005824	CGG	2	6	281922	281927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655800
4610	NC_005824	ATG	2	6	282139	282144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655800
4611	NC_005824	AAG	2	6	282287	282292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655800
4612	NC_005824	CA	3	6	282303	282308	50 %	0 %	0 %	50 %	45655800
4613	NC_005824	GCA	2	6	282310	282315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655800
4614	NC_005824	GAA	2	6	282466	282471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655800
4615	NC_005824	ACT	2	6	282484	282489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655800
4616	NC_005824	CTTTT	2	10	282866	282875	0 %	80 %	0 %	20 %	45655801
4617	NC_005824	GAA	2	6	282888	282893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655801
4618	NC_005824	GAA	2	6	282951	282956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655801
4619	NC_005824	GTT	2	6	282979	282984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655801
4620	NC_005824	TA	3	6	282988	282993	50 %	50 %	0 %	0 %	45655801
4621	NC_005824	TCC	2	6	283058	283063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655801
4622	NC_005824	TAT	2	6	283112	283117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655801
4623	NC_005824	TTTA	2	8	283137	283144	25 %	75 %	0 %	0 %	45655801
4624	NC_005824	T	7	7	283149	283155	0 %	100 %	0 %	0 %	45655801
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