MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 68420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_005823	TTGG	2	8	232853	232860	0 %	50 %	50 %	0 %	45656108
4003	NC_005823	ATT	2	6	232875	232880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656108
4004	NC_005823	TAG	2	6	232917	232922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656108
4005	NC_005823	GAT	2	6	233949	233954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656109
4006	NC_005823	GAAAA	2	10	233996	234005	80 %	0 %	20 %	0 %	45656109
4007	NC_005823	A	8	8	234002	234009	100 %	0 %	0 %	0 %	45656109
4008	NC_005823	AAGA	2	8	234051	234058	75 %	0 %	25 %	0 %	45656109
4009	NC_005823	AGA	2	6	234112	234117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656109
4010	NC_005823	A	6	6	234122	234127	100 %	0 %	0 %	0 %	45656109
4011	NC_005823	TTC	2	6	234238	234243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656109
4012	NC_005823	ATC	2	6	234293	234298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656109
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4014	NC_005823	AG	3	6	234326	234331	50 %	0 %	50 %	0 %	45656109
4015	NC_005823	CA	3	6	234364	234369	50 %	0 %	0 %	50 %	45656109
4016	NC_005823	CCG	2	6	234380	234385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45656109
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4018	NC_005823	A	7	7	234416	234422	100 %	0 %	0 %	0 %	45656109
4019	NC_005823	AAAG	2	8	234429	234436	75 %	0 %	25 %	0 %	45656109
4020	NC_005823	GCA	2	6	234452	234457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656109
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4022	NC_005823	CAT	2	6	234517	234522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656109
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4030	NC_005823	CGTT	2	8	234845	234852	0 %	50 %	25 %	25 %	45656110
4031	NC_005823	GTAA	2	8	234896	234903	50 %	25 %	25 %	0 %	45656110
4032	NC_005823	A	6	6	234952	234957	100 %	0 %	0 %	0 %	45656110
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4041	NC_005823	TC	3	6	235328	235333	0 %	50 %	0 %	50 %	45656110
4042	NC_005823	AAAG	2	8	235363	235370	75 %	0 %	25 %	0 %	45656110
4043	NC_005823	AGA	2	6	235538	235543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656110
4044	NC_005823	A	6	6	235553	235558	100 %	0 %	0 %	0 %	45656110
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4046	NC_005823	GA	3	6	235575	235580	50 %	0 %	50 %	0 %	45656110
4047	NC_005823	CAAAA	2	10	235623	235632	80 %	0 %	0 %	20 %	45656110
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4049	NC_005823	AG	3	6	235721	235726	50 %	0 %	50 %	0 %	45656110
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4054	NC_005823	TCTT	2	8	236109	236116	0 %	75 %	0 %	25 %	45656111
4055	NC_005823	T	6	6	236115	236120	0 %	100 %	0 %	0 %	45656111
4056	NC_005823	TC	3	6	236143	236148	0 %	50 %	0 %	50 %	45656111
4057	NC_005823	AAT	2	6	236174	236179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656111
4058	NC_005823	TTTA	2	8	236245	236252	25 %	75 %	0 %	0 %	45656112
4059	NC_005823	CTTT	2	8	236366	236373	0 %	75 %	0 %	25 %	45656112
4060	NC_005823	T	7	7	236410	236416	0 %	100 %	0 %	0 %	45656112
4061	NC_005823	TAT	2	6	236450	236455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656112
4062	NC_005823	A	6	6	236507	236512	100 %	0 %	0 %	0 %	45656112
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4064	NC_005823	ATC	2	6	236756	236761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656112
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4067	NC_005823	T	6	6	236883	236888	0 %	100 %	0 %	0 %	45656112
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4074	NC_005823	TGA	2	6	237520	237525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656113
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4105	NC_005823	GGGA	2	8	239571	239578	25 %	0 %	75 %	0 %	45656114
4106	NC_005823	TCT	2	6	239599	239604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656114
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4111	NC_005823	ACG	2	6	239715	239720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656115
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4113	NC_005823	TCA	2	6	239836	239841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656115
4114	NC_005823	CGT	2	6	239872	239877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45656115
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4122	NC_005823	TGGT	2	8	240291	240298	0 %	50 %	50 %	0 %	45656115
4123	NC_005823	A	7	7	241838	241844	100 %	0 %	0 %	0 %	45656116
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4127	NC_005823	ACC	2	6	241975	241980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45656116
4128	NC_005823	AAGATC	2	12	241983	241994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45656116
4129	NC_005823	ATTG	2	8	242017	242024	25 %	50 %	25 %	0 %	45656116
4130	NC_005823	TTG	2	6	242030	242035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45656116
4131	NC_005823	ATC	2	6	242102	242107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656116
4132	NC_005823	TCT	2	6	242108	242113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656116
4133	NC_005823	A	7	7	242116	242122	100 %	0 %	0 %	0 %	45656116
4134	NC_005823	TAA	2	6	242682	242687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656117
4135	NC_005823	TCGA	2	8	242688	242695	25 %	25 %	25 %	25 %	45656117
4136	NC_005823	A	6	6	242700	242705	100 %	0 %	0 %	0 %	45656117
4137	NC_005823	T	6	6	242736	242741	0 %	100 %	0 %	0 %	45656117
4138	NC_005823	ATT	2	6	242809	242814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656117
4139	NC_005823	GAA	2	6	243021	243026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656118
4140	NC_005823	GAC	2	6	243050	243055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45656118
4141	NC_005823	A	7	7	243079	243085	100 %	0 %	0 %	0 %	45656118
4142	NC_005823	T	7	7	243105	243111	0 %	100 %	0 %	0 %	45656118
4143	NC_005823	GAA	2	6	243126	243131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656118
4144	NC_005823	A	6	6	243143	243148	100 %	0 %	0 %	0 %	45656118
4145	NC_005823	AG	3	6	243179	243184	50 %	0 %	50 %	0 %	45656118
4146	NC_005823	TCC	2	6	243221	243226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45656118
4147	NC_005823	GTA	2	6	243252	243257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656118
4148	NC_005823	GAA	2	6	243295	243300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656118
4149	NC_005823	GAA	2	6	243331	243336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656118
4150	NC_005823	TTC	2	6	243344	243349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656118
4151	NC_005823	GAA	3	9	243384	243392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656118
4152	NC_005823	AAG	2	6	243397	243402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656118
4153	NC_005823	A	6	6	243409	243414	100 %	0 %	0 %	0 %	45656118
4154	NC_005823	TACT	2	8	243552	243559	25 %	50 %	0 %	25 %	45656119
4155	NC_005823	ATCCA	2	10	243617	243626	40 %	20 %	0 %	40 %	45656119
4156	NC_005823	GA	3	6	243635	243640	50 %	0 %	50 %	0 %	45656119
4157	NC_005823	AAG	2	6	243676	243681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656119
4158	NC_005823	GTA	2	6	243707	243712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656119
4159	NC_005823	ATC	2	6	243766	243771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656119
4160	NC_005823	A	6	6	243775	243780	100 %	0 %	0 %	0 %	45656119
4161	NC_005823	CTC	2	6	243802	243807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45656119
4162	NC_005823	AAGA	2	8	243808	243815	75 %	0 %	25 %	0 %	45656119
4163	NC_005823	CAT	2	6	243948	243953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656119
4164	NC_005823	GA	3	6	243955	243960	50 %	0 %	50 %	0 %	45656119
4165	NC_005823	AAG	3	9	244025	244033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656119
4166	NC_005823	CT	3	6	244069	244074	0 %	50 %	0 %	50 %	45656119
4167	NC_005823	A	7	7	244082	244088	100 %	0 %	0 %	0 %	45656119
4168	NC_005823	AGA	3	9	244092	244100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656119
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4170	NC_005823	GTT	2	6	244254	244259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45656120
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4173	NC_005823	T	6	6	244327	244332	0 %	100 %	0 %	0 %	45656120
4174	NC_005823	GC	3	6	244345	244350	0 %	0 %	50 %	50 %	45656120
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4182	NC_005823	TTC	2	6	244673	244678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656120
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4193	NC_005823	ATG	2	6	245377	245382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656121
4194	NC_005823	TGG	2	6	245461	245466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45656121
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4196	NC_005823	GTT	2	6	245605	245610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45656121
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4199	NC_005823	AGA	2	6	245667	245672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656121
4200	NC_005823	GAAT	2	8	245747	245754	50 %	25 %	25 %	0 %	45656121
4201	NC_005823	AAG	2	6	245785	245790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656121
4202	NC_005823	ATC	2	6	245797	245802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656121
4203	NC_005823	GA	3	6	245822	245827	50 %	0 %	50 %	0 %	45656121
4204	NC_005823	A	6	6	245830	245835	100 %	0 %	0 %	0 %	45656121
4205	NC_005823	AAC	2	6	245958	245963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45656121
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4210	NC_005823	CTG	2	6	246173	246178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45656121
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4215	NC_005823	A	6	6	246476	246481	100 %	0 %	0 %	0 %	45656121
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4221	NC_005823	AATTT	2	10	246825	246834	40 %	60 %	0 %	0 %	45656121
4222	NC_005823	TAAAA	2	10	247445	247454	80 %	20 %	0 %	0 %	45656122
4223	NC_005823	TAAA	2	8	247458	247465	75 %	25 %	0 %	0 %	45656122
4224	NC_005823	GAA	2	6	247481	247486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45656122
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4226	NC_005823	ATT	2	6	247648	247653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45656122
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4230	NC_005823	ATTG	2	8	247723	247730	25 %	50 %	25 %	0 %	45656123
4231	NC_005823	AGT	2	6	247747	247752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45656123
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4233	NC_005823	TAA	3	9	247814	247822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656123
4234	NC_005823	CTTT	2	8	247836	247843	0 %	75 %	0 %	25 %	45656123
4235	NC_005823	TAA	2	6	247853	247858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656123
4236	NC_005823	CTT	2	6	247977	247982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656123
4237	NC_005823	TCA	3	9	248001	248009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45656123
4238	NC_005823	TAA	2	6	248219	248224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656123
4239	NC_005823	CTT	2	6	248228	248233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45656123
4240	NC_005823	GTAC	2	8	248250	248257	25 %	25 %	25 %	25 %	45656123
4241	NC_005823	AAT	2	6	248366	248371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656123
4242	NC_005823	T	6	6	248373	248378	0 %	100 %	0 %	0 %	45656123
4243	NC_005823	A	6	6	248383	248388	100 %	0 %	0 %	0 %	45656123
4244	NC_005823	ATTC	2	8	248401	248408	25 %	50 %	0 %	25 %	45656123
4245	NC_005823	T	6	6	248458	248463	0 %	100 %	0 %	0 %	45656124
4246	NC_005823	TTG	2	6	248515	248520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45656124
4247	NC_005823	A	6	6	248524	248529	100 %	0 %	0 %	0 %	45656124
4248	NC_005823	ATA	2	6	248539	248544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656124
4249	NC_005823	TTGAA	2	10	248584	248593	40 %	40 %	20 %	0 %	45656124
4250	NC_005823	CTC	2	6	248596	248601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45656124
4251	NC_005823	CCG	2	6	248606	248611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45656124
4252	NC_005823	T	6	6	248638	248643	0 %	100 %	0 %	0 %	45656124
4253	NC_005823	T	6	6	248659	248664	0 %	100 %	0 %	0 %	45656124
4254	NC_005823	ATA	2	6	248665	248670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45656124
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4284	NC_005823	T	6	6	249914	249919	0 %	100 %	0 %	0 %	45656125
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4371	NC_005823	AAGA	2	8	255620	255627	75 %	0 %	25 %	0 %	45656127
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