MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 40435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005362	TGG	2	6	49641	49646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518125
1002	NC_005362	A	6	6	49665	49670	100 %	0 %	0 %	0 %	42518125
1003	NC_005362	TAA	2	6	49773	49778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518125
1004	NC_005362	ATT	2	6	49795	49800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518125
1005	NC_005362	T	6	6	49803	49808	0 %	100 %	0 %	0 %	42518125
1006	NC_005362	T	6	6	49853	49858	0 %	100 %	0 %	0 %	42518126
1007	NC_005362	TTA	2	6	49864	49869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518126
1008	NC_005362	ATG	2	6	49872	49877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518126
1009	NC_005362	GAT	2	6	49929	49934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518126
1010	NC_005362	CATA	2	8	50036	50043	50 %	25 %	0 %	25 %	42518126
1011	NC_005362	AATA	2	8	50057	50064	75 %	25 %	0 %	0 %	42518126
1012	NC_005362	CCA	2	6	50073	50078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518126
1013	NC_005362	ATT	2	6	50287	50292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518127
1014	NC_005362	GCTC	2	8	50308	50315	0 %	25 %	25 %	50 %	42518127
1015	NC_005362	GAT	2	6	50316	50321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518127
1016	NC_005362	ATT	2	6	50449	50454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518127
1017	NC_005362	TTAA	2	8	50485	50492	50 %	50 %	0 %	0 %	42518127
1018	NC_005362	ATCA	2	8	50531	50538	50 %	25 %	0 %	25 %	42518127
1019	NC_005362	GAT	2	6	50539	50544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518127
1020	NC_005362	CATTA	2	10	50572	50581	40 %	40 %	0 %	20 %	42518127
1021	NC_005362	ACA	2	6	50596	50601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518127
1022	NC_005362	TC	3	6	50729	50734	0 %	50 %	0 %	50 %	42518127
1023	NC_005362	T	6	6	50739	50744	0 %	100 %	0 %	0 %	42518127
1024	NC_005362	GTC	2	6	50750	50755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518127
1025	NC_005362	T	6	6	50836	50841	0 %	100 %	0 %	0 %	42518127
1026	NC_005362	TAC	2	6	50856	50861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518127
1027	NC_005362	ATT	2	6	50881	50886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518127
1028	NC_005362	TATT	2	8	50924	50931	25 %	75 %	0 %	0 %	42518127
1029	NC_005362	TTA	2	6	50957	50962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518127
1030	NC_005362	TGATTA	2	12	51035	51046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42518127
1031	NC_005362	GCAA	2	8	51088	51095	50 %	0 %	25 %	25 %	42518127
1032	NC_005362	GTT	2	6	51124	51129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518127
1033	NC_005362	TTG	2	6	51170	51175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518127
1034	NC_005362	AAAAAG	2	12	51226	51237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42518127
1035	NC_005362	A	6	6	51262	51267	100 %	0 %	0 %	0 %	42518127
1036	NC_005362	A	6	6	51474	51479	100 %	0 %	0 %	0 %	42518128
1037	NC_005362	TA	3	6	51486	51491	50 %	50 %	0 %	0 %	42518128
1038	NC_005362	ACA	2	6	51542	51547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518128
1039	NC_005362	GTTT	2	8	51574	51581	0 %	75 %	25 %	0 %	42518128
1040	NC_005362	AT	3	6	51618	51623	50 %	50 %	0 %	0 %	42518128
1041	NC_005362	ATCAA	2	10	51650	51659	60 %	20 %	0 %	20 %	42518128
1042	NC_005362	AAT	2	6	51677	51682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518128
1043	NC_005362	AAATT	2	10	51696	51705	60 %	40 %	0 %	0 %	42518128
1044	NC_005362	A	6	6	51764	51769	100 %	0 %	0 %	0 %	42518128
1045	NC_005362	TTG	2	6	51811	51816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518128
1046	NC_005362	ACAA	2	8	51821	51828	75 %	0 %	0 %	25 %	42518128
1047	NC_005362	GAA	2	6	51880	51885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518128
1048	NC_005362	AC	3	6	51965	51970	50 %	0 %	0 %	50 %	42518128
1049	NC_005362	GGT	2	6	51984	51989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518128
1050	NC_005362	GCT	2	6	52020	52025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518128
1051	NC_005362	GAG	2	6	52054	52059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518128
1052	NC_005362	TAG	2	6	52102	52107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518128
1053	NC_005362	AATTTG	2	12	52132	52143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42518128
1054	NC_005362	TGT	2	6	52184	52189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518128
1055	NC_005362	TGAAT	2	10	52190	52199	40 %	40 %	20 %	0 %	42518128
1056	NC_005362	GCT	2	6	52278	52283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518128
1057	NC_005362	ATT	2	6	52291	52296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518128
1058	NC_005362	AACG	2	8	52331	52338	50 %	0 %	25 %	25 %	42518128
1059	NC_005362	AATT	2	8	52457	52464	50 %	50 %	0 %	0 %	42518128
1060	NC_005362	AATC	2	8	52517	52524	50 %	25 %	0 %	25 %	42518128
1061	NC_005362	AGT	2	6	52584	52589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518128
1062	NC_005362	TTG	2	6	52651	52656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518128
1063	NC_005362	ATT	2	6	52696	52701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518128
1064	NC_005362	ATT	2	6	52710	52715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518128
1065	NC_005362	TAA	2	6	52727	52732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518128
1066	NC_005362	CTT	2	6	52877	52882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518129
1067	NC_005362	AATT	2	8	52956	52963	50 %	50 %	0 %	0 %	42518129
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1069	NC_005362	GAT	2	6	53025	53030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518129
1070	NC_005362	ATTT	2	8	53084	53091	25 %	75 %	0 %	0 %	42518129
1071	NC_005362	GAT	2	6	53125	53130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518129
1072	NC_005362	TGT	2	6	53134	53139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518129
1073	NC_005362	AGT	2	6	53223	53228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518129
1074	NC_005362	ACC	2	6	53307	53312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518129
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1077	NC_005362	GTA	2	6	53407	53412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518129
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1083	NC_005362	CTT	2	6	53744	53749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518129
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1088	NC_005362	AATT	2	8	54106	54113	50 %	50 %	0 %	0 %	42518130
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1091	NC_005362	AATA	2	8	54220	54227	75 %	25 %	0 %	0 %	42518130
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1098	NC_005362	AG	3	6	54502	54507	50 %	0 %	50 %	0 %	42518130
1099	NC_005362	ACC	2	6	54514	54519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518130
1100	NC_005362	AAT	2	6	54619	54624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518130
1101	NC_005362	AAG	2	6	54637	54642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518130
1102	NC_005362	ATC	2	6	54780	54785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518131
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1104	NC_005362	AGT	2	6	54833	54838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518131
1105	NC_005362	CGAT	2	8	54876	54883	25 %	25 %	25 %	25 %	42518131
1106	NC_005362	CAA	2	6	55021	55026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518131
1107	NC_005362	GATT	2	8	55076	55083	25 %	50 %	25 %	0 %	42518131
1108	NC_005362	CAT	2	6	55084	55089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518131
1109	NC_005362	GTGAA	2	10	55124	55133	40 %	20 %	40 %	0 %	42518131
1110	NC_005362	GCTT	2	8	55143	55150	0 %	50 %	25 %	25 %	42518131
1111	NC_005362	TCA	2	6	55158	55163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518131
1112	NC_005362	GTA	2	6	55175	55180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518131
1113	NC_005362	CTT	2	6	55184	55189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518131
1114	NC_005362	ACA	2	6	55287	55292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518131
1115	NC_005362	CAA	2	6	55294	55299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518131
1116	NC_005362	TAG	2	6	55324	55329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518131
1117	NC_005362	GTA	2	6	55384	55389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518131
1118	NC_005362	AGC	2	6	55394	55399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518131
1119	NC_005362	GCA	2	6	55407	55412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518131
1120	NC_005362	TGT	2	6	55492	55497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518131
1121	NC_005362	TTG	2	6	55577	55582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518131
1122	NC_005362	ACA	3	9	55587	55595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518131
1123	NC_005362	TG	3	6	55669	55674	0 %	50 %	50 %	0 %	42518131
1124	NC_005362	TTC	2	6	55700	55705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518131
1125	NC_005362	GTT	3	9	56005	56013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518132
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1129	NC_005362	AAAT	2	8	56174	56181	75 %	25 %	0 %	0 %	42518132
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1369	NC_005362	A	6	6	68629	68634	100 %	0 %	0 %	0 %	42518134
1370	NC_005362	AGA	2	6	68646	68651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518134
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1376	NC_005362	A	6	6	68852	68857	100 %	0 %	0 %	0 %	42518135
1377	NC_005362	GGA	2	6	68865	68870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518135
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1381	NC_005362	T	6	6	69025	69030	0 %	100 %	0 %	0 %	42518135
1382	NC_005362	GCTG	2	8	69156	69163	0 %	25 %	50 %	25 %	42518135
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1384	NC_005362	ATT	2	6	69225	69230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518135
1385	NC_005362	TGA	3	9	69295	69303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518135
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1389	NC_005362	AAT	2	6	69471	69476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518135
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