MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 40435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_005362	TGA	2	6	520854	520859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518570
10502	NC_005362	AGA	2	6	520897	520902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518570
10503	NC_005362	AATT	2	8	520914	520921	50 %	50 %	0 %	0 %	42518570
10504	NC_005362	TTG	3	9	520926	520934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518570
10505	NC_005362	AGTT	2	8	520941	520948	25 %	50 %	25 %	0 %	42518570
10506	NC_005362	GTG	2	6	521010	521015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518570
10507	NC_005362	ACA	2	6	521083	521088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518570
10508	NC_005362	CGT	2	6	521177	521182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518570
10509	NC_005362	TGCA	2	8	521220	521227	25 %	25 %	25 %	25 %	42518570
10510	NC_005362	TACTCA	2	12	521248	521259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518570
10511	NC_005362	TTAC	2	8	521287	521294	25 %	50 %	0 %	25 %	42518570
10512	NC_005362	AAGA	2	8	521327	521334	75 %	0 %	25 %	0 %	42518570
10513	NC_005362	AGTT	2	8	521352	521359	25 %	50 %	25 %	0 %	42518570
10514	NC_005362	GAA	2	6	521375	521380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518570
10515	NC_005362	ATT	2	6	521440	521445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518570
10516	NC_005362	GTT	2	6	521474	521479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518570
10517	NC_005362	TGG	2	6	521509	521514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518570
10518	NC_005362	AC	3	6	521516	521521	50 %	0 %	0 %	50 %	42518570
10519	NC_005362	CTG	2	6	521568	521573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518570
10520	NC_005362	ATT	2	6	521594	521599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518570
10521	NC_005362	AAG	2	6	521655	521660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518570
10522	NC_005362	TAA	2	6	521701	521706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518570
10523	NC_005362	TCT	2	6	521711	521716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518570
10524	NC_005362	GAT	2	6	521723	521728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518570
10525	NC_005362	AAG	2	6	521745	521750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518570
10526	NC_005362	TAA	2	6	521773	521778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518570
10527	NC_005362	TGC	2	6	521836	521841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518570
10528	NC_005362	ATGA	2	8	521861	521868	50 %	25 %	25 %	0 %	42518570
10529	NC_005362	AGC	2	6	521897	521902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518570
10530	NC_005362	GCT	2	6	521927	521932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518570
10531	NC_005362	GAT	2	6	521969	521974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518570
10532	NC_005362	CTG	2	6	522018	522023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518570
10533	NC_005362	TGG	3	9	522034	522042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518570
10534	NC_005362	GGT	2	6	522044	522049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518570
10535	NC_005362	GGT	2	6	522074	522079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518570
10536	NC_005362	CAG	2	6	522087	522092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518570
10537	NC_005362	AAG	2	6	522123	522128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518570
10538	NC_005362	GAA	2	6	522131	522136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518570
10539	NC_005362	TAT	2	6	522199	522204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518571
10540	NC_005362	TTG	2	6	522327	522332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518571
10541	NC_005362	TTAC	2	8	522334	522341	25 %	50 %	0 %	25 %	42518571
10542	NC_005362	AT	3	6	522358	522363	50 %	50 %	0 %	0 %	42518571
10543	NC_005362	ATG	2	6	522375	522380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518571
10544	NC_005362	TGA	2	6	522409	522414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518571
10545	NC_005362	ATT	2	6	522416	522421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518571
10546	NC_005362	ATAA	2	8	522453	522460	75 %	25 %	0 %	0 %	42518571
10547	NC_005362	CGGT	2	8	522494	522501	0 %	25 %	50 %	25 %	42518572
10548	NC_005362	AAGT	2	8	522564	522571	50 %	25 %	25 %	0 %	42518572
10549	NC_005362	AGA	2	6	522595	522600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518572
10550	NC_005362	ATG	2	6	522614	522619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518572
10551	NC_005362	ATGG	2	8	522652	522659	25 %	25 %	50 %	0 %	42518572
10552	NC_005362	TAG	2	6	522660	522665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518572
10553	NC_005362	AGAA	2	8	522678	522685	75 %	0 %	25 %	0 %	42518572
10554	NC_005362	GAAA	2	8	522708	522715	75 %	0 %	25 %	0 %	42518572
10555	NC_005362	ACCT	2	8	522722	522729	25 %	25 %	0 %	50 %	42518572
10556	NC_005362	TTA	2	6	522732	522737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518572
10557	NC_005362	GAA	2	6	522784	522789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518572
10558	NC_005362	A	7	7	522816	522822	100 %	0 %	0 %	0 %	42518572
10559	NC_005362	GCT	2	6	522838	522843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518572
10560	NC_005362	A	6	6	522900	522905	100 %	0 %	0 %	0 %	42518573
10561	NC_005362	GAA	2	6	522962	522967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518573
10562	NC_005362	CAG	2	6	523032	523037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518573
10563	NC_005362	GAT	3	9	523049	523057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518573
10564	NC_005362	ATG	2	6	523080	523085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518573
10565	NC_005362	CAGATG	2	12	523086	523097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	42518573
10566	NC_005362	GAT	3	9	523133	523141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518573
10567	NC_005362	GCG	2	6	523197	523202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42518573
10568	NC_005362	AAT	2	6	523203	523208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518573
10569	NC_005362	T	6	6	523273	523278	0 %	100 %	0 %	0 %	42518574
10570	NC_005362	TTA	2	6	523283	523288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518574
10571	NC_005362	TTG	2	6	523300	523305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518574
10572	NC_005362	GTG	2	6	523323	523328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518574
10573	NC_005362	AGC	2	6	523345	523350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518574
10574	NC_005362	TGG	2	6	523351	523356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518574
10575	NC_005362	ATCC	2	8	523431	523438	25 %	25 %	0 %	50 %	42518574
10576	NC_005362	AGC	2	6	523451	523456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518574
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10578	NC_005362	GCA	2	6	523508	523513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518574
10579	NC_005362	ATT	2	6	523526	523531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518574
10580	NC_005362	TTG	2	6	523532	523537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518574
10581	NC_005362	TTGT	2	8	523539	523546	0 %	75 %	25 %	0 %	42518574
10582	NC_005362	ATT	2	6	523631	523636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518574
10583	NC_005362	ATG	2	6	523698	523703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518574
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10585	NC_005362	ACA	2	6	523796	523801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518574
10586	NC_005362	AT	3	6	523845	523850	50 %	50 %	0 %	0 %	42518575
10587	NC_005362	ATT	2	6	523861	523866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518575
10588	NC_005362	AGT	2	6	523957	523962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518575
10589	NC_005362	TGA	2	6	523968	523973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518575
10590	NC_005362	A	7	7	523977	523983	100 %	0 %	0 %	0 %	42518575
10591	NC_005362	GAA	2	6	524107	524112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518575
10592	NC_005362	CTTAG	2	10	524134	524143	20 %	40 %	20 %	20 %	42518575
10593	NC_005362	CTG	2	6	524165	524170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518575
10594	NC_005362	AGA	2	6	524175	524180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518575
10595	NC_005362	A	6	6	524207	524212	100 %	0 %	0 %	0 %	42518575
10596	NC_005362	AGA	2	6	524235	524240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518575
10597	NC_005362	AAG	2	6	524248	524253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518575
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10599	NC_005362	ATGA	2	8	524362	524369	50 %	25 %	25 %	0 %	42518575
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10603	NC_005362	AATTG	2	10	524601	524610	40 %	40 %	20 %	0 %	42518575
10604	NC_005362	GTAT	2	8	524624	524631	25 %	50 %	25 %	0 %	42518575
10605	NC_005362	A	6	6	524643	524648	100 %	0 %	0 %	0 %	42518575
10606	NC_005362	A	6	6	524788	524793	100 %	0 %	0 %	0 %	42518575
10607	NC_005362	GTT	2	6	524794	524799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518575
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10609	NC_005362	GGT	2	6	524860	524865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518575
10610	NC_005362	GCT	2	6	524892	524897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518575
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10617	NC_005362	GAA	2	6	525115	525120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518575
10618	NC_005362	GAT	2	6	525148	525153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518575
10619	NC_005362	TAC	2	6	525183	525188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518575
10620	NC_005362	AC	3	6	525187	525192	50 %	0 %	0 %	50 %	42518575
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10622	NC_005362	TGA	2	6	525377	525382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518575
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10627	NC_005362	TGA	2	6	525573	525578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518575
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10727	NC_005362	TTTG	2	8	530306	530313	0 %	75 %	25 %	0 %	42518580
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