MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 40435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_005362	TCG	2	6	298810	298815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518352
6002	NC_005362	AAT	2	6	298869	298874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518352
6003	NC_005362	GTA	2	6	298996	299001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518352
6004	NC_005362	TATC	2	8	299003	299010	25 %	50 %	0 %	25 %	42518352
6005	NC_005362	ATTTAA	2	12	299056	299067	50 %	50 %	0 %	0 %	42518352
6006	NC_005362	TATG	2	8	299089	299096	25 %	50 %	25 %	0 %	42518352
6007	NC_005362	AAC	2	6	299196	299201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518353
6008	NC_005362	AATT	2	8	299244	299251	50 %	50 %	0 %	0 %	42518353
6009	NC_005362	TTA	2	6	299273	299278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518353
6010	NC_005362	TTC	2	6	299357	299362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518353
6011	NC_005362	GAA	2	6	299395	299400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518353
6012	NC_005362	TTA	2	6	299479	299484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518353
6013	NC_005362	CAA	2	6	299489	299494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518353
6014	NC_005362	AGA	2	6	299506	299511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518353
6015	NC_005362	AGA	2	6	299524	299529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518353
6016	NC_005362	AGCT	2	8	299558	299565	25 %	25 %	25 %	25 %	42518353
6017	NC_005362	AAT	2	6	299575	299580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518353
6018	NC_005362	AG	3	6	299586	299591	50 %	0 %	50 %	0 %	42518353
6019	NC_005362	CTT	2	6	299646	299651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518353
6020	NC_005362	TAT	2	6	299681	299686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518353
6021	NC_005362	CAG	2	6	299699	299704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518353
6022	NC_005362	CTA	2	6	299731	299736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518353
6023	NC_005362	AAAT	2	8	299763	299770	75 %	25 %	0 %	0 %	42518353
6024	NC_005362	CAT	2	6	299791	299796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518353
6025	NC_005362	GGA	2	6	299799	299804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518353
6026	NC_005362	GAA	3	9	299869	299877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518353
6027	NC_005362	A	7	7	299876	299882	100 %	0 %	0 %	0 %	42518353
6028	NC_005362	AAGT	2	8	299891	299898	50 %	25 %	25 %	0 %	42518353
6029	NC_005362	AAT	2	6	300065	300070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518354
6030	NC_005362	GCA	2	6	300123	300128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518354
6031	NC_005362	TATCT	2	10	300149	300158	20 %	60 %	0 %	20 %	42518354
6032	NC_005362	TTA	3	9	300175	300183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
6033	NC_005362	TAT	2	6	300433	300438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
6034	NC_005362	ATT	2	6	300456	300461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
6035	NC_005362	TTAA	2	8	300468	300475	50 %	50 %	0 %	0 %	42518354
6036	NC_005362	ATT	2	6	300552	300557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
6037	NC_005362	AGC	2	6	300644	300649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518354
6038	NC_005362	AAT	2	6	300692	300697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518354
6039	NC_005362	TGG	2	6	300704	300709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518354
6040	NC_005362	ATT	2	6	300735	300740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
6041	NC_005362	TGCT	2	8	300826	300833	0 %	50 %	25 %	25 %	42518354
6042	NC_005362	TGC	2	6	300989	300994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518354
6043	NC_005362	GAT	2	6	301091	301096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518354
6044	NC_005362	TAC	2	6	301181	301186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518354
6045	NC_005362	TATT	2	8	301286	301293	25 %	75 %	0 %	0 %	42518354
6046	NC_005362	CAA	3	9	301306	301314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518354
6047	NC_005362	ATTT	2	8	301350	301357	25 %	75 %	0 %	0 %	42518354
6048	NC_005362	TAT	2	6	301359	301364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
6049	NC_005362	AAAG	2	8	301379	301386	75 %	0 %	25 %	0 %	42518354
6050	NC_005362	TGC	2	6	301409	301414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518354
6051	NC_005362	TATT	2	8	301435	301442	25 %	75 %	0 %	0 %	42518354
6052	NC_005362	TAT	2	6	301445	301450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518354
6053	NC_005362	TGG	2	6	301475	301480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518354
6054	NC_005362	TCT	2	6	301537	301542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518354
6055	NC_005362	CGG	2	6	301582	301587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42518354
6056	NC_005362	A	6	6	301603	301608	100 %	0 %	0 %	0 %	42518354
6057	NC_005362	AAG	2	6	301617	301622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518354
6058	NC_005362	AAG	2	6	301773	301778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518355
6059	NC_005362	AGA	2	6	301837	301842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518355
6060	NC_005362	TTC	2	6	301891	301896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518355
6061	NC_005362	GCAA	2	8	301920	301927	50 %	0 %	25 %	25 %	42518355
6062	NC_005362	CAA	2	6	301963	301968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518355
6063	NC_005362	TAA	2	6	301994	301999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518355
6064	NC_005362	TGT	2	6	302236	302241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518356
6065	NC_005362	A	6	6	302357	302362	100 %	0 %	0 %	0 %	42518356
6066	NC_005362	TGT	2	6	302467	302472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518356
6067	NC_005362	TAA	2	6	302569	302574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518356
6068	NC_005362	GGAT	2	8	302643	302650	25 %	25 %	50 %	0 %	42518356
6069	NC_005362	TTC	2	6	302735	302740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518356
6070	NC_005362	TTTA	2	8	302807	302814	25 %	75 %	0 %	0 %	42518356
6071	NC_005362	AGA	2	6	302836	302841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518356
6072	NC_005362	AGA	3	9	302887	302895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518356
6073	NC_005362	GCC	2	6	303030	303035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42518356
6074	NC_005362	ATG	2	6	303048	303053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518356
6075	NC_005362	GAA	2	6	303109	303114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518356
6076	NC_005362	GAT	2	6	303140	303145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518356
6077	NC_005362	TGG	2	6	303214	303219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518356
6078	NC_005362	AGCT	2	8	303292	303299	25 %	25 %	25 %	25 %	42518356
6079	NC_005362	ATT	2	6	303311	303316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518356
6080	NC_005362	ATG	2	6	303357	303362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518356
6081	NC_005362	TTG	2	6	303366	303371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518356
6082	NC_005362	CAG	2	6	303381	303386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518356
6083	NC_005362	TAT	2	6	303398	303403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518356
6084	NC_005362	TGAT	2	8	303426	303433	25 %	50 %	25 %	0 %	42518356
6085	NC_005362	AGGA	2	8	303525	303532	50 %	0 %	50 %	0 %	42518356
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6088	NC_005362	CTG	2	6	303696	303701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518357
6089	NC_005362	ATTCA	2	10	303744	303753	40 %	40 %	0 %	20 %	42518357
6090	NC_005362	TAT	3	9	303757	303765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518357
6091	NC_005362	AAG	2	6	303798	303803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518357
6092	NC_005362	GTT	2	6	303805	303810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518357
6093	NC_005362	TGA	2	6	303823	303828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
6094	NC_005362	AGT	2	6	303844	303849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
6095	NC_005362	AAAC	2	8	303890	303897	75 %	0 %	0 %	25 %	42518357
6096	NC_005362	ATGA	2	8	304127	304134	50 %	25 %	25 %	0 %	42518357
6097	NC_005362	TAATT	2	10	304174	304183	40 %	60 %	0 %	0 %	42518357
6098	NC_005362	TGA	2	6	304297	304302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
6099	NC_005362	GCT	2	6	304337	304342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518357
6100	NC_005362	GAT	2	6	304624	304629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
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6102	NC_005362	TGA	2	6	304648	304653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518357
6103	NC_005362	TAA	2	6	304684	304689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518357
6104	NC_005362	GAA	2	6	304733	304738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518357
6105	NC_005362	CTT	2	6	304748	304753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518357
6106	NC_005362	ATT	2	6	304758	304763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518357
6107	NC_005362	GATT	2	8	304768	304775	25 %	50 %	25 %	0 %	42518357
6108	NC_005362	GTAAAA	2	12	304820	304831	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42518357
6109	NC_005362	TAA	2	6	304873	304878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518357
6110	NC_005362	GTG	2	6	304905	304910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518357
6111	NC_005362	ATC	2	6	304929	304934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518357
6112	NC_005362	GGT	2	6	304955	304960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518357
6113	NC_005362	A	6	6	304985	304990	100 %	0 %	0 %	0 %	42518357
6114	NC_005362	AAT	2	6	305068	305073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518358
6115	NC_005362	AGTTGA	2	12	305098	305109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518358
6116	NC_005362	CAA	2	6	305186	305191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518358
6117	NC_005362	TGG	2	6	305221	305226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518358
6118	NC_005362	GAT	2	6	305315	305320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518358
6119	NC_005362	CA	3	6	305377	305382	50 %	0 %	0 %	50 %	42518358
6120	NC_005362	TGA	2	6	305383	305388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518358
6121	NC_005362	GGA	2	6	305416	305421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518358
6122	NC_005362	GTA	2	6	305458	305463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518359
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6124	NC_005362	TTTTAG	2	12	305678	305689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42518359
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6494	NC_005362	ATCT	2	8	322321	322328	25 %	50 %	0 %	25 %	42518371
6495	NC_005362	GGA	2	6	322339	322344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	42518371
6496	NC_005362	TAT	3	9	322380	322388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518371
6497	NC_005362	TAT	2	6	322400	322405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518371
6498	NC_005362	A	6	6	322441	322446	100 %	0 %	0 %	0 %	42518371
6499	NC_005362	GTT	2	6	322477	322482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518371
6500	NC_005362	ATATGT	2	12	322526	322537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42518371

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